More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1604 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1604  xylulokinase  100 
 
 		 464 aa  912    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.952022  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0151  xylulokinase  67.61 
 
 		 463 aa  587  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0354  xylulokinase  67.46 
 
 		 458 aa  577  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3397  xylulokinase  64.22 
 
 		 465 aa  557  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0992186  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1386  xylulokinase  64.58 
 
 		 461 aa  548  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2065  xylulokinase  63.64 
 
 		 479 aa  536  1e-151  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6686  xylulokinase  64.52 
 
 		 460 aa  530  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.433412 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4038  xylulokinase  63.12 
 
 		 465 aa  523  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3972  xylulokinase  62.53 
 
 		 480 aa  521  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0262091 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04580  D-xylulose kinase  64.76 
 
 		 469 aa  521  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.399313 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3591  xylulokinase  63.87 
 
 		 486 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06200  D-xylulose kinase  59.46 
 
 		 492 aa  514  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1261  xylulokinase  60.17 
 
 		 482 aa  502  1e-141  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2984  xylulokinase  63.69 
 
 		 482 aa  504  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.765011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4755  xylulokinase  61.1 
 
 		 495 aa  501  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1796  xylulokinase  61.75 
 
 		 460 aa  491  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0338276  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2519  xylulokinase  58.71 
 
 		 465 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.606613  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2564  xylulokinase  58.71 
 
 		 465 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2556  xylulokinase  58.71 
 
 		 465 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0644  xylulokinase  60.13 
 
 		 480 aa  487  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632042  normal  0.0960286 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0467  xylulokinase  56.37 
 
 		 480 aa  475  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4666  xylulokinase  57.64 
 
 		 505 aa  475  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114264  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2431  xylulokinase  57.42 
 
 		 475 aa  478  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3253  xylulokinase  57.02 
 
 		 464 aa  476  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.100272 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2828  xylulokinase  54.6 
 
 		 490 aa  461  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1425  xylulokinase  56.87 
 
 		 466 aa  456  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.741435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5296  xylulokinase  56.96 
 
 		 464 aa  458  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714705  normal  0.049694 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3306  xylulokinase  58.95 
 
 		 479 aa  449  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0167704 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1886  Xylulose kinase  50.5 
 
 		 506 aa  444  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.0000234527  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2176  xylulokinase  58.76 
 
 		 472 aa  435  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000507955 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01700  D-xylulose kinase  53.35 
 
 		 463 aa  422  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7020  carbohydrate kinase FGGY  45.12 
 
 		 540 aa  348  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2788  xylulokinase  44.51 
 
 		 493 aa  282  9e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2832  xylulokinase  44.51 
 
 		 493 aa  282  9e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2815  xylulokinase  44.51 
 
 		 493 aa  277  4e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0161746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  37.55 
 
 		 498 aa  267  4e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  37.37 
 
 		 496 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  37.78 
 
 		 502 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  37.95 
 
 		 493 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  38.79 
 
 		 495 aa  253  6e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  38.74 
 
 		 498 aa  249  5e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  37.78 
 
 		 498 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  37.47 
 
 		 510 aa  247  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  36.18 
 
 		 493 aa  247  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2036  xylulokinase  38.38 
 
 		 496 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  36.47 
 
 		 496 aa  246  4.9999999999999997e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  37.67 
 
 		 499 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  34.3 
 
 		 505 aa  241  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  37.53 
 
 		 497 aa  230  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  32.05 
 
 		 500 aa  189  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  33.26 
 
 		 496 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  31.28 
 
 		 518 aa  183  6e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  31.59 
 
 		 492 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  30.28 
 
 		 492 aa  179  9e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  30.28 
 
 		 492 aa  179  9e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  35.24 
 
 		 498 aa  173  5.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  35.12 
 
 		 496 aa  173  6.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  31.67 
 
 		 483 aa  172  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  30.77 
 
 		 509 aa  170  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  32.36 
 
 		 512 aa  168  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  30.54 
 
 		 484 aa  167  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  32.16 
 
 		 484 aa  166  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  31.66 
 
 		 509 aa  166  9e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  30.41 
 
 		 488 aa  164  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  31.95 
 
 		 484 aa  164  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  29.12 
 
 		 486 aa  163  6e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  31.95 
 
 		 484 aa  163  7e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  31.86 
 
 		 499 aa  163  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  30.91 
 
 		 501 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  29.31 
 
 		 483 aa  162  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  34.6 
 
 		 491 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  34.81 
 
 		 492 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  26.71 
 
 		 489 aa  160  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  34.5 
 
 		 493 aa  160  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  34.95 
 
 		 492 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  34.5 
 
 		 493 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  31.74 
 
 		 485 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3807  xylulokinase  32.37 
 
 		 481 aa  157  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  32.26 
 
 		 505 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  32.86 
 
 		 492 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  32.86 
 
 		 492 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  30.58 
 
 		 492 aa  156  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  31.93 
 
 		 488 aa  156  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  33.13 
 
 		 486 aa  156  8e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  31.19 
 
 		 493 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  32.89 
 
 		 490 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  31.89 
 
 		 484 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  35 
 
 		 493 aa  156  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  33.41 
 
 		 493 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  32.86 
 
 		 493 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  32.89 
 
 		 490 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  31.89 
 
 		 484 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  31.89 
 
 		 484 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  30.57 
 
 		 487 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  32.89 
 
 		 490 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  31.89 
 
 		 484 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  32.89 
 
 		 490 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  31.89 
 
 		 484 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  31.63 
 
 		 484 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  30.97 
 
 		 483 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>