More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0467 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0467  xylulokinase  100 
 
 		 480 aa  950    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06200  D-xylulose kinase  65.42 
 
 		 492 aa  607  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3397  xylulokinase  62.32 
 
 		 465 aa  568  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0992186  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0644  xylulokinase  63.05 
 
 		 480 aa  538  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632042  normal  0.0960286 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2065  xylulokinase  60 
 
 		 479 aa  537  1e-151  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0151  xylulokinase  58.4 
 
 		 463 aa  525  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2828  xylulokinase  59.47 
 
 		 490 aa  523  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3972  xylulokinase  58.61 
 
 		 480 aa  512  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0262091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0354  xylulokinase  59.08 
 
 		 458 aa  514  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4038  xylulokinase  58.46 
 
 		 465 aa  512  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1425  xylulokinase  62.39 
 
 		 466 aa  511  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.741435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1261  xylulokinase  57.77 
 
 		 482 aa  506  9.999999999999999e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501532 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3591  xylulokinase  59.47 
 
 		 486 aa  502  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1796  xylulokinase  58.74 
 
 		 460 aa  494  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0338276  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2431  xylulokinase  59.53 
 
 		 475 aa  492  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1886  Xylulose kinase  54.35 
 
 		 506 aa  489  1e-137  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.0000234527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6686  xylulokinase  59.54 
 
 		 460 aa  490  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.433412 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2984  xylulokinase  60.87 
 
 		 482 aa  491  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.765011  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2519  xylulokinase  57.26 
 
 		 465 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.606613  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2556  xylulokinase  57.26 
 
 		 465 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2564  xylulokinase  57.26 
 
 		 465 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1604  xylulokinase  56.37 
 
 		 464 aa  479  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.952022  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3306  xylulokinase  58.92 
 
 		 479 aa  477  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0167704 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4666  xylulokinase  55.53 
 
 		 505 aa  467  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114264  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4755  xylulokinase  52.45 
 
 		 495 aa  464  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2176  xylulokinase  60.44 
 
 		 472 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000507955 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5296  xylulokinase  55.32 
 
 		 464 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714705  normal  0.049694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1386  xylulokinase  53.25 
 
 		 461 aa  451  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3253  xylulokinase  52.94 
 
 		 464 aa  439  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.100272 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04580  D-xylulose kinase  54.85 
 
 		 469 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.399313 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01700  D-xylulose kinase  51.37 
 
 		 463 aa  419  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7020  carbohydrate kinase FGGY  37.59 
 
 		 540 aa  274  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2788  xylulokinase  42.65 
 
 		 493 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2832  xylulokinase  42.65 
 
 		 493 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2815  xylulokinase  42.24 
 
 		 493 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0161746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  37.39 
 
 		 495 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  36.96 
 
 		 498 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  34.77 
 
 		 498 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  34.06 
 
 		 496 aa  229  6e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  36.07 
 
 		 499 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  34.76 
 
 		 510 aa  228  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  35.24 
 
 		 493 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  35.06 
 
 		 493 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  34.26 
 
 		 498 aa  224  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2036  xylulokinase  36.5 
 
 		 496 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  35.13 
 
 		 502 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  33.62 
 
 		 505 aa  217  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  35.42 
 
 		 496 aa  216  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  33.99 
 
 		 497 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  30.54 
 
 		 496 aa  187  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  29.35 
 
 		 518 aa  177  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  29.85 
 
 		 500 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  28.51 
 
 		 492 aa  168  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  28.51 
 
 		 492 aa  168  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  28.41 
 
 		 490 aa  168  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  31.37 
 
 		 483 aa  165  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  31.91 
 
 		 498 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  28.85 
 
 		 501 aa  159  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  31.3 
 
 		 484 aa  158  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  31.85 
 
 		 512 aa  157  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  30.63 
 
 		 488 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  27.17 
 
 		 489 aa  155  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  30.23 
 
 		 499 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  26.5 
 
 		 500 aa  153  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  29.78 
 
 		 484 aa  152  8.999999999999999e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  30 
 
 		 499 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  30.77 
 
 		 492 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  30.5 
 
 		 493 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  29.84 
 
 		 493 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  31.22 
 
 		 485 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  30.21 
 
 		 504 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4385  xylulokinase  31.78 
 
 		 488 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  29.96 
 
 		 484 aa  150  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  31.01 
 
 		 493 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  31.78 
 
 		 488 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  31.01 
 
 		 493 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  31.78 
 
 		 488 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  31.01 
 
 		 493 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  30.65 
 
 		 496 aa  150  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  29.96 
 
 		 484 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  28.35 
 
 		 494 aa  150  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  30 
 
 		 493 aa  150  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  30.22 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  26.92 
 
 		 509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  30.84 
 
 		 515 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  30.25 
 
 		 493 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  28.41 
 
 		 486 aa  147  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  26.86 
 
 		 496 aa  147  6e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  30.23 
 
 		 483 aa  146  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  29.77 
 
 		 492 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  30.59 
 
 		 493 aa  146  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  29.72 
 
 		 493 aa  146  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  30.71 
 
 		 492 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  30.71 
 
 		 492 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  26.47 
 
 		 496 aa  145  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  29.61 
 
 		 484 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  31.41 
 
 		 491 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  29.61 
 
 		 484 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  30.72 
 
 		 508 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  29.61 
 
 		 484 aa  144  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>