More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3892 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03432  L-xylulose kinase  63.22 
 
 		 498 aa  653    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0130  carbohydrate kinase FGGY  63.22 
 
 		 498 aa  653    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3784  cryptic L-xylulose kinase  63.22 
 
 		 498 aa  653    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3903  cryptic L-xylulose kinase  63.02 
 
 		 498 aa  651    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.783257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3695  carbohydrate kinase FGGY  96.24 
 
 		 502 aa  1002    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3892  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  100 
 
 		 505 aa  1044    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03383  hypothetical protein  63.22 
 
 		 498 aa  653    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4077  cryptic L-xylulose kinase  63.02 
 
 		 498 aa  652    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3872  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  61.83 
 
 		 498 aa  641    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3888  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  61.63 
 
 		 498 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4059  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  61.83 
 
 		 498 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.822702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3952  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  62.03 
 
 		 498 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3997  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  61.83 
 
 		 498 aa  641    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.970359 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3936  carbohydrate kinase FGGY  76.21 
 
 		 493 aa  780    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0134  carbohydrate kinase FGGY  63.22 
 
 		 498 aa  653    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0770  L-xylulose kinase  60.81 
 
 		 484 aa  619  1e-176  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0048654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3270  cryptic L-xylulose kinase  44 
 
 		 498 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3403  carbohydrate kinase FGGY  44 
 
 		 498 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0932  cryptic L-xylulose kinase  44 
 
 		 498 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.613284  normal  0.355082 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3079  carbohydrate kinase FGGY  36.86 
 
 		 511 aa  292  8e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5161  carbohydrate kinase FGGY  36.13 
 
 		 509 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3610  carbohydrate kinase FGGY  36.96 
 
 		 509 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5317  carbohydrate kinase FGGY  34.73 
 
 		 509 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1194  carbohydrate kinase, FGGY  33.6 
 
 		 503 aa  265  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1803  carbohydrate kinase  32.87 
 
 		 505 aa  260  5.0000000000000005e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2917  carbohydrate kinase FGGY  32.87 
 
 		 504 aa  251  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156588  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  31.31 
 
 		 500 aa  231  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  32.35 
 
 		 509 aa  219  7e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  28.12 
 
 		 509 aa  207  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  27.66 
 
 		 501 aa  205  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  30.12 
 
 		 512 aa  197  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2411  carbohydrate kinase FGGY  30.8 
 
 		 511 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  28.6 
 
 		 515 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  27.09 
 
 		 492 aa  193  6e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  27.09 
 
 		 492 aa  193  6e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1199  carbohydrate kinase FGGY  31.44 
 
 		 503 aa  192  9e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.535076 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  31.63 
 
 		 509 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  29.17 
 
 		 509 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  27.93 
 
 		 538 aa  190  4e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3325  carbohydrate kinase FGGY  29.76 
 
 		 519 aa  189  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00841361  normal  0.0106585 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  28.15 
 
 		 518 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  26.28 
 
 		 502 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  28.74 
 
 		 504 aa  184  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  25.6 
 
 		 500 aa  179  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  25.98 
 
 		 499 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  29.7 
 
 		 506 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  26.81 
 
 		 496 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  28.57 
 
 		 511 aa  172  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  28.91 
 
 		 511 aa  171  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  28.57 
 
 		 498 aa  167  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  26.56 
 
 		 548 aa  167  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  24.75 
 
 		 503 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  29.17 
 
 		 512 aa  164  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  29.25 
 
 		 524 aa  163  7e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  29.96 
 
 		 499 aa  162  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  30.04 
 
 		 487 aa  160  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  26.63 
 
 		 511 aa  159  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  30.22 
 
 		 505 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  25.34 
 
 		 506 aa  159  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  28.65 
 
 		 508 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  27 
 
 		 483 aa  157  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  26.86 
 
 		 530 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13300  pentulose/hexulose kinase  28.12 
 
 		 492 aa  156  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  24.08 
 
 		 486 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  26.26 
 
 		 519 aa  156  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  27 
 
 		 483 aa  156  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  25.15 
 
 		 499 aa  155  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  27.68 
 
 		 508 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  26.26 
 
 		 514 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  25.94 
 
 		 515 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  25.55 
 
 		 489 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1267  carbohydrate kinase, FGGY  27.82 
 
 		 501 aa  153  7e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  27.4 
 
 		 517 aa  153  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  27.4 
 
 		 517 aa  153  8.999999999999999e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  27.33 
 
 		 511 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  29.17 
 
 		 501 aa  150  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  27.07 
 
 		 503 aa  150  4e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  25.94 
 
 		 509 aa  150  6e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  25.34 
 
 		 506 aa  149  9e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  27.35 
 
 		 481 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  22.83 
 
 		 496 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  25.57 
 
 		 512 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  27.98 
 
 		 506 aa  149  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  28.88 
 
 		 498 aa  148  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  26.13 
 
 		 502 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  29.43 
 
 		 472 aa  147  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2076  carbohydrate kinase, FGGY  27.63 
 
 		 500 aa  147  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00125408 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  26.69 
 
 		 485 aa  146  9e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  27.42 
 
 		 484 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  28.97 
 
 		 472 aa  146  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  27.04 
 
 		 505 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  24.66 
 
 		 512 aa  144  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3538  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.82 
 
 		 530 aa  144  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  22.2 
 
 		 506 aa  143  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2147  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.04 
 
 		 530 aa  143  8e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2135  carbohydrate kinase FGGY  27.04 
 
 		 530 aa  143  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  24.89 
 
 		 512 aa  143  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1712  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.04 
 
 		 530 aa  143  9e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  24.89 
 
 		 511 aa  143  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1593  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.06 
 
 		 530 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>