More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2904 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02620  predicted kinase  97.76 
 
 		 492 aa  1007    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.209006  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0913  carbohydrate kinase FGGY  97.76 
 
 		 492 aa  1007    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000517284  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02583  hypothetical protein  97.76 
 
 		 492 aa  1007    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.235998  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0937  carbohydrate kinase FGGY  97.76 
 
 		 492 aa  1006    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.101541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4032  carbohydrate kinase, FGGY family protein  97.76 
 
 		 492 aa  1007    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.157439  normal  0.426373 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2915  carbohydrate kinase, FGGY family protein  98.17 
 
 		 492 aa  1007    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000176494  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2904  carbohydrate kinase, FGGY family protein  100 
 
 		 492 aa  1026    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0969713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3077  carbohydrate kinase, FGGY family protein  97.36 
 
 		 492 aa  999    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000634701  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2464  carbohydrate kinase FGGY  48.63 
 
 		 481 aa  468  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2134  putative carbohydrate kinase  30.89 
 
 		 520 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24960  putative carbohydrate kinase  30.89 
 
 		 519 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2334  carbohydrate kinase, FGGY  29.94 
 
 		 519 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1560  carbohydrate kinase, FGGY  30.14 
 
 		 519 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1344  carbohydrate kinase, FGGY  30.2 
 
 		 519 aa  226  6e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.789365  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0013  carbohydrate kinase, FGGY  30.55 
 
 		 522 aa  217  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4357  carbohydrate kinase FGGY  29.15 
 
 		 528 aa  205  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0596  sugar (pentulose and hexulose) kinase  28.85 
 
 		 521 aa  204  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.354732 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2615  carbohydrate kinase FGGY  27.57 
 
 		 520 aa  203  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0137  carbohydrate kinase  27.1 
 
 		 519 aa  193  5e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3391  carbohydrate kinase FGGY  25.85 
 
 		 517 aa  193  5e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1009  carbohydrate kinase, FGGY  26.26 
 
 		 513 aa  190  4e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.888443  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0555  carbohydrate kinase FGGY  27.23 
 
 		 516 aa  187  3e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000375717  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1608  carbohydrate kinase, FGGY  26.43 
 
 		 527 aa  176  7e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00017495 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1976  carbohydrate kinase, FGGY  25.45 
 
 		 512 aa  150  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00288575 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  25.65 
 
 		 518 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  26.26 
 
 		 512 aa  139  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3424  carbohydrate kinase FGGY  26.54 
 
 		 438 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000031899  hitchhiker  0.000118115 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  26 
 
 		 519 aa  136  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  25 
 
 		 511 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  24.95 
 
 		 496 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  23.08 
 
 		 501 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  23.85 
 
 		 509 aa  130  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  24.05 
 
 		 497 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  24.59 
 
 		 512 aa  130  7.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2703  carbohydrate kinase FGGY  25.88 
 
 		 521 aa  128  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  24.09 
 
 		 506 aa  126  8.000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  24.14 
 
 		 500 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  24.59 
 
 		 509 aa  124  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  25.05 
 
 		 502 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  23.76 
 
 		 503 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  23.16 
 
 		 515 aa  117  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  23.09 
 
 		 502 aa  115  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  26.55 
 
 		 504 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  22.78 
 
 		 506 aa  111  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  23.94 
 
 		 511 aa  111  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2147  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.82 
 
 		 530 aa  111  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1593  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.62 
 
 		 530 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  24.52 
 
 		 510 aa  110  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3538  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.3 
 
 		 530 aa  110  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1712  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.62 
 
 		 530 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2135  carbohydrate kinase FGGY  23.62 
 
 		 530 aa  109  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1661  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.62 
 
 		 530 aa  109  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.68331 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1382  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.99 
 
 		 521 aa  109  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  23.21 
 
 		 506 aa  108  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  23.83 
 
 		 499 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  22.09 
 
 		 505 aa  107  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  23.93 
 
 		 498 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  23.6 
 
 		 524 aa  104  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  23.78 
 
 		 509 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4168  glycerol kinase  22.87 
 
 		 501 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  22.77 
 
 		 495 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3905  glycerol kinase  23.3 
 
 		 501 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  22.71 
 
 		 497 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4318  autoinducer-2 (AI-2) kinase  22.92 
 
 		 516 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  25.3 
 
 		 506 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3648  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.24 
 
 		 530 aa  100  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4400  autoinducer-2 (AI-2) kinase  22.92 
 
 		 516 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4403  autoinducer-2 (AI-2) kinase  22.92 
 
 		 516 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00650936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  25.2 
 
 		 492 aa  100  7e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  25.2 
 
 		 492 aa  100  7e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  22.57 
 
 		 499 aa  100  7e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4470  autoinducer-2 (AI-2) kinase  22.92 
 
 		 516 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4288  autoinducer-2 (AI-2) kinase  22.73 
 
 		 516 aa  100  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1488  glycerol kinase  22.56 
 
 		 498 aa  99.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  22.88 
 
 		 507 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  22.88 
 
 		 507 aa  99.4  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  22.88 
 
 		 507 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0855  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.24 
 
 		 530 aa  99.8  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  24.37 
 
 		 498 aa  99.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3518  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.24 
 
 		 530 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3325  carbohydrate kinase FGGY  23.92 
 
 		 519 aa  98.6  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00841361  normal  0.0106585 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  22.31 
 
 		 502 aa  98.6  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  22.84 
 
 		 489 aa  98.2  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  23.02 
 
 		 493 aa  98.2  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  23.15 
 
 		 511 aa  97.8  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  23.14 
 
 		 548 aa  97.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  22.22 
 
 		 509 aa  97.4  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  23.33 
 
 		 511 aa  97.4  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  22.04 
 
 		 495 aa  97.4  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0174  glycerol kinase  22.99 
 
 		 503 aa  97.4  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300542  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1531  glycerol kinase  21.92 
 
 		 504 aa  97.1  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.403909  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  22.65 
 
 		 509 aa  96.7  8e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  23.33 
 
 		 511 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  22.93 
 
 		 513 aa  95.5  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0159  glycerol kinase  22.29 
 
 		 503 aa  95.5  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2124  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.62 
 
 		 530 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359272  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  24.25 
 
 		 510 aa  95.1  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  25.94 
 
 		 498 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  23.6 
 
 		 487 aa  95.1  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  23.55 
 
 		 517 aa  94.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>