More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5296 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2519  xylulokinase  76.67 
 
 		 465 aa  675    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.606613  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2564  xylulokinase  76.67 
 
 		 465 aa  675    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5296  xylulokinase  100 
 
 		 464 aa  918    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714705  normal  0.049694 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2556  xylulokinase  76.46 
 
 		 465 aa  672    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0151  xylulokinase  62.26 
 
 		 463 aa  543  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3397  xylulokinase  61.47 
 
 		 465 aa  540  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0992186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0354  xylulokinase  61.52 
 
 		 458 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2065  xylulokinase  60.22 
 
 		 479 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4038  xylulokinase  61.64 
 
 		 465 aa  513  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06200  D-xylulose kinase  58.39 
 
 		 492 aa  506  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1386  xylulokinase  59.96 
 
 		 461 aa  489  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6686  xylulokinase  60.83 
 
 		 460 aa  475  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.433412 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3972  xylulokinase  57.96 
 
 		 480 aa  476  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0262091 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0644  xylulokinase  59.24 
 
 		 480 aa  474  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632042  normal  0.0960286 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2984  xylulokinase  61.81 
 
 		 482 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.765011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4755  xylulokinase  55.19 
 
 		 495 aa  470  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2431  xylulokinase  57.57 
 
 		 475 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1796  xylulokinase  58.75 
 
 		 460 aa  470  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0338276  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1604  xylulokinase  56.96 
 
 		 464 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.952022  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3591  xylulokinase  59.06 
 
 		 486 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1261  xylulokinase  56.65 
 
 		 482 aa  464  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501532 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0467  xylulokinase  55.32 
 
 		 480 aa  457  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3253  xylulokinase  56.24 
 
 		 464 aa  456  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.100272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4666  xylulokinase  55.87 
 
 		 505 aa  455  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114264  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3306  xylulokinase  57.95 
 
 		 479 aa  443  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0167704 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2176  xylulokinase  57.96 
 
 		 472 aa  434  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000507955 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04580  D-xylulose kinase  57.74 
 
 		 469 aa  432  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.399313 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2828  xylulokinase  51.85 
 
 		 490 aa  432  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1425  xylulokinase  54.96 
 
 		 466 aa  429  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.741435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1886  Xylulose kinase  47 
 
 		 506 aa  420  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.0000234527  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01700  D-xylulose kinase  48.47 
 
 		 463 aa  373  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7020  carbohydrate kinase FGGY  42.29 
 
 		 540 aa  276  8e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2788  xylulokinase  42.13 
 
 		 493 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2832  xylulokinase  42.13 
 
 		 493 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2815  xylulokinase  42.13 
 
 		 493 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0161746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2036  xylulokinase  39.07 
 
 		 496 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  38.08 
 
 		 496 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  38.31 
 
 		 502 aa  237  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  35.24 
 
 		 510 aa  234  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  33.93 
 
 		 498 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  36.08 
 
 		 493 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  35.12 
 
 		 495 aa  230  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  33.6 
 
 		 493 aa  229  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  34.53 
 
 		 498 aa  220  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  34.14 
 
 		 499 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  34.5 
 
 		 498 aa  219  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  31.69 
 
 		 496 aa  216  5.9999999999999996e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  31.57 
 
 		 505 aa  212  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  32.82 
 
 		 497 aa  186  5e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  29.21 
 
 		 518 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  27.11 
 
 		 492 aa  167  5e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  27.11 
 
 		 492 aa  167  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  29.66 
 
 		 496 aa  166  8e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  27.8 
 
 		 501 aa  159  7e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  32.82 
 
 		 483 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  30.04 
 
 		 492 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  32.45 
 
 		 493 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  31.59 
 
 		 494 aa  154  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  31.77 
 
 		 493 aa  153  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  32.14 
 
 		 512 aa  154  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  32.04 
 
 		 493 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  30.14 
 
 		 499 aa  152  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  32.21 
 
 		 484 aa  152  8.999999999999999e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  33.56 
 
 		 488 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  31.93 
 
 		 498 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  32.66 
 
 		 493 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  31 
 
 		 484 aa  150  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3071  xylulokinase  33.96 
 
 		 488 aa  151  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  31 
 
 		 484 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  26.93 
 
 		 509 aa  150  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  27.68 
 
 		 500 aa  149  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  29.78 
 
 		 499 aa  149  8e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  32.32 
 
 		 493 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  32.69 
 
 		 491 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  30.79 
 
 		 484 aa  149  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  32.32 
 
 		 493 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  32.32 
 
 		 493 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  29.41 
 
 		 511 aa  148  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  32.1 
 
 		 486 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  32.89 
 
 		 490 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  32.89 
 
 		 490 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  31.41 
 
 		 493 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  32.89 
 
 		 490 aa  147  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  32.89 
 
 		 490 aa  147  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4385  xylulokinase  33.1 
 
 		 488 aa  146  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  32.55 
 
 		 488 aa  146  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  32.55 
 
 		 488 aa  146  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  26.7 
 
 		 502 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1173  xylulokinase  34.69 
 
 		 486 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000934305  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  25.68 
 
 		 489 aa  144  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  32.67 
 
 		 493 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  32.67 
 
 		 493 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  32.67 
 
 		 493 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  31.46 
 
 		 484 aa  143  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  31.39 
 
 		 493 aa  143  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  30.07 
 
 		 484 aa  143  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  31.46 
 
 		 484 aa  142  9e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  31.46 
 
 		 484 aa  142  9e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  31.46 
 
 		 484 aa  142  9e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  30.07 
 
 		 484 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>