More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0134 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03432  L-xylulose kinase  100 
 
 		 498 aa  1034    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0130  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 498 aa  1034    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3888  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  85.74 
 
 		 498 aa  896    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3997  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  86.35 
 
 		 498 aa  904    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.970359 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4077  cryptic L-xylulose kinase  98.39 
 
 		 498 aa  1018    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3872  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  86.35 
 
 		 498 aa  901    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3936  carbohydrate kinase FGGY  63.45 
 
 		 493 aa  649    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3695  carbohydrate kinase FGGY  63.87 
 
 		 502 aa  662    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3892  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  63.22 
 
 		 505 aa  645    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3784  cryptic L-xylulose kinase  100 
 
 		 498 aa  1034    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03383  hypothetical protein  100 
 
 		 498 aa  1034    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4059  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  86.14 
 
 		 498 aa  900    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.822702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3903  cryptic L-xylulose kinase  98.39 
 
 		 498 aa  1018    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.783257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3952  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  86.35 
 
 		 498 aa  903    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0134  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 498 aa  1034    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0770  L-xylulose kinase  58.2 
 
 		 484 aa  600  1e-170  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0048654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3270  cryptic L-xylulose kinase  42.83 
 
 		 498 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3403  carbohydrate kinase FGGY  42.83 
 
 		 498 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0932  cryptic L-xylulose kinase  42.83 
 
 		 498 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.613284  normal  0.355082 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3079  carbohydrate kinase FGGY  34.48 
 
 		 511 aa  281  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1194  carbohydrate kinase, FGGY  35.14 
 
 		 503 aa  280  3e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3610  carbohydrate kinase FGGY  34.86 
 
 		 509 aa  277  4e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5161  carbohydrate kinase FGGY  33.6 
 
 		 509 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1803  carbohydrate kinase  31.59 
 
 		 505 aa  271  1e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5317  carbohydrate kinase FGGY  32.34 
 
 		 509 aa  257  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2917  carbohydrate kinase FGGY  32.54 
 
 		 504 aa  253  6e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156588  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  30.3 
 
 		 501 aa  219  8.999999999999998e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  29.08 
 
 		 500 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  29.49 
 
 		 515 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  32.54 
 
 		 509 aa  206  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  28.02 
 
 		 492 aa  204  4e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  28.02 
 
 		 492 aa  204  4e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3325  carbohydrate kinase FGGY  30.16 
 
 		 519 aa  203  6e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00841361  normal  0.0106585 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  29.94 
 
 		 512 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2411  carbohydrate kinase FGGY  30.29 
 
 		 511 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  27.17 
 
 		 503 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  29.94 
 
 		 509 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  28.24 
 
 		 509 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  29.59 
 
 		 504 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  27.8 
 
 		 500 aa  187  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1199  carbohydrate kinase FGGY  30.56 
 
 		 503 aa  187  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.535076 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  29.72 
 
 		 506 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  29.14 
 
 		 511 aa  186  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  28.24 
 
 		 518 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  28.51 
 
 		 502 aa  184  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  28.46 
 
 		 515 aa  181  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13300  pentulose/hexulose kinase  29.84 
 
 		 492 aa  179  8e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  26.38 
 
 		 538 aa  179  8e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  29.54 
 
 		 511 aa  179  9e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  25.6 
 
 		 496 aa  177  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  30.26 
 
 		 505 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0411  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  28.26 
 
 		 495 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  27.67 
 
 		 548 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  24.42 
 
 		 506 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  27.11 
 
 		 509 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  25.9 
 
 		 499 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  27.74 
 
 		 506 aa  165  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  26.76 
 
 		 496 aa  164  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  25.97 
 
 		 489 aa  164  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  29.22 
 
 		 508 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  27.29 
 
 		 486 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  28.33 
 
 		 498 aa  160  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  29.75 
 
 		 487 aa  160  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  29.47 
 
 		 481 aa  160  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  27.91 
 
 		 524 aa  159  8e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  29.51 
 
 		 499 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  27.43 
 
 		 512 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  26.74 
 
 		 509 aa  156  7e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  27.7 
 
 		 501 aa  156  7e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  28.29 
 
 		 493 aa  155  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  26.4 
 
 		 510 aa  154  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  26.06 
 
 		 506 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  28.97 
 
 		 508 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  23.98 
 
 		 509 aa  152  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  26.1 
 
 		 508 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  27.27 
 
 		 503 aa  150  5e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  26.28 
 
 		 488 aa  150  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  27.31 
 
 		 495 aa  148  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  26.45 
 
 		 490 aa  148  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  27.27 
 
 		 483 aa  147  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2135  carbohydrate kinase FGGY  25.35 
 
 		 530 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1712  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.35 
 
 		 530 aa  147  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1267  carbohydrate kinase, FGGY  26.35 
 
 		 501 aa  147  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  24.7 
 
 		 497 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2147  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.35 
 
 		 530 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1661  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.35 
 
 		 530 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.68331 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  25.59 
 
 		 499 aa  146  9e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  26.04 
 
 		 512 aa  146  9e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  25.89 
 
 		 514 aa  146  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  26.68 
 
 		 530 aa  146  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  24.81 
 
 		 512 aa  145  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  28.02 
 
 		 483 aa  145  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  28.4 
 
 		 472 aa  145  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2480  carbohydrate kinase FGGY  30.25 
 
 		 489 aa  145  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  27.38 
 
 		 484 aa  145  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1382  autoinducer-2 (AI-2) kinase  26.33 
 
 		 521 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1593  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.15 
 
 		 530 aa  144  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  26.76 
 
 		 505 aa  144  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  28.02 
 
 		 483 aa  144  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  27.83 
 
 		 484 aa  143  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>