More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1989 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  100 
 
 		 496 aa  1021    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  64.3 
 
 		 495 aa  626  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  61.22 
 
 		 493 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  60.61 
 
 		 493 aa  609  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  58.22 
 
 		 498 aa  590  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  58.42 
 
 		 499 aa  589  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  56.5 
 
 		 505 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  51.93 
 
 		 498 aa  542  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  51.02 
 
 		 502 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  50.82 
 
 		 496 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  50.51 
 
 		 498 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2036  xylulokinase  52.45 
 
 		 496 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  49.38 
 
 		 510 aa  471  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  45.25 
 
 		 497 aa  426  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  35.25 
 
 		 518 aa  290  4e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  34.74 
 
 		 500 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  36.18 
 
 		 509 aa  281  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  33.74 
 
 		 489 aa  280  6e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  36.44 
 
 		 496 aa  276  6e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  34.15 
 
 		 500 aa  272  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  35.25 
 
 		 512 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  33.4 
 
 		 501 aa  270  4e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  33.13 
 
 		 492 aa  268  2e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  33.13 
 
 		 492 aa  268  2e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  34.8 
 
 		 502 aa  266  5e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04580  D-xylulose kinase  37.64 
 
 		 469 aa  266  8.999999999999999e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.399313 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  34.91 
 
 		 511 aa  262  1e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  36.13 
 
 		 504 aa  261  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  37.18 
 
 		 499 aa  258  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0151  xylulokinase  36.16 
 
 		 463 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  34.12 
 
 		 515 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  33 
 
 		 509 aa  251  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  33.61 
 
 		 499 aa  250  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  35.34 
 
 		 506 aa  250  4e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0354  xylulokinase  36.67 
 
 		 458 aa  250  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  33 
 
 		 484 aa  249  9e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  33.27 
 
 		 484 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3397  xylulokinase  35.73 
 
 		 465 aa  247  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0992186  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  35.25 
 
 		 498 aa  246  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  34.41 
 
 		 490 aa  245  9.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  31.86 
 
 		 509 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1604  xylulokinase  36.65 
 
 		 464 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.952022  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  31.59 
 
 		 484 aa  242  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1386  xylulokinase  35.87 
 
 		 461 aa  242  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2788  xylulokinase  37.09 
 
 		 493 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2832  xylulokinase  37.09 
 
 		 493 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  31.63 
 
 		 484 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  31.79 
 
 		 483 aa  240  4e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  31.79 
 
 		 483 aa  240  5e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  31.79 
 
 		 489 aa  240  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  34.47 
 
 		 496 aa  239  5.999999999999999e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  32.86 
 
 		 478 aa  239  8e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3972  xylulokinase  35.04 
 
 		 480 aa  238  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0262091 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06200  D-xylulose kinase  33.41 
 
 		 492 aa  237  3e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6686  xylulokinase  34.97 
 
 		 460 aa  237  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.433412 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4038  xylulokinase  34.91 
 
 		 465 aa  236  7e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1177  xylulose kinase  33.81 
 
 		 478 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2839  xylulokinase  33.81 
 
 		 478 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  33.01 
 
 		 485 aa  234  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  34.77 
 
 		 511 aa  234  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  33.06 
 
 		 505 aa  234  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  33.67 
 
 		 488 aa  234  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1261  xylulokinase  33.33 
 
 		 482 aa  233  6e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501532 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  31.93 
 
 		 485 aa  232  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  34.54 
 
 		 517 aa  232  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  34.31 
 
 		 517 aa  231  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2431  xylulokinase  33.48 
 
 		 475 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2065  xylulokinase  33.63 
 
 		 479 aa  229  7e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2815  xylulokinase  36.66 
 
 		 493 aa  229  9e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0161746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  36.92 
 
 		 483 aa  229  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01700  D-xylulose kinase  32.94 
 
 		 463 aa  229  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2828  xylulokinase  31.83 
 
 		 490 aa  228  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  31.99 
 
 		 511 aa  228  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0028  xylulokinase  32.6 
 
 		 483 aa  225  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.237536  normal  0.287388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2519  xylulokinase  32.21 
 
 		 465 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.606613  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2564  xylulokinase  32.21 
 
 		 465 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  33.4 
 
 		 484 aa  225  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3253  xylulokinase  34.96 
 
 		 464 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.100272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2556  xylulokinase  32.21 
 
 		 465 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  34.67 
 
 		 493 aa  224  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  35.06 
 
 		 493 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0467  xylulokinase  33.41 
 
 		 480 aa  222  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  30.91 
 
 		 496 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  32.72 
 
 		 503 aa  221  1.9999999999999999e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  36.24 
 
 		 494 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1997  xylose kinase  32.66 
 
 		 480 aa  221  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0574625  normal  0.349837 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  33.33 
 
 		 499 aa  220  5e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1886  Xylulose kinase  32.78 
 
 		 506 aa  220  6e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.0000234527  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  34.91 
 
 		 493 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  34.91 
 
 		 493 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  34.91 
 
 		 493 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4755  xylulokinase  33.05 
 
 		 495 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  34.91 
 
 		 493 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  35.07 
 
 		 493 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1796  xylulokinase  33.78 
 
 		 460 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0338276  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  35.38 
 
 		 491 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  37.08 
 
 		 508 aa  216  5e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3591  xylulokinase  34.15 
 
 		 486 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  34.43 
 
 		 493 aa  216  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  34.43 
 
 		 493 aa  216  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>