More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0151 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0354  xylulokinase  77.46 
 
 		 458 aa  677    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267797  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0151  xylulokinase  100 
 
 		 463 aa  910    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2065  xylulokinase  69.49 
 
 		 479 aa  617  1e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3397  xylulokinase  69.48 
 
 		 465 aa  612  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0992186  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4038  xylulokinase  70.63 
 
 		 465 aa  601  1.0000000000000001e-171  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1604  xylulokinase  67.61 
 
 		 464 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.952022  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1796  xylulokinase  69.28 
 
 		 460 aa  570  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0338276  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2984  xylulokinase  70.46 
 
 		 482 aa  568  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.765011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6686  xylulokinase  70.04 
 
 		 460 aa  568  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.433412 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06200  D-xylulose kinase  64.18 
 
 		 492 aa  565  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3972  xylulokinase  65.39 
 
 		 480 aa  560  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0262091 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1261  xylulokinase  65.45 
 
 		 482 aa  558  1e-158  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4755  xylulokinase  63.54 
 
 		 495 aa  552  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3591  xylulokinase  66.88 
 
 		 486 aa  542  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2519  xylulokinase  63.36 
 
 		 465 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.606613  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2564  xylulokinase  63.36 
 
 		 465 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2556  xylulokinase  63.36 
 
 		 465 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1386  xylulokinase  64.91 
 
 		 461 aa  533  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0644  xylulokinase  62.58 
 
 		 480 aa  533  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632042  normal  0.0960286 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2431  xylulokinase  60.59 
 
 		 475 aa  524  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5296  xylulokinase  62.26 
 
 		 464 aa  519  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714705  normal  0.049694 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04580  D-xylulose kinase  65.36 
 
 		 469 aa  516  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.399313 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1425  xylulokinase  61.94 
 
 		 466 aa  509  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.741435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4666  xylulokinase  59.15 
 
 		 505 aa  507  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114264  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0467  xylulokinase  58.4 
 
 		 480 aa  503  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3253  xylulokinase  59.56 
 
 		 464 aa  483  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.100272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3306  xylulokinase  61.18 
 
 		 479 aa  484  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0167704 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2828  xylulokinase  54.9 
 
 		 490 aa  480  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2176  xylulokinase  60.26 
 
 		 472 aa  476  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000507955 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1886  Xylulose kinase  50.2 
 
 		 506 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.0000234527  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01700  D-xylulose kinase  54.17 
 
 		 463 aa  421  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7020  carbohydrate kinase FGGY  47.09 
 
 		 540 aa  340  2.9999999999999998e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2788  xylulokinase  46.44 
 
 		 493 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2832  xylulokinase  46.44 
 
 		 493 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2815  xylulokinase  46.44 
 
 		 493 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0161746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  38.09 
 
 		 510 aa  279  6e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  40.56 
 
 		 495 aa  259  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  38.03 
 
 		 498 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  38.19 
 
 		 493 aa  256  7e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  37.2 
 
 		 498 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  36.64 
 
 		 498 aa  251  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  36.96 
 
 		 493 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  36.16 
 
 		 496 aa  246  8e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  35.92 
 
 		 505 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  37.58 
 
 		 499 aa  243  5e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2036  xylulokinase  37.95 
 
 		 496 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  37.89 
 
 		 502 aa  226  8e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  37.67 
 
 		 496 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  35.21 
 
 		 497 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  34.47 
 
 		 496 aa  206  8e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  32.8 
 
 		 518 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  31.6 
 
 		 500 aa  194  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  29.84 
 
 		 490 aa  187  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  35.84 
 
 		 512 aa  186  6e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  28.69 
 
 		 489 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  34.52 
 
 		 484 aa  180  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  30.44 
 
 		 492 aa  179  8e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  30.44 
 
 		 492 aa  179  8e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  31.01 
 
 		 501 aa  176  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  33.56 
 
 		 496 aa  176  8e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  32.95 
 
 		 499 aa  176  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  33.48 
 
 		 515 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  32.88 
 
 		 498 aa  172  7.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  34.52 
 
 		 483 aa  172  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  32.63 
 
 		 486 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  34.63 
 
 		 488 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  31.21 
 
 		 511 aa  171  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  33.18 
 
 		 483 aa  171  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  34.36 
 
 		 484 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  30.89 
 
 		 496 aa  169  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  34.36 
 
 		 484 aa  169  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  32.61 
 
 		 492 aa  169  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  34.36 
 
 		 484 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  34.36 
 
 		 484 aa  169  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  34.36 
 
 		 484 aa  168  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  29.93 
 
 		 509 aa  168  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  34.12 
 
 		 484 aa  167  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  30.02 
 
 		 502 aa  166  9e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  36.23 
 
 		 493 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  36.23 
 
 		 493 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  36.23 
 
 		 493 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  34.95 
 
 		 493 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  32.46 
 
 		 509 aa  165  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  34.55 
 
 		 493 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  35.12 
 
 		 491 aa  164  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  33.9 
 
 		 493 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  33.18 
 
 		 484 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  34.55 
 
 		 493 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  33.09 
 
 		 504 aa  163  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  34.37 
 
 		 491 aa  162  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  33.25 
 
 		 484 aa  163  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  33.65 
 
 		 484 aa  162  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  33.25 
 
 		 484 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  32.49 
 
 		 492 aa  162  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  33.25 
 
 		 484 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4385  xylulokinase  33.41 
 
 		 488 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  33.41 
 
 		 488 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  33.41 
 
 		 488 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  34.51 
 
 		 486 aa  160  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  31.9 
 
 		 485 aa  160  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>