More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4077 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03432  L-xylulose kinase  98.39 
 
 		 498 aa  1018    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0130  carbohydrate kinase FGGY  98.39 
 
 		 498 aa  1018    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3888  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  85.74 
 
 		 498 aa  895    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03383  hypothetical protein  98.39 
 
 		 498 aa  1018    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0134  carbohydrate kinase FGGY  98.39 
 
 		 498 aa  1018    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3997  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  86.35 
 
 		 498 aa  903    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.970359 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3892  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  63.02 
 
 		 505 aa  643    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4077  cryptic L-xylulose kinase  100 
 
 		 498 aa  1033    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3784  cryptic L-xylulose kinase  98.39 
 
 		 498 aa  1018    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3952  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  86.35 
 
 		 498 aa  903    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3903  cryptic L-xylulose kinase  98.59 
 
 		 498 aa  1019    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.783257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4059  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  86.14 
 
 		 498 aa  900    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.822702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3936  carbohydrate kinase FGGY  63.45 
 
 		 493 aa  649    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3872  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  86.35 
 
 		 498 aa  900    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3695  carbohydrate kinase FGGY  63.67 
 
 		 502 aa  660    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0770  L-xylulose kinase  57.99 
 
 		 484 aa  598  1e-169  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0048654  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3403  carbohydrate kinase FGGY  42.63 
 
 		 498 aa  403  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0932  cryptic L-xylulose kinase  42.63 
 
 		 498 aa  403  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.613284  normal  0.355082 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3270  cryptic L-xylulose kinase  42.63 
 
 		 498 aa  403  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1194  carbohydrate kinase, FGGY  35.14 
 
 		 503 aa  281  3e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3079  carbohydrate kinase FGGY  34.28 
 
 		 511 aa  279  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3610  carbohydrate kinase FGGY  34.66 
 
 		 509 aa  276  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1803  carbohydrate kinase  31.59 
 
 		 505 aa  271  2e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5161  carbohydrate kinase FGGY  33.2 
 
 		 509 aa  269  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5317  carbohydrate kinase FGGY  32.54 
 
 		 509 aa  259  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2917  carbohydrate kinase FGGY  32.35 
 
 		 504 aa  252  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156588  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  29.47 
 
 		 500 aa  218  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  30.1 
 
 		 501 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  28.89 
 
 		 515 aa  206  8e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  31.94 
 
 		 509 aa  203  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3325  carbohydrate kinase FGGY  29.96 
 
 		 519 aa  200  6e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00841361  normal  0.0106585 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  27.62 
 
 		 492 aa  199  9e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  27.62 
 
 		 492 aa  199  9e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  29.74 
 
 		 512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2411  carbohydrate kinase FGGY  30.07 
 
 		 511 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  26.97 
 
 		 503 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  28.04 
 
 		 509 aa  192  9e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  29.48 
 
 		 509 aa  192  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  28.2 
 
 		 500 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  28.43 
 
 		 518 aa  186  6e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1199  carbohydrate kinase FGGY  30.34 
 
 		 503 aa  186  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.535076 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  29.14 
 
 		 511 aa  186  9e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  28.99 
 
 		 504 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  29.53 
 
 		 506 aa  184  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13300  pentulose/hexulose kinase  30.24 
 
 		 492 aa  183  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  28.31 
 
 		 502 aa  179  8e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  25.6 
 
 		 496 aa  177  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  26.18 
 
 		 538 aa  177  6e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  29.14 
 
 		 511 aa  176  7e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  27.87 
 
 		 515 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  30.06 
 
 		 505 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  28.1 
 
 		 548 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  26.97 
 
 		 496 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0411  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  28.04 
 
 		 495 aa  166  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  24.22 
 
 		 506 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  25.77 
 
 		 489 aa  163  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  26.04 
 
 		 499 aa  163  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  27.5 
 
 		 509 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  27.63 
 
 		 512 aa  161  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  28.54 
 
 		 498 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  27.35 
 
 		 506 aa  161  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  29.74 
 
 		 499 aa  160  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  29.33 
 
 		 481 aa  159  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  28.84 
 
 		 508 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  28.68 
 
 		 493 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  27.7 
 
 		 501 aa  158  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  27.51 
 
 		 524 aa  158  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  26.88 
 
 		 486 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  26.74 
 
 		 509 aa  155  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  30 
 
 		 487 aa  155  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  26.4 
 
 		 510 aa  154  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  28.97 
 
 		 508 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  27.47 
 
 		 503 aa  151  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  25.97 
 
 		 506 aa  150  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  23.93 
 
 		 509 aa  150  6e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  28.38 
 
 		 495 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  26.89 
 
 		 490 aa  148  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  25.72 
 
 		 508 aa  148  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2135  carbohydrate kinase FGGY  25.35 
 
 		 530 aa  147  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1661  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.35 
 
 		 530 aa  148  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.68331 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1712  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.35 
 
 		 530 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  26.08 
 
 		 488 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2147  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.35 
 
 		 530 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  25.89 
 
 		 499 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  24.7 
 
 		 497 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  25.84 
 
 		 512 aa  146  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1267  carbohydrate kinase, FGGY  26.15 
 
 		 501 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1593  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.15 
 
 		 530 aa  145  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  26.99 
 
 		 505 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  26.87 
 
 		 483 aa  144  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2480  carbohydrate kinase FGGY  29.79 
 
 		 489 aa  144  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  24.61 
 
 		 512 aa  144  4e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1382  autoinducer-2 (AI-2) kinase  26.45 
 
 		 521 aa  144  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  27.99 
 
 		 472 aa  144  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  27.63 
 
 		 484 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  25.45 
 
 		 514 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  26.79 
 
 		 484 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1560  carbohydrate kinase, FGGY  27.26 
 
 		 519 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  26.23 
 
 		 530 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2625  carbohydrate kinase, FGGY  26.73 
 
 		 505 aa  141  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>