More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1712 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2135  carbohydrate kinase FGGY  99.81 
 
 
530 aa  1090    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1382  autoinducer-2 (AI-2) kinase  78.57 
 
 
521 aa  867    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4288  autoinducer-2 (AI-2) kinase  83.33 
 
 
516 aa  887    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.16033  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1593  autoinducer-2 (AI-2) kinase  99.43 
 
 
530 aa  1088    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4400  autoinducer-2 (AI-2) kinase  83.33 
 
 
516 aa  890    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167986  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4470  autoinducer-2 (AI-2) kinase  83.33 
 
 
516 aa  890    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0855  autoinducer-2 (AI-2) kinase  78.11 
 
 
530 aa  852    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3518  autoinducer-2 (AI-2) kinase  78.49 
 
 
530 aa  854    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0049  autoinducer-2 (AI-2) kinase  67.05 
 
 
517 aa  716    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4403  autoinducer-2 (AI-2) kinase  83.33 
 
 
516 aa  890    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00650936  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1661  autoinducer-2 (AI-2) kinase  98.87 
 
 
530 aa  1085    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.68331 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3648  autoinducer-2 (AI-2) kinase  78.49 
 
 
530 aa  854    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4318  autoinducer-2 (AI-2) kinase  83.53 
 
 
516 aa  889    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2147  autoinducer-2 (AI-2) kinase  99.43 
 
 
530 aa  1089    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2124  autoinducer-2 (AI-2) kinase  99.25 
 
 
530 aa  1087    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359272  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1712  autoinducer-2 (AI-2) kinase  100 
 
 
530 aa  1093    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3538  autoinducer-2 (AI-2) kinase  76.83 
 
 
530 aa  831    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1477  autoinducer-2 (AI-2) kinase  54.53 
 
 
520 aa  600  1e-170  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0166671  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2261  autoinducer-2 (AI-2) kinase  55.23 
 
 
520 aa  590  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0868353 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2774  autoinducer-2 (AI-2) kinase  54.65 
 
 
520 aa  589  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.235174  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2718  autoinducer-2 (AI-2) kinase  54.46 
 
 
522 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2698  autoinducer-2 (AI-2) kinase  54.65 
 
 
522 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2981  autoinducer-2 (AI-2) kinase  53.97 
 
 
520 aa  580  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3017  autoinducer-2 (AI-2) kinase  54.16 
 
 
520 aa  581  1e-164  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.232483  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2977  autoinducer-2 (AI-2) kinase  54.46 
 
 
520 aa  581  1e-164  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000047226 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3019  autoinducer-2 (AI-2) kinase  53.58 
 
 
520 aa  578  1e-164  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3745  autoinducer-2 (AI-2) kinase  57.36 
 
 
525 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3506  autoinducer-2 (AI-2) kinase  52.22 
 
 
509 aa  521  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3151  autoinducer-2 (AI-2) kinase  52.22 
 
 
509 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.220016 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2768  FGGY family of carbohydrate  51.99 
 
 
388 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0823721  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  27.45 
 
 
503 aa  190  7e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  28.43 
 
 
515 aa  180  5.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  27.92 
 
 
509 aa  180  7e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  28.12 
 
 
518 aa  179  8e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  25.6 
 
 
501 aa  178  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  27.63 
 
 
509 aa  177  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  28.4 
 
 
519 aa  176  9e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  27.95 
 
 
538 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  28.1 
 
 
524 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  27.78 
 
 
509 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  29.37 
 
 
512 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  29.05 
 
 
530 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  27.13 
 
 
511 aa  169  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5161  carbohydrate kinase FGGY  31.55 
 
 
509 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  29.17 
 
 
511 aa  169  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  27.58 
 
 
502 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  28.86 
 
 
512 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  29.59 
 
 
548 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  28.09 
 
 
512 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  28.69 
 
 
513 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  27.72 
 
 
500 aa  163  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  28.69 
 
 
513 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  28.69 
 
 
513 aa  163  9e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  28.69 
 
 
513 aa  163  9e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  27.74 
 
 
513 aa  163  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  29.08 
 
 
509 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  28.66 
 
 
513 aa  162  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  28.86 
 
 
512 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  28.69 
 
 
513 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  30.62 
 
 
519 aa  161  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  27.5 
 
 
514 aa  161  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  28.49 
 
 
513 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  28.04 
 
 
510 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  27.05 
 
 
496 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  24.76 
 
 
506 aa  157  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3079  carbohydrate kinase FGGY  30.04 
 
 
511 aa  158  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  26.87 
 
 
512 aa  156  7e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  28.68 
 
 
514 aa  156  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  28.32 
 
 
499 aa  155  1e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  30.41 
 
 
481 aa  155  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  26.82 
 
 
497 aa  154  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  29.59 
 
 
506 aa  154  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1344  carbohydrate kinase, FGGY  28.1 
 
 
519 aa  154  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.789365  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2464  carbohydrate kinase FGGY  27.01 
 
 
481 aa  153  8.999999999999999e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3695  carbohydrate kinase FGGY  27.43 
 
 
502 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0555  carbohydrate kinase FGGY  26.81 
 
 
516 aa  151  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000375717  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  27.08 
 
 
518 aa  150  5e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2470  carbohydrate kinase FGGY  27.03 
 
 
515 aa  150  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  28.19 
 
 
514 aa  149  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  29.76 
 
 
505 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24960  putative carbohydrate kinase  27.25 
 
 
519 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3610  carbohydrate kinase FGGY  30.71 
 
 
509 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  26.09 
 
 
493 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  25 
 
 
513 aa  148  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3936  carbohydrate kinase FGGY  27.45 
 
 
493 aa  148  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4077  cryptic L-xylulose kinase  25.35 
 
 
498 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3903  cryptic L-xylulose kinase  25.35 
 
 
498 aa  148  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.783257  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2134  putative carbohydrate kinase  27.09 
 
 
520 aa  148  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  27.17 
 
 
497 aa  148  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  24.85 
 
 
517 aa  147  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  24.85 
 
 
517 aa  147  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0596  sugar (pentulose and hexulose) kinase  28.12 
 
 
521 aa  147  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.354732 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3784  cryptic L-xylulose kinase  25.35 
 
 
498 aa  147  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03432  L-xylulose kinase  25.35 
 
 
498 aa  147  6e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0130  carbohydrate kinase FGGY  25.35 
 
 
498 aa  147  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  27.45 
 
 
509 aa  147  6e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03383  hypothetical protein  25.35 
 
 
498 aa  147  6e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0134  carbohydrate kinase FGGY  25.35 
 
 
498 aa  147  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1194  carbohydrate kinase, FGGY  26.4 
 
 
503 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  25.95 
 
 
512 aa  146  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>