More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2431 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2431  xylulokinase  100 
 
 
475 aa  933    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2176  xylulokinase  73.52 
 
 
472 aa  596  1e-169  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000507955 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2065  xylulokinase  65.16 
 
 
479 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0151  xylulokinase  61.54 
 
 
463 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0354  xylulokinase  63.56 
 
 
458 aa  537  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267797  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06200  D-xylulose kinase  61.92 
 
 
492 aa  529  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1261  xylulokinase  62.17 
 
 
482 aa  523  1e-147  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501532 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3972  xylulokinase  63.42 
 
 
480 aa  523  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0262091 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0644  xylulokinase  63.27 
 
 
480 aa  520  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632042  normal  0.0960286 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3397  xylulokinase  59.79 
 
 
465 aa  518  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0992186  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1796  xylulokinase  62.53 
 
 
460 aa  508  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0338276  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3591  xylulokinase  65.54 
 
 
486 aa  495  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1425  xylulokinase  61.68 
 
 
466 aa  497  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.741435  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4038  xylulokinase  59.83 
 
 
465 aa  493  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4666  xylulokinase  59.76 
 
 
505 aa  489  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114264  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1386  xylulokinase  57.6 
 
 
461 aa  489  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1604  xylulokinase  57.42 
 
 
464 aa  483  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.952022  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2828  xylulokinase  58.8 
 
 
490 aa  482  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0467  xylulokinase  59.53 
 
 
480 aa  483  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4755  xylulokinase  59.72 
 
 
495 aa  481  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6686  xylulokinase  60.43 
 
 
460 aa  475  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.433412 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2984  xylulokinase  62.53 
 
 
482 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.765011  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2519  xylulokinase  57.91 
 
 
465 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.606613  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2556  xylulokinase  57.91 
 
 
465 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2564  xylulokinase  57.91 
 
 
465 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396668  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3306  xylulokinase  61.43 
 
 
479 aa  462  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0167704 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5296  xylulokinase  57.57 
 
 
464 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714705  normal  0.049694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3253  xylulokinase  56.29 
 
 
464 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.100272 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04580  D-xylulose kinase  57.38 
 
 
469 aa  437  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.399313 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1886  Xylulose kinase  49 
 
 
506 aa  422  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.0000234527  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01700  D-xylulose kinase  50.96 
 
 
463 aa  386  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7020  carbohydrate kinase FGGY  44.35 
 
 
540 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2788  xylulokinase  42.64 
 
 
493 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2832  xylulokinase  42.64 
 
 
493 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  37.33 
 
 
498 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2815  xylulokinase  42.98 
 
 
493 aa  253  7e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0161746  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  35.75 
 
 
510 aa  250  4e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  35.33 
 
 
493 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  36.49 
 
 
495 aa  240  5e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2036  xylulokinase  36.95 
 
 
496 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  35.81 
 
 
493 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  35.77 
 
 
498 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  33.48 
 
 
496 aa  232  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  37.36 
 
 
496 aa  230  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  37.36 
 
 
502 aa  229  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  35.33 
 
 
499 aa  229  8e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  33.12 
 
 
505 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  36.12 
 
 
498 aa  221  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  35.24 
 
 
497 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  31.51 
 
 
496 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  29.48 
 
 
500 aa  183  7e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  34.26 
 
 
512 aa  182  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  29.06 
 
 
489 aa  181  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  30.16 
 
 
518 aa  179  7e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  28.34 
 
 
500 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  34.08 
 
 
499 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  32.97 
 
 
485 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  33.48 
 
 
483 aa  171  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  33.48 
 
 
483 aa  171  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  29.48 
 
 
492 aa  170  6e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  29.48 
 
 
492 aa  170  6e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  32.62 
 
 
483 aa  169  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  34.2 
 
 
488 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  30.25 
 
 
488 aa  168  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  32.79 
 
 
484 aa  168  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  31.24 
 
 
499 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  33.41 
 
 
493 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  32.64 
 
 
484 aa  164  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  32.83 
 
 
484 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  28.8 
 
 
502 aa  163  6e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  32.13 
 
 
486 aa  163  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  32.89 
 
 
496 aa  163  7e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4385  xylulokinase  34.68 
 
 
488 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  34.59 
 
 
490 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  34.59 
 
 
490 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  34.48 
 
 
486 aa  162  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  34.59 
 
 
490 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  34.59 
 
 
490 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  34.02 
 
 
493 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  32.41 
 
 
484 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  33.11 
 
 
493 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  32.41 
 
 
484 aa  160  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  33.95 
 
 
488 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  33.11 
 
 
493 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  33.95 
 
 
488 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  29.7 
 
 
501 aa  160  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  31.83 
 
 
487 aa  160  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  33.62 
 
 
492 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  31.34 
 
 
483 aa  159  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  33.94 
 
 
493 aa  159  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  32.11 
 
 
484 aa  159  9e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  33.57 
 
 
493 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  33.57 
 
 
493 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  34.74 
 
 
475 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  32.34 
 
 
484 aa  159  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  33.57 
 
 
493 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  34.64 
 
 
493 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1238  xylulokinase  34.74 
 
 
475 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0408596  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  34.64 
 
 
493 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0071  xylulokinase  34.74 
 
 
475 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>