More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2596 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2596  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 		 520 aa  1048    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184923 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1866  carbohydrate kinase FGGY  83.27 
 
 		 520 aa  878    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3072  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  54.13 
 
 		 556 aa  526  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.317516  normal  0.334528 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2975  carbohydrate kinase FGGY  46.18 
 
 		 523 aa  464  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5229  xylulose kinase  44.42 
 
 		 532 aa  447  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1655  carbohydrate kinase, FGGY  47.62 
 
 		 549 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0424957  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2561  carbohydrate kinase FGGY  43.55 
 
 		 524 aa  411  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154442  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0307  carbohydrate kinase  36.97 
 
 		 641 aa  325  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1144  xylulose kinase  37.72 
 
 		 537 aa  317  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2920  carbohydrate kinase  37.72 
 
 		 537 aa  316  7e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375466  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2764  carbohydrate kinase  37.52 
 
 		 537 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  32.31 
 
 		 511 aa  204  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  29.68 
 
 		 500 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  32.7 
 
 		 498 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  27.78 
 
 		 501 aa  187  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  29.56 
 
 		 530 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  30.7 
 
 		 509 aa  183  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  26.35 
 
 		 497 aa  181  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  28.49 
 
 		 518 aa  180  4.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  28.51 
 
 		 499 aa  176  9e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  26.62 
 
 		 503 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  27.29 
 
 		 509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  28.63 
 
 		 496 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  31.46 
 
 		 512 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  28.22 
 
 		 515 aa  173  5.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  31.41 
 
 		 504 aa  173  7.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  26.34 
 
 		 513 aa  172  9e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  25.29 
 
 		 509 aa  172  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  27.62 
 
 		 514 aa  172  9e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  25.73 
 
 		 511 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  30.87 
 
 		 506 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  27.06 
 
 		 496 aa  171  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  25.73 
 
 		 511 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  30.51 
 
 		 481 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  25.73 
 
 		 511 aa  171  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  27.64 
 
 		 499 aa  171  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  27.17 
 
 		 502 aa  169  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  28.65 
 
 		 511 aa  169  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  28.76 
 
 		 548 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  29.81 
 
 		 487 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  29.03 
 
 		 510 aa  167  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  24.95 
 
 		 511 aa  167  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3807  xylulokinase  28.93 
 
 		 481 aa  166  6.9999999999999995e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  25.68 
 
 		 492 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  25.68 
 
 		 492 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  25.62 
 
 		 506 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  28.79 
 
 		 486 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  27.29 
 
 		 489 aa  163  7e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  28.68 
 
 		 497 aa  163  7e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  29.5 
 
 		 496 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  25.38 
 
 		 500 aa  162  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  30.04 
 
 		 505 aa  160  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  25.67 
 
 		 511 aa  160  8e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  29.18 
 
 		 512 aa  159  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  27.26 
 
 		 519 aa  158  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  25.52 
 
 		 490 aa  158  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  26.83 
 
 		 512 aa  159  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  25.76 
 
 		 506 aa  158  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  26.86 
 
 		 488 aa  157  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  26.45 
 
 		 538 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  25.52 
 
 		 506 aa  156  8e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  27.97 
 
 		 484 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  26.73 
 
 		 484 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  28.03 
 
 		 483 aa  155  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  26.54 
 
 		 484 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  27.19 
 
 		 512 aa  154  2.9999999999999998e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  29.5 
 
 		 491 aa  154  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  28.03 
 
 		 517 aa  154  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  28.63 
 
 		 484 aa  154  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  28.29 
 
 		 485 aa  154  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  27.98 
 
 		 517 aa  153  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  27.76 
 
 		 511 aa  153  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  26.35 
 
 		 484 aa  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  28.79 
 
 		 493 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  27.7 
 
 		 514 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  30.58 
 
 		 515 aa  152  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  29.31 
 
 		 472 aa  152  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  28.41 
 
 		 493 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  28.41 
 
 		 493 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  28.38 
 
 		 493 aa  151  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0853  xylulokinase  28.71 
 
 		 492 aa  150  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985754  normal  0.66346 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  26.03 
 
 		 499 aa  150  5e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  28.21 
 
 		 493 aa  150  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  24.23 
 
 		 517 aa  149  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  24.23 
 
 		 517 aa  149  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  28.44 
 
 		 505 aa  149  9e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  27.26 
 
 		 508 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  28.02 
 
 		 493 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  28.6 
 
 		 493 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  27.12 
 
 		 495 aa  149  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0150  gluconate kinase  26.77 
 
 		 427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.731797  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  27.7 
 
 		 484 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1235  xylulokinase  28.98 
 
 		 480 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.757817  normal  0.113808 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  27.7 
 
 		 484 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  27.7 
 
 		 484 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2134  putative carbohydrate kinase  27.74 
 
 		 520 aa  146  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  27.7 
 
 		 484 aa  145  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  27.7 
 
 		 484 aa  146  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  27.7 
 
 		 484 aa  146  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  29.12 
 
 		 486 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>