More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1144 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1144  xylulose kinase  100 
 
 
537 aa  1082    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0307  carbohydrate kinase  90.17 
 
 
641 aa  933    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2920  carbohydrate kinase  99.26 
 
 
537 aa  1077    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375466  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2764  carbohydrate kinase  99.44 
 
 
537 aa  1079    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2596  carbohydrate kinase, FGGY  37.72 
 
 
520 aa  335  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.184923 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1866  carbohydrate kinase FGGY  37.72 
 
 
520 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5229  xylulose kinase  37.48 
 
 
532 aa  327  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2975  carbohydrate kinase FGGY  37.62 
 
 
523 aa  322  7e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2561  carbohydrate kinase FGGY  37.12 
 
 
524 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154442  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3072  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  37.36 
 
 
556 aa  303  5.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.317516  normal  0.334528 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1655  carbohydrate kinase, FGGY  37.45 
 
 
549 aa  301  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0424957  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  24.86 
 
 
496 aa  179  8e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  26.33 
 
 
501 aa  173  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  25.23 
 
 
518 aa  173  9e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  26.25 
 
 
499 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  31.13 
 
 
548 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2334  carbohydrate kinase, FGGY  28.7 
 
 
519 aa  172  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  28.66 
 
 
512 aa  172  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  29.8 
 
 
514 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  23.22 
 
 
492 aa  170  5e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  23.22 
 
 
492 aa  170  5e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  29.37 
 
 
514 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  31.36 
 
 
481 aa  169  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  28.27 
 
 
519 aa  167  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  27.52 
 
 
489 aa  163  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  26.83 
 
 
503 aa  163  8.000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  24.67 
 
 
514 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  23.7 
 
 
500 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  26.23 
 
 
497 aa  161  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  29.06 
 
 
509 aa  160  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  32.1 
 
 
515 aa  160  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  29.7 
 
 
515 aa  159  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  25.79 
 
 
530 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  30.8 
 
 
515 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4197  xylulokinase  32.1 
 
 
515 aa  158  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  27.81 
 
 
499 aa  157  4e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  24.72 
 
 
513 aa  157  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  23.74 
 
 
512 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  29.15 
 
 
511 aa  157  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3787  xylulokinase  31.89 
 
 
520 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1560  carbohydrate kinase, FGGY  26.67 
 
 
519 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  24.91 
 
 
509 aa  154  4e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  24.29 
 
 
513 aa  154  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  24.29 
 
 
513 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  24.29 
 
 
513 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  24.48 
 
 
513 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  24.29 
 
 
513 aa  153  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  24.34 
 
 
513 aa  153  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  27.04 
 
 
499 aa  153  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  31.83 
 
 
515 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  31.83 
 
 
515 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  27.33 
 
 
538 aa  152  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  31.83 
 
 
515 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  24.25 
 
 
512 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  24.33 
 
 
500 aa  151  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1194  carbohydrate kinase  31.82 
 
 
513 aa  150  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2073  carbohydrate kinase  31.82 
 
 
513 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20388  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1638  carbohydrate kinase  31.82 
 
 
513 aa  150  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.241852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0300  carbohydrate kinase  31.82 
 
 
513 aa  150  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104506  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1925  carbohydrate kinase  31.82 
 
 
513 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0220647  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0861  carbohydrate kinase  31.82 
 
 
513 aa  150  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  23.05 
 
 
505 aa  150  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  26.71 
 
 
496 aa  149  9e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  30.53 
 
 
499 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1912  carbohydrate kinase  31.82 
 
 
513 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314119  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  22.85 
 
 
513 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  22.86 
 
 
512 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  24.24 
 
 
506 aa  149  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1344  carbohydrate kinase, FGGY  25.66 
 
 
519 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.789365  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  22.87 
 
 
505 aa  147  5e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  23.77 
 
 
513 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0411  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  28.24 
 
 
495 aa  146  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  22.12 
 
 
512 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  27.19 
 
 
498 aa  145  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  22.12 
 
 
511 aa  145  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  28.95 
 
 
524 aa  144  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  23.86 
 
 
509 aa  144  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2431  carbohydrate kinase  32.46 
 
 
514 aa  143  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  28.46 
 
 
484 aa  143  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2470  carbohydrate kinase FGGY  29.21 
 
 
515 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  22.49 
 
 
512 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  22.06 
 
 
512 aa  141  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  28.04 
 
 
508 aa  141  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  24.63 
 
 
499 aa  141  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  24.05 
 
 
490 aa  141  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2134  putative carbohydrate kinase  26.9 
 
 
520 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  28.94 
 
 
504 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3424  carbohydrate kinase FGGY  27.71 
 
 
438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000031899  hitchhiker  0.000118115 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  27.5 
 
 
512 aa  140  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0137  carbohydrate kinase  23.65 
 
 
519 aa  140  7e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  24.24 
 
 
509 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  28.32 
 
 
497 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  27.26 
 
 
489 aa  137  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  28.98 
 
 
505 aa  137  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  23.72 
 
 
511 aa  137  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24960  putative carbohydrate kinase  26.21 
 
 
519 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  28.38 
 
 
506 aa  137  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  23.42 
 
 
489 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  26.03 
 
 
496 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  23.59 
 
 
509 aa  135  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>