More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2470 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2470  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 515 aa  1029    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  30.68 
 
 		 518 aa  252  9.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  31.26 
 
 		 499 aa  242  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  27.68 
 
 		 500 aa  237  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  31.37 
 
 		 500 aa  238  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  36.07 
 
 		 511 aa  236  7e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  31.45 
 
 		 501 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  32.93 
 
 		 511 aa  228  3e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  32.78 
 
 		 509 aa  226  6e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  28.54 
 
 		 503 aa  226  6e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  31.92 
 
 		 538 aa  226  9e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  31.64 
 
 		 496 aa  226  9e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  29.53 
 
 		 509 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  35 
 
 		 499 aa  219  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  29.49 
 
 		 492 aa  218  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  32.6 
 
 		 511 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  29.49 
 
 		 492 aa  218  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  31.3 
 
 		 515 aa  217  5e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  32.21 
 
 		 517 aa  216  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  32.21 
 
 		 517 aa  216  9e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  33.26 
 
 		 504 aa  213  7.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  29.22 
 
 		 489 aa  211  3e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  30.71 
 
 		 512 aa  210  5e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  29.43 
 
 		 530 aa  210  6e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  29.19 
 
 		 509 aa  207  4e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  33.33 
 
 		 506 aa  205  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  28.81 
 
 		 514 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  33.48 
 
 		 501 aa  205  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  31.1 
 
 		 512 aa  204  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  32.16 
 
 		 498 aa  203  7e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  32.72 
 
 		 505 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  33.1 
 
 		 472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  29.88 
 
 		 502 aa  201  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  28.38 
 
 		 497 aa  201  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  31.77 
 
 		 472 aa  200  6e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  25.34 
 
 		 496 aa  199  7.999999999999999e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  27.94 
 
 		 503 aa  198  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  32.87 
 
 		 508 aa  196  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  30.45 
 
 		 499 aa  196  9e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  31.11 
 
 		 494 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5229  xylulose kinase  31.66 
 
 		 532 aa  196  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  25.66 
 
 		 513 aa  195  2e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  28.34 
 
 		 512 aa  195  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  30.57 
 
 		 509 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  27.87 
 
 		 512 aa  194  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  28.1 
 
 		 512 aa  194  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  27.87 
 
 		 511 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  29.33 
 
 		 489 aa  193  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  29.01 
 
 		 519 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  26.54 
 
 		 517 aa  192  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  26.54 
 
 		 517 aa  192  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  30.26 
 
 		 493 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  30.26 
 
 		 493 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  30.26 
 
 		 493 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  29.94 
 
 		 493 aa  191  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  30.99 
 
 		 481 aa  190  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  27.63 
 
 		 512 aa  189  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  30 
 
 		 493 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  29.22 
 
 		 488 aa  189  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  28.17 
 
 		 511 aa  188  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  29.66 
 
 		 493 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  26.67 
 
 		 511 aa  187  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  26.46 
 
 		 511 aa  186  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  29.41 
 
 		 506 aa  186  7e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  30.55 
 
 		 506 aa  186  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  29.86 
 
 		 493 aa  186  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  29.42 
 
 		 491 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  27.52 
 
 		 506 aa  185  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  26.46 
 
 		 511 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  29.8 
 
 		 506 aa  184  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  29.32 
 
 		 493 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  28.86 
 
 		 493 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  26.26 
 
 		 511 aa  183  7e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  31.88 
 
 		 502 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  29.07 
 
 		 510 aa  182  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  25.95 
 
 		 513 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  33.33 
 
 		 508 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  28.03 
 
 		 487 aa  181  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  25.72 
 
 		 506 aa  181  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3787  xylulokinase  33.86 
 
 		 520 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  31.75 
 
 		 487 aa  180  5.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  25.75 
 
 		 513 aa  180  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  30.36 
 
 		 493 aa  180  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  25.75 
 
 		 513 aa  179  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  31.88 
 
 		 496 aa  179  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  25.75 
 
 		 513 aa  179  9e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  25.75 
 
 		 513 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  32.22 
 
 		 508 aa  179  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  25.75 
 
 		 513 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  25.45 
 
 		 512 aa  179  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  31.88 
 
 		 492 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  31.88 
 
 		 492 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  31.38 
 
 		 486 aa  178  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  28.25 
 
 		 486 aa  179  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  29.59 
 
 		 496 aa  178  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  30.44 
 
 		 484 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  27.49 
 
 		 494 aa  177  3e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  31.36 
 
 		 514 aa  177  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  30.24 
 
 		 484 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  32.45 
 
 		 492 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>