More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2464 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2464  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 481 aa  1007    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02620  predicted kinase  48.63 
 
 		 492 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.209006  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3077  carbohydrate kinase, FGGY family protein  48.63 
 
 		 492 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000634701  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0913  carbohydrate kinase FGGY  48.63 
 
 		 492 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000517284  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2915  carbohydrate kinase, FGGY family protein  48.63 
 
 		 492 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000176494  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02583  hypothetical protein  48.63 
 
 		 492 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.235998  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0937  carbohydrate kinase FGGY  48.63 
 
 		 492 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.101541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4032  carbohydrate kinase, FGGY family protein  48.41 
 
 		 492 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.157439  normal  0.426373 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2904  carbohydrate kinase, FGGY family protein  48.63 
 
 		 492 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0969713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2134  putative carbohydrate kinase  32.16 
 
 		 520 aa  269  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24960  putative carbohydrate kinase  31.77 
 
 		 519 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1560  carbohydrate kinase, FGGY  31.56 
 
 		 519 aa  262  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1344  carbohydrate kinase, FGGY  30.47 
 
 		 519 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.789365  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0596  sugar (pentulose and hexulose) kinase  32.22 
 
 		 521 aa  260  4e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.354732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4357  carbohydrate kinase FGGY  31.24 
 
 		 528 aa  250  5e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0555  carbohydrate kinase FGGY  28.21 
 
 		 516 aa  239  1e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000375717  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2334  carbohydrate kinase, FGGY  30.02 
 
 		 519 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0013  carbohydrate kinase, FGGY  30.06 
 
 		 522 aa  233  5e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2615  carbohydrate kinase FGGY  27.61 
 
 		 520 aa  229  9e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3391  carbohydrate kinase FGGY  27.42 
 
 		 517 aa  224  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0137  carbohydrate kinase  27.22 
 
 		 519 aa  211  2e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1009  carbohydrate kinase, FGGY  24.9 
 
 		 513 aa  204  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.888443  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1608  carbohydrate kinase, FGGY  27.8 
 
 		 527 aa  204  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00017495 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1976  carbohydrate kinase, FGGY  27.61 
 
 		 512 aa  197  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00288575 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  29.98 
 
 		 512 aa  191  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  28.3 
 
 		 518 aa  179  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  25.78 
 
 		 500 aa  167  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  25.49 
 
 		 503 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  25.48 
 
 		 501 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  27.11 
 
 		 499 aa  163  6e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  25.48 
 
 		 509 aa  163  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  27.72 
 
 		 506 aa  162  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1382  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.04 
 
 		 521 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  26.07 
 
 		 496 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3424  carbohydrate kinase FGGY  27.5 
 
 		 438 aa  158  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000031899  hitchhiker  0.000118115 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2135  carbohydrate kinase FGGY  27.01 
 
 		 530 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1661  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.4 
 
 		 530 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.68331 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1712  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.4 
 
 		 530 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  26.95 
 
 		 509 aa  155  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2147  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.2 
 
 		 530 aa  154  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  25.81 
 
 		 512 aa  153  7e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1593  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.01 
 
 		 530 aa  151  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  28.8 
 
 		 512 aa  145  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  27.4 
 
 		 519 aa  144  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  26.16 
 
 		 515 aa  144  4e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  26.77 
 
 		 512 aa  143  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3538  autoinducer-2 (AI-2) kinase  26 
 
 		 530 aa  143  7e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  25.29 
 
 		 506 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  27.16 
 
 		 504 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  26.24 
 
 		 509 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  26.15 
 
 		 511 aa  139  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  26.6 
 
 		 510 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  27.54 
 
 		 518 aa  138  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  23.27 
 
 		 511 aa  138  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2124  autoinducer-2 (AI-2) kinase  26.81 
 
 		 530 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359272  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  27.01 
 
 		 506 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  25.68 
 
 		 506 aa  136  8e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  24.65 
 
 		 502 aa  136  9e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  26.71 
 
 		 530 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  27.38 
 
 		 498 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3518  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.95 
 
 		 530 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0855  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.95 
 
 		 530 aa  134  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3648  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.95 
 
 		 530 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  26.2 
 
 		 499 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  27.34 
 
 		 514 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4400  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.69 
 
 		 516 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4318  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.49 
 
 		 516 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4403  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.69 
 
 		 516 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00650936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  27.47 
 
 		 503 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4470  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.69 
 
 		 516 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  23.51 
 
 		 505 aa  131  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4288  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.3 
 
 		 516 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  24.57 
 
 		 509 aa  130  6e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  24.86 
 
 		 511 aa  129  8.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  21.46 
 
 		 492 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  21.46 
 
 		 492 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  23.69 
 
 		 505 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  26.99 
 
 		 499 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  23.8 
 
 		 509 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  25.05 
 
 		 493 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  24.46 
 
 		 496 aa  127  5e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  25.71 
 
 		 514 aa  126  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  26.99 
 
 		 472 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  27.09 
 
 		 508 aa  125  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  28.01 
 
 		 495 aa  124  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0049  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.79 
 
 		 517 aa  124  4e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1194  carbohydrate kinase  28.07 
 
 		 513 aa  123  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2073  carbohydrate kinase  28.07 
 
 		 513 aa  123  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20388  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1638  carbohydrate kinase  28.07 
 
 		 513 aa  123  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.241852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0300  carbohydrate kinase  28.07 
 
 		 513 aa  123  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104506  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1925  carbohydrate kinase  28.07 
 
 		 513 aa  123  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0220647  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0861  carbohydrate kinase  28.07 
 
 		 513 aa  123  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  25.29 
 
 		 514 aa  123  9e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1912  carbohydrate kinase  28.07 
 
 		 513 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314119  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3787  xylulokinase  28.6 
 
 		 520 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  27.39 
 
 		 515 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  28 
 
 		 515 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  27.39 
 
 		 515 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  27.39 
 
 		 515 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  25.05 
 
 		 538 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>