More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5317 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_2917  carbohydrate kinase FGGY  71.12 
 
 		 504 aa  714    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156588  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5317  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 509 aa  1036    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1194  carbohydrate kinase, FGGY  36.17 
 
 		 503 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3610  carbohydrate kinase FGGY  39.32 
 
 		 509 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3079  carbohydrate kinase FGGY  38.19 
 
 		 511 aa  303  5.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5161  carbohydrate kinase FGGY  38.96 
 
 		 509 aa  299  8e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3695  carbohydrate kinase FGGY  34.94 
 
 		 502 aa  279  7e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3952  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  32.54 
 
 		 498 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3872  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  32.34 
 
 		 498 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4059  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  32.34 
 
 		 498 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.822702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3997  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  32.34 
 
 		 498 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.970359 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3888  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  32.14 
 
 		 498 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3936  carbohydrate kinase FGGY  34.15 
 
 		 493 aa  274  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4077  cryptic L-xylulose kinase  32.54 
 
 		 498 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3892  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  34.73 
 
 		 505 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3903  cryptic L-xylulose kinase  32.34 
 
 		 498 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.783257  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03432  L-xylulose kinase  32.34 
 
 		 498 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0130  carbohydrate kinase FGGY  32.34 
 
 		 498 aa  268  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3784  cryptic L-xylulose kinase  32.34 
 
 		 498 aa  268  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03383  hypothetical protein  32.34 
 
 		 498 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0134  carbohydrate kinase FGGY  32.34 
 
 		 498 aa  268  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0770  L-xylulose kinase  32.54 
 
 		 484 aa  257  3e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0048654  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1803  carbohydrate kinase  32.5 
 
 		 505 aa  256  9e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3325  carbohydrate kinase FGGY  34.9 
 
 		 519 aa  246  6.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00841361  normal  0.0106585 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3270  cryptic L-xylulose kinase  31.68 
 
 		 498 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0932  cryptic L-xylulose kinase  31.68 
 
 		 498 aa  228  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.613284  normal  0.355082 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3403  carbohydrate kinase FGGY  31.68 
 
 		 498 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2411  carbohydrate kinase FGGY  35.55 
 
 		 511 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  30.95 
 
 		 509 aa  223  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  31.8 
 
 		 509 aa  223  7e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  30.27 
 
 		 500 aa  218  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1199  carbohydrate kinase FGGY  36.67 
 
 		 503 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.535076 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2016  carbohydrate kinase, FGGY  32.69 
 
 		 536 aa  202  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  31.41 
 
 		 512 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  33.67 
 
 		 506 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  27.74 
 
 		 509 aa  188  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  27.15 
 
 		 502 aa  188  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  27.29 
 
 		 501 aa  184  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  26.92 
 
 		 518 aa  180  5.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2571  carbohydrate kinase, FGGY  31.42 
 
 		 520 aa  179  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  27.82 
 
 		 509 aa  176  9e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5323  carbohydrate kinase FGGY  29.84 
 
 		 526 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193294  normal  0.377624 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2480  carbohydrate kinase FGGY  32.43 
 
 		 489 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  27.81 
 
 		 503 aa  171  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  28.06 
 
 		 515 aa  170  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  28.26 
 
 		 515 aa  170  7e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  26.91 
 
 		 500 aa  169  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  27.52 
 
 		 519 aa  168  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  29.86 
 
 		 504 aa  168  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  28.12 
 
 		 506 aa  167  5e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  29.38 
 
 		 506 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  24.31 
 
 		 497 aa  166  8e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  29.17 
 
 		 512 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2159  carbohydrate kinase FGGY  31.17 
 
 		 525 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  30.62 
 
 		 493 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13300  pentulose/hexulose kinase  29.82 
 
 		 492 aa  163  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  27.52 
 
 		 496 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3230  putative carbohydrate kinase  28.89 
 
 		 526 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.366469 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  29.62 
 
 		 512 aa  161  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  28.26 
 
 		 512 aa  161  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2911  carbohydrate kinase FGGY  29.45 
 
 		 523 aa  161  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106572  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  26.18 
 
 		 499 aa  160  4e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  28.7 
 
 		 530 aa  159  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  26.09 
 
 		 492 aa  159  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  26.09 
 
 		 492 aa  159  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  28.99 
 
 		 548 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0864  erythritol kinase  30.08 
 
 		 517 aa  158  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.588929  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  30.6 
 
 		 499 aa  157  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  27.87 
 
 		 509 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  27.54 
 
 		 506 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  26.91 
 
 		 518 aa  156  1e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0855  autoinducer-2 (AI-2) kinase  30.41 
 
 		 530 aa  155  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3518  autoinducer-2 (AI-2) kinase  30.41 
 
 		 530 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  26.33 
 
 		 538 aa  154  5e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  27.54 
 
 		 486 aa  153  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2625  carbohydrate kinase, FGGY  28.82 
 
 		 505 aa  153  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  25.43 
 
 		 513 aa  153  8.999999999999999e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  29.02 
 
 		 511 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  24.71 
 
 		 506 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3648  autoinducer-2 (AI-2) kinase  30.19 
 
 		 530 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  27.88 
 
 		 499 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2774  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.61 
 
 		 520 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.235174  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1477  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.68 
 
 		 520 aa  151  3e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0166671  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  29.13 
 
 		 481 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  28.29 
 
 		 513 aa  148  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  28.29 
 
 		 513 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3019  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.24 
 
 		 520 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  28.92 
 
 		 503 aa  147  3e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  25.73 
 
 		 489 aa  148  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  28.29 
 
 		 513 aa  148  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  28.29 
 
 		 513 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  28.29 
 
 		 513 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  28.51 
 
 		 513 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  26.86 
 
 		 526 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  30.95 
 
 		 519 aa  147  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  28.29 
 
 		 513 aa  147  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  28.29 
 
 		 512 aa  146  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  24.35 
 
 		 505 aa  146  9e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  28.02 
 
 		 498 aa  146  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3538  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.06 
 
 		 530 aa  145  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.189864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>