More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0855 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2124  autoinducer-2 (AI-2) kinase  77.92 
 
 
530 aa  836    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359272  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4470  autoinducer-2 (AI-2) kinase  81.4 
 
 
516 aa  867    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2135  carbohydrate kinase FGGY  78.11 
 
 
530 aa  870    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4403  autoinducer-2 (AI-2) kinase  81.4 
 
 
516 aa  867    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00650936  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1661  autoinducer-2 (AI-2) kinase  77.74 
 
 
530 aa  867    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.68331 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2147  autoinducer-2 (AI-2) kinase  78.3 
 
 
530 aa  872    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1712  autoinducer-2 (AI-2) kinase  78.11 
 
 
530 aa  869    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1593  autoinducer-2 (AI-2) kinase  78.11 
 
 
530 aa  869    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0049  autoinducer-2 (AI-2) kinase  67.44 
 
 
517 aa  711    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3518  autoinducer-2 (AI-2) kinase  99.62 
 
 
530 aa  1088    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0855  autoinducer-2 (AI-2) kinase  100 
 
 
530 aa  1090    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1382  autoinducer-2 (AI-2) kinase  82.08 
 
 
521 aa  893    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3648  autoinducer-2 (AI-2) kinase  99.43 
 
 
530 aa  1086    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4288  autoinducer-2 (AI-2) kinase  81.2 
 
 
516 aa  865    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.16033  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4318  autoinducer-2 (AI-2) kinase  81.2 
 
 
516 aa  865    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4400  autoinducer-2 (AI-2) kinase  81.4 
 
 
516 aa  867    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167986  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3538  autoinducer-2 (AI-2) kinase  78.38 
 
 
530 aa  851    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1477  autoinducer-2 (AI-2) kinase  56.54 
 
 
520 aa  621  1e-176  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0166671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3019  autoinducer-2 (AI-2) kinase  54.16 
 
 
520 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2774  autoinducer-2 (AI-2) kinase  53.29 
 
 
520 aa  571  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.235174  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3745  autoinducer-2 (AI-2) kinase  56.98 
 
 
525 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2261  autoinducer-2 (AI-2) kinase  54.46 
 
 
520 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0868353 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3017  autoinducer-2 (AI-2) kinase  53.97 
 
 
520 aa  569  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.232483  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2718  autoinducer-2 (AI-2) kinase  54.07 
 
 
522 aa  569  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2977  autoinducer-2 (AI-2) kinase  54.07 
 
 
520 aa  570  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000047226 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2698  autoinducer-2 (AI-2) kinase  54.07 
 
 
522 aa  570  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2981  autoinducer-2 (AI-2) kinase  53.38 
 
 
520 aa  571  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3506  autoinducer-2 (AI-2) kinase  51.26 
 
 
509 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3151  autoinducer-2 (AI-2) kinase  51.45 
 
 
509 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.220016 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2768  FGGY family of carbohydrate  52.52 
 
 
388 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0823721  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  29.56 
 
 
503 aa  201  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  29.62 
 
 
519 aa  184  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  28.52 
 
 
511 aa  179  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  27.13 
 
 
509 aa  179  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3079  carbohydrate kinase FGGY  31.8 
 
 
511 aa  178  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  26.35 
 
 
501 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  27.98 
 
 
518 aa  174  5e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  29.66 
 
 
512 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  27.08 
 
 
509 aa  169  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  27.5 
 
 
509 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1194  carbohydrate kinase, FGGY  27.99 
 
 
503 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5161  carbohydrate kinase FGGY  31.18 
 
 
509 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  28.88 
 
 
548 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  27.89 
 
 
538 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  28.14 
 
 
514 aa  163  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  29.28 
 
 
511 aa  162  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  28.91 
 
 
512 aa  162  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  26.45 
 
 
506 aa  162  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  27.52 
 
 
497 aa  161  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  28 
 
 
515 aa  160  5e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  28.23 
 
 
530 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  26.37 
 
 
502 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  28.06 
 
 
512 aa  156  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  29.72 
 
 
509 aa  156  9e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  27.98 
 
 
518 aa  156  9e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3610  carbohydrate kinase FGGY  30.84 
 
 
509 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  27.97 
 
 
512 aa  156  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2470  carbohydrate kinase FGGY  28.6 
 
 
515 aa  155  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  27.92 
 
 
524 aa  155  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5317  carbohydrate kinase FGGY  30.41 
 
 
509 aa  153  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  28.19 
 
 
512 aa  153  8e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  27.69 
 
 
513 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  27.69 
 
 
513 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  25.84 
 
 
500 aa  153  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  27.69 
 
 
513 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  29.18 
 
 
481 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  28.51 
 
 
519 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  27.69 
 
 
512 aa  152  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  29.45 
 
 
514 aa  152  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  27.69 
 
 
513 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  26.86 
 
 
512 aa  152  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  28.95 
 
 
514 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  27.69 
 
 
513 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  27.49 
 
 
513 aa  151  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  27.66 
 
 
513 aa  150  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  27.49 
 
 
513 aa  149  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3695  carbohydrate kinase FGGY  28.12 
 
 
502 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  28.38 
 
 
510 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  26.92 
 
 
512 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  27.51 
 
 
499 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  23.62 
 
 
496 aa  148  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  26.4 
 
 
496 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  24.36 
 
 
500 aa  147  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  29.7 
 
 
505 aa  147  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3787  xylulokinase  30.33 
 
 
520 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1560  carbohydrate kinase, FGGY  26 
 
 
519 aa  145  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  27.11 
 
 
513 aa  145  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  25.45 
 
 
505 aa  144  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  29.98 
 
 
515 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  29.98 
 
 
515 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  29.98 
 
 
515 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3936  carbohydrate kinase FGGY  26.27 
 
 
493 aa  144  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  30.19 
 
 
515 aa  143  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24960  putative carbohydrate kinase  25.64 
 
 
519 aa  143  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  25.72 
 
 
512 aa  143  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  24.05 
 
 
492 aa  143  8e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  24.05 
 
 
492 aa  143  8e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  27.24 
 
 
493 aa  143  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  26.54 
 
 
511 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  27.42 
 
 
497 aa  142  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>