More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0770 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0770  L-xylulose kinase  100 
 
 		 484 aa  1006    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0048654  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3695  carbohydrate kinase FGGY  61.05 
 
 		 502 aa  620  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3892  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  60.61 
 
 		 505 aa  609  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3936  carbohydrate kinase FGGY  59.92 
 
 		 493 aa  605  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4059  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  57.58 
 
 		 498 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.822702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3997  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  57.79 
 
 		 498 aa  601  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.970359 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03432  L-xylulose kinase  58.2 
 
 		 498 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0130  carbohydrate kinase FGGY  58.2 
 
 		 498 aa  600  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3903  cryptic L-xylulose kinase  58.08 
 
 		 498 aa  600  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.783257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03383  hypothetical protein  58.2 
 
 		 498 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3784  cryptic L-xylulose kinase  58.2 
 
 		 498 aa  600  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0134  carbohydrate kinase FGGY  58.2 
 
 		 498 aa  600  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3952  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  57.58 
 
 		 498 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3888  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  57.38 
 
 		 498 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4077  cryptic L-xylulose kinase  57.99 
 
 		 498 aa  598  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3872  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  57.38 
 
 		 498 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0932  cryptic L-xylulose kinase  41.65 
 
 		 498 aa  355  6.999999999999999e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.613284  normal  0.355082 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3403  carbohydrate kinase FGGY  41.65 
 
 		 498 aa  355  6.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3270  cryptic L-xylulose kinase  41.65 
 
 		 498 aa  355  6.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3079  carbohydrate kinase FGGY  36.18 
 
 		 511 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5161  carbohydrate kinase FGGY  34.21 
 
 		 509 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3610  carbohydrate kinase FGGY  33.67 
 
 		 509 aa  268  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1803  carbohydrate kinase  31.26 
 
 		 505 aa  265  1e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1194  carbohydrate kinase, FGGY  33.2 
 
 		 503 aa  254  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5317  carbohydrate kinase FGGY  32.54 
 
 		 509 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2917  carbohydrate kinase FGGY  31.1 
 
 		 504 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156588  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  27.47 
 
 		 501 aa  219  7e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  26.1 
 
 		 492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  26.1 
 
 		 492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  30.57 
 
 		 509 aa  201  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  28.83 
 
 		 500 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  27.96 
 
 		 515 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  28.19 
 
 		 502 aa  192  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  28.69 
 
 		 509 aa  190  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  27.19 
 
 		 500 aa  186  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  25.79 
 
 		 509 aa  183  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2411  carbohydrate kinase FGGY  28.44 
 
 		 511 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  26 
 
 		 499 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3325  carbohydrate kinase FGGY  26.96 
 
 		 519 aa  172  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00841361  normal  0.0106585 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  27.4 
 
 		 509 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1199  carbohydrate kinase FGGY  26.38 
 
 		 503 aa  168  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.535076 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  28.74 
 
 		 505 aa  166  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  24.25 
 
 		 538 aa  166  9e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  28.18 
 
 		 508 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  27.44 
 
 		 483 aa  163  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  26.08 
 
 		 486 aa  162  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  27.44 
 
 		 483 aa  162  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  26.45 
 
 		 512 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  27.13 
 
 		 512 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  25.6 
 
 		 496 aa  160  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  28.54 
 
 		 499 aa  160  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  28.19 
 
 		 508 aa  160  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  27.52 
 
 		 511 aa  160  5e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  26.68 
 
 		 518 aa  160  6e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  27.18 
 
 		 509 aa  160  7e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  25.82 
 
 		 484 aa  159  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  26.96 
 
 		 504 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  25.85 
 
 		 511 aa  158  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  25.6 
 
 		 503 aa  158  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13300  pentulose/hexulose kinase  26.54 
 
 		 492 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  24.65 
 
 		 515 aa  156  7e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  24.33 
 
 		 498 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  24.05 
 
 		 496 aa  153  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2480  carbohydrate kinase FGGY  27.63 
 
 		 489 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  27.79 
 
 		 472 aa  151  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  27.43 
 
 		 506 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  24.34 
 
 		 490 aa  150  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  23.24 
 
 		 512 aa  150  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  27.24 
 
 		 495 aa  150  6e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  25.83 
 
 		 503 aa  149  8e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  25.71 
 
 		 489 aa  149  9e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  23.36 
 
 		 513 aa  149  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  23.17 
 
 		 513 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  23.17 
 
 		 513 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  25.91 
 
 		 485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  25.91 
 
 		 496 aa  149  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  23.36 
 
 		 513 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  23.68 
 
 		 513 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  23.73 
 
 		 513 aa  147  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  26.81 
 
 		 498 aa  147  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  24.27 
 
 		 499 aa  147  5e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  23.33 
 
 		 513 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  23.87 
 
 		 513 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  25.65 
 
 		 530 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  25.85 
 
 		 484 aa  144  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  26.37 
 
 		 483 aa  144  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  23.85 
 
 		 548 aa  142  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  25.05 
 
 		 484 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  24.36 
 
 		 511 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  27.4 
 
 		 511 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  26.34 
 
 		 481 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  24.95 
 
 		 486 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  27.27 
 
 		 472 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  23.53 
 
 		 512 aa  141  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  26.71 
 
 		 499 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  24.39 
 
 		 518 aa  139  1e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  22.99 
 
 		 512 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  26.87 
 
 		 484 aa  138  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  22.57 
 
 		 506 aa  138  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  25.3 
 
 		 505 aa  137  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>