More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3306 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3306  xylulokinase  100 
 
 		 479 aa  914    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0167704 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2065  xylulokinase  63.49 
 
 		 479 aa  558  1e-158  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06200  D-xylulose kinase  63.58 
 
 		 492 aa  553  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0644  xylulokinase  65.35 
 
 		 480 aa  541  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632042  normal  0.0960286 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3972  xylulokinase  63.09 
 
 		 480 aa  533  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0262091 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0151  xylulokinase  61.39 
 
 		 463 aa  526  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2828  xylulokinase  58.62 
 
 		 490 aa  521  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0354  xylulokinase  61.26 
 
 		 458 aa  515  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4038  xylulokinase  63.1 
 
 		 465 aa  517  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3397  xylulokinase  60.88 
 
 		 465 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0992186  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1261  xylulokinase  61.51 
 
 		 482 aa  507  9.999999999999999e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6686  xylulokinase  62.58 
 
 		 460 aa  502  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.433412 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1796  xylulokinase  62.13 
 
 		 460 aa  499  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0338276  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0467  xylulokinase  58.92 
 
 		 480 aa  498  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3591  xylulokinase  62.27 
 
 		 486 aa  499  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2984  xylulokinase  64.8 
 
 		 482 aa  495  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.765011  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2431  xylulokinase  61.43 
 
 		 475 aa  491  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4666  xylulokinase  59.84 
 
 		 505 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114264  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1604  xylulokinase  58.95 
 
 		 464 aa  481  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.952022  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2519  xylulokinase  59.33 
 
 		 465 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.606613  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1386  xylulokinase  60.04 
 
 		 461 aa  480  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1425  xylulokinase  59.54 
 
 		 466 aa  481  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.741435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2556  xylulokinase  59.33 
 
 		 465 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2564  xylulokinase  59.33 
 
 		 465 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4755  xylulokinase  55.86 
 
 		 495 aa  473  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5296  xylulokinase  57.95 
 
 		 464 aa  464  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714705  normal  0.049694 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1886  Xylulose kinase  50.79 
 
 		 506 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.0000234527  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04580  D-xylulose kinase  58.79 
 
 		 469 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.399313 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2176  xylulokinase  62.56 
 
 		 472 aa  435  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000507955 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3253  xylulokinase  55.04 
 
 		 464 aa  432  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.100272 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01700  D-xylulose kinase  51.8 
 
 		 463 aa  382  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7020  carbohydrate kinase FGGY  42.56 
 
 		 540 aa  284  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2788  xylulokinase  44.03 
 
 		 493 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2832  xylulokinase  44.03 
 
 		 493 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2815  xylulokinase  43.6 
 
 		 493 aa  251  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0161746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2036  xylulokinase  38.26 
 
 		 496 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  38.09 
 
 		 498 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  37.58 
 
 		 495 aa  228  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  38.16 
 
 		 502 aa  226  9e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  37.72 
 
 		 496 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  35 
 
 		 510 aa  221  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  36.9 
 
 		 498 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  35.51 
 
 		 493 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  34.73 
 
 		 498 aa  216  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  35.65 
 
 		 499 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  33.26 
 
 		 505 aa  210  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  34.19 
 
 		 493 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  34.64 
 
 		 496 aa  207  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  30.63 
 
 		 492 aa  192  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  30.63 
 
 		 492 aa  192  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  34.28 
 
 		 497 aa  190  4e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  34.54 
 
 		 486 aa  189  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  36.17 
 
 		 512 aa  189  8e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  33.18 
 
 		 496 aa  186  7e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  34.74 
 
 		 499 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  30.92 
 
 		 500 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  32.17 
 
 		 501 aa  182  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  30.28 
 
 		 518 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  33.53 
 
 		 488 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  33.33 
 
 		 496 aa  179  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  36.99 
 
 		 484 aa  176  7e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  35.45 
 
 		 488 aa  176  9e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  36.19 
 
 		 483 aa  176  9e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  35.45 
 
 		 488 aa  176  9e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  32.13 
 
 		 484 aa  176  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4385  xylulokinase  34.74 
 
 		 488 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  33.4 
 
 		 509 aa  172  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  33.55 
 
 		 487 aa  172  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3071  xylulokinase  35.21 
 
 		 488 aa  170  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  33.94 
 
 		 498 aa  169  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  32.63 
 
 		 494 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  35.81 
 
 		 508 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  34.67 
 
 		 493 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  33.01 
 
 		 492 aa  166  5.9999999999999996e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  28.19 
 
 		 490 aa  166  6.9999999999999995e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  35.24 
 
 		 490 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  36.08 
 
 		 486 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  35.24 
 
 		 490 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  31.2 
 
 		 496 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  35 
 
 		 490 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  32.33 
 
 		 485 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  33.49 
 
 		 484 aa  164  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  35 
 
 		 490 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  34.43 
 
 		 493 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  33.97 
 
 		 483 aa  163  5.0000000000000005e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  35.05 
 
 		 493 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  34.67 
 
 		 493 aa  163  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  35.05 
 
 		 493 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  33.65 
 
 		 484 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  33.96 
 
 		 491 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  35.46 
 
 		 493 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  37.31 
 
 		 506 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  35.46 
 
 		 493 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  33.65 
 
 		 484 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  33.65 
 
 		 484 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  33.33 
 
 		 491 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  35.46 
 
 		 493 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  33.65 
 
 		 484 aa  162  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  31.39 
 
 		 483 aa  162  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  31.39 
 
 		 483 aa  162  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>