More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5229 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5229  xylulose kinase  100 
 
 		 532 aa  1097    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2975  carbohydrate kinase FGGY  44.53 
 
 		 523 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1866  carbohydrate kinase FGGY  44.36 
 
 		 520 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2596  carbohydrate kinase, FGGY  44.42 
 
 		 520 aa  447  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184923 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3072  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  42.15 
 
 		 556 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.317516  normal  0.334528 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1655  carbohydrate kinase, FGGY  43.86 
 
 		 549 aa  405  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0424957  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2561  carbohydrate kinase FGGY  35.67 
 
 		 524 aa  334  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154442  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0307  carbohydrate kinase  38.67 
 
 		 641 aa  329  9e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2920  carbohydrate kinase  37.36 
 
 		 537 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375466  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1144  xylulose kinase  37.16 
 
 		 537 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2764  carbohydrate kinase  37.43 
 
 		 537 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  27.64 
 
 		 503 aa  219  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  29.62 
 
 		 509 aa  206  6e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  30.78 
 
 		 518 aa  203  7e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  30.02 
 
 		 500 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  31.57 
 
 		 509 aa  201  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  28.96 
 
 		 548 aa  200  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  28 
 
 		 497 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  28.85 
 
 		 501 aa  196  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  32.09 
 
 		 511 aa  192  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  28.35 
 
 		 492 aa  187  6e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  28.35 
 
 		 492 aa  187  6e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2470  carbohydrate kinase FGGY  31.66 
 
 		 515 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  28.74 
 
 		 506 aa  182  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  28.16 
 
 		 506 aa  182  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  28.54 
 
 		 499 aa  182  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  28.11 
 
 		 499 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  27.45 
 
 		 500 aa  179  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  26.78 
 
 		 511 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  27.55 
 
 		 502 aa  174  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  28.49 
 
 		 512 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  27.06 
 
 		 509 aa  170  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  28.94 
 
 		 496 aa  170  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  28.06 
 
 		 514 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  28.57 
 
 		 515 aa  169  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  26.59 
 
 		 496 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  27.59 
 
 		 512 aa  167  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  28.29 
 
 		 487 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  29.14 
 
 		 511 aa  166  6.9999999999999995e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  27.03 
 
 		 538 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  26.99 
 
 		 489 aa  166  9e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  28.94 
 
 		 502 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  28.14 
 
 		 506 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  28.08 
 
 		 496 aa  164  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  25.78 
 
 		 514 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2407  carbohydrate kinase, FGGY  30.97 
 
 		 487 aa  163  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.242819  normal  0.388769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  28.05 
 
 		 493 aa  163  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  25.75 
 
 		 512 aa  163  7e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  28.79 
 
 		 514 aa  163  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  25.37 
 
 		 518 aa  162  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  25.57 
 
 		 509 aa  162  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1560  carbohydrate kinase, FGGY  26.14 
 
 		 519 aa  160  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  29.43 
 
 		 506 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1344  carbohydrate kinase, FGGY  27.24 
 
 		 519 aa  160  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.789365  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  25.28 
 
 		 512 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  24.95 
 
 		 506 aa  159  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  24.81 
 
 		 513 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  24.81 
 
 		 513 aa  158  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  24.2 
 
 		 505 aa  158  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2334  carbohydrate kinase, FGGY  26.55 
 
 		 519 aa  158  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  24.81 
 
 		 513 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  28.33 
 
 		 511 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  27.88 
 
 		 504 aa  159  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  24.81 
 
 		 513 aa  158  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  24.81 
 
 		 513 aa  158  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  27.59 
 
 		 495 aa  158  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  27.75 
 
 		 517 aa  157  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  24.72 
 
 		 513 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2625  carbohydrate kinase, FGGY  28.08 
 
 		 505 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  29.66 
 
 		 491 aa  156  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  24.63 
 
 		 513 aa  156  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0137  carbohydrate kinase  27.27 
 
 		 519 aa  156  9e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  27.61 
 
 		 496 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  28.14 
 
 		 493 aa  156  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  25 
 
 		 530 aa  156  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  24.62 
 
 		 513 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  27.56 
 
 		 517 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  26 
 
 		 505 aa  155  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  29.94 
 
 		 493 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  24.07 
 
 		 512 aa  154  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  23.18 
 
 		 513 aa  154  5e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  29.66 
 
 		 493 aa  154  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  28.93 
 
 		 493 aa  153  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  28.93 
 
 		 493 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  28.63 
 
 		 493 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  26.26 
 
 		 494 aa  152  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  27.05 
 
 		 497 aa  152  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  29.76 
 
 		 493 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  28.77 
 
 		 498 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  24.81 
 
 		 506 aa  152  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  29.76 
 
 		 493 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  28.44 
 
 		 493 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  25.34 
 
 		 519 aa  151  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  26.86 
 
 		 512 aa  151  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  28.84 
 
 		 515 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  28.84 
 
 		 515 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  28.84 
 
 		 515 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  27.6 
 
 		 488 aa  151  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  23.91 
 
 		 517 aa  150  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  23.91 
 
 		 517 aa  150  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>