More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_34350 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  97.78 
 
 		 496 aa  930    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2036  xylulokinase  75.1 
 
 		 496 aa  714    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  100 
 
 		 502 aa  983    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  63.27 
 
 		 499 aa  619  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  59.18 
 
 		 498 aa  587  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  58.16 
 
 		 493 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  57.35 
 
 		 493 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  57.54 
 
 		 495 aa  518  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  51.02 
 
 		 496 aa  511  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  51.72 
 
 		 498 aa  508  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  49.08 
 
 		 505 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  52.95 
 
 		 498 aa  486  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  43.6 
 
 		 510 aa  396  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  43.27 
 
 		 497 aa  372  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  35.76 
 
 		 518 aa  278  2e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  32.06 
 
 		 492 aa  270  5e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  32.06 
 
 		 492 aa  270  5e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  37.62 
 
 		 509 aa  268  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  31.79 
 
 		 500 aa  265  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  35.39 
 
 		 512 aa  259  1e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  31.69 
 
 		 502 aa  256  6e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  30.96 
 
 		 489 aa  256  8e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1604  xylulokinase  37.5 
 
 		 464 aa  256  9e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.952022  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0354  xylulokinase  39.35 
 
 		 458 aa  252  9.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3397  xylulokinase  37.91 
 
 		 465 aa  250  4e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0992186  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  34.82 
 
 		 496 aa  248  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  34.4 
 
 		 511 aa  247  4e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  31.34 
 
 		 509 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  36.33 
 
 		 504 aa  243  5e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2519  xylulokinase  38.85 
 
 		 465 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.606613  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  36.96 
 
 		 511 aa  242  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2564  xylulokinase  38.85 
 
 		 465 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  36.13 
 
 		 506 aa  241  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4038  xylulokinase  38.94 
 
 		 465 aa  239  5.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  38.43 
 
 		 499 aa  239  6.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  36.24 
 
 		 517 aa  239  8e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  29.72 
 
 		 501 aa  239  9e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  36.24 
 
 		 517 aa  239  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2556  xylulokinase  38.63 
 
 		 465 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06200  D-xylulose kinase  37.15 
 
 		 492 aa  238  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  31.16 
 
 		 509 aa  238  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04580  D-xylulose kinase  37.47 
 
 		 469 aa  238  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.399313 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0151  xylulokinase  37.89 
 
 		 463 aa  237  4e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5296  xylulokinase  37.28 
 
 		 464 aa  237  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714705  normal  0.049694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1386  xylulokinase  37.89 
 
 		 461 aa  236  8e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  37.2 
 
 		 498 aa  236  9e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  37.37 
 
 		 496 aa  234  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2788  xylulokinase  38.41 
 
 		 493 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2832  xylulokinase  38.41 
 
 		 493 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  36.36 
 
 		 505 aa  232  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2065  xylulokinase  36.52 
 
 		 479 aa  232  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  31.03 
 
 		 500 aa  229  8e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2431  xylulokinase  37.36 
 
 		 475 aa  229  8e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2828  xylulokinase  35.5 
 
 		 490 aa  228  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2815  xylulokinase  38.52 
 
 		 493 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0161746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3253  xylulokinase  37.86 
 
 		 464 aa  227  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.100272 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3972  xylulokinase  38.36 
 
 		 480 aa  226  6e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0262091 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  33.33 
 
 		 484 aa  226  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1261  xylulokinase  36.42 
 
 		 482 aa  226  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501532 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  33.2 
 
 		 484 aa  225  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  33.13 
 
 		 489 aa  225  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  32.4 
 
 		 499 aa  224  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  32.24 
 
 		 484 aa  223  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4755  xylulokinase  36.59 
 
 		 495 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  32.73 
 
 		 484 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4666  xylulokinase  38 
 
 		 505 aa  219  8.999999999999998e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114264  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  36.06 
 
 		 494 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1425  xylulokinase  36.54 
 
 		 466 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.741435  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  29.78 
 
 		 496 aa  217  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1886  Xylulose kinase  33.26 
 
 		 506 aa  217  4e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.0000234527  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  30.97 
 
 		 494 aa  217  5e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0467  xylulokinase  35.06 
 
 		 480 aa  216  5.9999999999999996e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  35.91 
 
 		 493 aa  216  9e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0028  xylulokinase  36.32 
 
 		 483 aa  215  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.237536  normal  0.287388 
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  32.04 
 
 		 483 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3591  xylulokinase  36.49 
 
 		 486 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  32.04 
 
 		 483 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  31.3 
 
 		 515 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  35.42 
 
 		 511 aa  214  3.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  30.63 
 
 		 488 aa  214  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01700  D-xylulose kinase  36.73 
 
 		 463 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  36.02 
 
 		 478 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3306  xylulokinase  36.9 
 
 		 479 aa  213  7.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0167704 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  35.52 
 
 		 493 aa  212  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  37.72 
 
 		 490 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  37.72 
 
 		 490 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  37.72 
 
 		 490 aa  210  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  37.72 
 
 		 490 aa  210  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  35.4 
 
 		 487 aa  209  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  34.59 
 
 		 499 aa  209  7e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  35.86 
 
 		 493 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  35.86 
 
 		 493 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  35.06 
 
 		 493 aa  208  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  37.42 
 
 		 491 aa  208  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  37.28 
 
 		 493 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  35.66 
 
 		 493 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  37.28 
 
 		 493 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  35.66 
 
 		 493 aa  207  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  37.28 
 
 		 493 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  35.86 
 
 		 493 aa  207  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>