More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_27320 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  64.3 
 
 
496 aa  647    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  100 
 
 
495 aa  996    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  60.82 
 
 
499 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  58.82 
 
 
493 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  59.23 
 
 
493 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  57.81 
 
 
498 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  56.62 
 
 
498 aa  558  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  54.3 
 
 
505 aa  533  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  56.53 
 
 
502 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  56.53 
 
 
496 aa  528  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  54.84 
 
 
498 aa  512  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2036  xylulokinase  55.51 
 
 
496 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  47.42 
 
 
510 aa  446  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  45.95 
 
 
497 aa  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  36.38 
 
 
518 aa  286  8e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  39 
 
 
509 aa  283  5.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  33.73 
 
 
500 aa  278  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04580  D-xylulose kinase  41.61 
 
 
469 aa  277  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.399313 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  32.99 
 
 
492 aa  272  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  32.99 
 
 
492 aa  272  1e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0151  xylulokinase  39.88 
 
 
463 aa  271  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  33.93 
 
 
502 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  38.97 
 
 
499 aa  264  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  37.4 
 
 
512 aa  263  6.999999999999999e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  30.53 
 
 
489 aa  261  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06200  D-xylulose kinase  36.42 
 
 
492 aa  260  4e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3397  xylulokinase  37.91 
 
 
465 aa  259  9e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0992186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0354  xylulokinase  39.91 
 
 
458 aa  259  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267797  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1604  xylulokinase  37.3 
 
 
464 aa  258  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.952022  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  33.54 
 
 
500 aa  257  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  33.13 
 
 
501 aa  257  3e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1386  xylulokinase  37.42 
 
 
461 aa  257  4e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  35.35 
 
 
499 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  35.87 
 
 
484 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2176  xylulokinase  38.48 
 
 
472 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000507955 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  35.31 
 
 
496 aa  250  4e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3972  xylulokinase  38.77 
 
 
480 aa  246  6e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0262091 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  34.6 
 
 
511 aa  246  6e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  32.27 
 
 
509 aa  246  6.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3253  xylulokinase  38.08 
 
 
464 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.100272 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  39.24 
 
 
504 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  34.48 
 
 
489 aa  244  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2519  xylulokinase  37.44 
 
 
465 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.606613  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2564  xylulokinase  37.44 
 
 
465 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396668  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2431  xylulokinase  36.69 
 
 
475 aa  243  7e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6686  xylulokinase  39.09 
 
 
460 aa  243  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.433412 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0467  xylulokinase  36.88 
 
 
480 aa  242  1e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  38.39 
 
 
506 aa  241  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  32.67 
 
 
484 aa  242  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2065  xylulokinase  36.36 
 
 
479 aa  241  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  32.38 
 
 
496 aa  241  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1261  xylulokinase  36.77 
 
 
482 aa  241  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501532 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2556  xylulokinase  37 
 
 
465 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  34.62 
 
 
484 aa  240  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  35.57 
 
 
478 aa  239  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  33.47 
 
 
488 aa  238  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  38.9 
 
 
492 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  38.9 
 
 
492 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  33.13 
 
 
483 aa  236  9e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  33.13 
 
 
483 aa  236  9e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1796  xylulokinase  38 
 
 
460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0338276  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  40.5 
 
 
492 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  34.4 
 
 
484 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  32.6 
 
 
515 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4755  xylulokinase  37.69 
 
 
495 aa  233  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2788  xylulokinase  38.32 
 
 
493 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  36.2 
 
 
511 aa  233  5e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2832  xylulokinase  38.32 
 
 
493 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0644  xylulokinase  36.76 
 
 
480 aa  233  6e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632042  normal  0.0960286 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1886  Xylulose kinase  35.62 
 
 
506 aa  233  9e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.0000234527  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  35.76 
 
 
482 aa  232  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4038  xylulokinase  37.11 
 
 
465 aa  232  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  36.29 
 
 
496 aa  231  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5296  xylulokinase  35.65 
 
 
464 aa  231  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714705  normal  0.049694 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  39.35 
 
 
492 aa  231  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  29.78 
 
 
509 aa  230  6e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  36.25 
 
 
498 aa  229  6e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  38.93 
 
 
483 aa  229  6e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  37.25 
 
 
493 aa  229  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  37.69 
 
 
493 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  38.36 
 
 
493 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  38.36 
 
 
493 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4666  xylulokinase  36.12 
 
 
505 aa  227  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114264  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4208  xylulokinase  40 
 
 
492 aa  227  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0365818  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1177  xylulose kinase  37.27 
 
 
478 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  34.76 
 
 
484 aa  226  9e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  35.39 
 
 
505 aa  226  9e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  31.46 
 
 
490 aa  226  9e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3591  xylulokinase  37.89 
 
 
486 aa  226  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2815  xylulokinase  38.58 
 
 
493 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0161746  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  37.47 
 
 
483 aa  225  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  31.39 
 
 
485 aa  225  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01700  D-xylulose kinase  36.24 
 
 
463 aa  224  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2839  xylulokinase  37.5 
 
 
478 aa  225  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  35.62 
 
 
511 aa  224  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3306  xylulokinase  37.25 
 
 
479 aa  224  4e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0167704 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  36.57 
 
 
493 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  37.47 
 
 
493 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  37.47 
 
 
493 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  39.37 
 
 
492 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>