More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4755 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4755  xylulokinase  100 
 
 		 495 aa  971    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2065  xylulokinase  68 
 
 		 479 aa  610  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0151  xylulokinase  66.46 
 
 		 463 aa  592  1e-168  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0354  xylulokinase  66.05 
 
 		 458 aa  589  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6686  xylulokinase  67.48 
 
 		 460 aa  578  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.433412 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3972  xylulokinase  65.64 
 
 		 480 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0262091 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3397  xylulokinase  63.39 
 
 		 465 aa  571  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0992186  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3591  xylulokinase  67.69 
 
 		 486 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4038  xylulokinase  64.42 
 
 		 465 aa  559  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06200  D-xylulose kinase  61.86 
 
 		 492 aa  560  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1796  xylulokinase  63.88 
 
 		 460 aa  552  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0338276  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1261  xylulokinase  63.6 
 
 		 482 aa  548  1e-155  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2984  xylulokinase  67.28 
 
 		 482 aa  533  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.765011  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1604  xylulokinase  61.1 
 
 		 464 aa  527  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.952022  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0644  xylulokinase  59.63 
 
 		 480 aa  528  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632042  normal  0.0960286 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2828  xylulokinase  58.97 
 
 		 490 aa  527  1e-148  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1386  xylulokinase  60.2 
 
 		 461 aa  508  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2431  xylulokinase  59.72 
 
 		 475 aa  511  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04580  D-xylulose kinase  60.16 
 
 		 469 aa  492  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.399313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2519  xylulokinase  58.57 
 
 		 465 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.606613  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2564  xylulokinase  58.57 
 
 		 465 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4666  xylulokinase  59.6 
 
 		 505 aa  491  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114264  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2556  xylulokinase  58.37 
 
 		 465 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0467  xylulokinase  55.64 
 
 		 480 aa  483  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5296  xylulokinase  58.35 
 
 		 464 aa  477  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714705  normal  0.049694 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1425  xylulokinase  56.51 
 
 		 466 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.741435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3306  xylulokinase  57.69 
 
 		 479 aa  466  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0167704 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2176  xylulokinase  61.1 
 
 		 472 aa  461  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000507955 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1886  Xylulose kinase  49.42 
 
 		 506 aa  450  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.0000234527  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3253  xylulokinase  53.88 
 
 		 464 aa  437  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.100272 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01700  D-xylulose kinase  48.68 
 
 		 463 aa  374  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7020  carbohydrate kinase FGGY  43.18 
 
 		 540 aa  295  9e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2788  xylulokinase  43.22 
 
 		 493 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2832  xylulokinase  43.22 
 
 		 493 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2815  xylulokinase  44.87 
 
 		 493 aa  269  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0161746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  36.94 
 
 		 498 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  38.19 
 
 		 495 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  37.14 
 
 		 510 aa  241  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  35.64 
 
 		 498 aa  234  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  33.56 
 
 		 496 aa  231  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  37.55 
 
 		 502 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  37.71 
 
 		 496 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  36.61 
 
 		 499 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  36.05 
 
 		 493 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  34.17 
 
 		 498 aa  219  6e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  32.48 
 
 		 505 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2036  xylulokinase  37.58 
 
 		 496 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  35.48 
 
 		 493 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  34.46 
 
 		 497 aa  206  7e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  30.87 
 
 		 492 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  30.87 
 
 		 492 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  34.11 
 
 		 488 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  29.65 
 
 		 518 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  29.42 
 
 		 500 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  32.22 
 
 		 512 aa  173  6.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  32.81 
 
 		 486 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  33.19 
 
 		 483 aa  172  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  32.51 
 
 		 484 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3071  xylulokinase  34.1 
 
 		 488 aa  170  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4385  xylulokinase  34.26 
 
 		 488 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  32.66 
 
 		 484 aa  169  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0856501 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  32.43 
 
 		 484 aa  168  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  32.43 
 
 		 484 aa  168  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  32.43 
 
 		 484 aa  168  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  32.43 
 
 		 484 aa  168  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  33.26 
 
 		 484 aa  167  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  34.57 
 
 		 498 aa  167  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  34.18 
 
 		 488 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  34.18 
 
 		 488 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  36.23 
 
 		 493 aa  166  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  33.26 
 
 		 484 aa  166  9e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  33.26 
 
 		 484 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  32.21 
 
 		 484 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  30.62 
 
 		 496 aa  164  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  31.84 
 
 		 484 aa  164  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1079  xylulokinase  33.65 
 
 		 475 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0071  xylulokinase  33.65 
 
 		 475 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1238  xylulokinase  33.65 
 
 		 475 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0408596  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  33.65 
 
 		 475 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1745  xylulokinase  33.49 
 
 		 486 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1173  xylulokinase  33.49 
 
 		 486 aa  163  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000934305  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  34.1 
 
 		 496 aa  163  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  33.49 
 
 		 486 aa  162  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  31.71 
 
 		 484 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  33.49 
 
 		 486 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  31.82 
 
 		 492 aa  160  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  32.06 
 
 		 484 aa  160  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  31.6 
 
 		 484 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  28.18 
 
 		 501 aa  159  9e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  31.6 
 
 		 484 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  32.58 
 
 		 483 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  36.23 
 
 		 493 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  36.23 
 
 		 493 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  35.98 
 
 		 493 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  35.98 
 
 		 493 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  33.05 
 
 		 491 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  35.98 
 
 		 493 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  35.71 
 
 		 491 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  30.8 
 
 		 515 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  31.84 
 
 		 484 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>