More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1655 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1655  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 		 549 aa  1090    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0424957  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1866  carbohydrate kinase FGGY  48 
 
 		 520 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3072  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  49.52 
 
 		 556 aa  468  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.317516  normal  0.334528 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2596  carbohydrate kinase, FGGY  47.62 
 
 		 520 aa  456  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184923 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5229  xylulose kinase  43.86 
 
 		 532 aa  447  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2561  carbohydrate kinase FGGY  45.39 
 
 		 524 aa  436  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154442  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2975  carbohydrate kinase FGGY  41.06 
 
 		 523 aa  421  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0307  carbohydrate kinase  37.94 
 
 		 641 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1144  xylulose kinase  37.52 
 
 		 537 aa  302  9e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2920  carbohydrate kinase  37.34 
 
 		 537 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375466  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2764  carbohydrate kinase  37.22 
 
 		 537 aa  300  7e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  26.26 
 
 		 500 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  29.01 
 
 		 500 aa  193  7e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  28.52 
 
 		 496 aa  191  4e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  30.57 
 
 		 518 aa  190  5e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  31.26 
 
 		 538 aa  190  7e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  31.18 
 
 		 510 aa  189  8e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  29.36 
 
 		 499 aa  189  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  29.25 
 
 		 509 aa  189  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  26.49 
 
 		 492 aa  187  4e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  26.49 
 
 		 492 aa  187  4e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  26.77 
 
 		 503 aa  186  9e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  30.76 
 
 		 548 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  32.43 
 
 		 511 aa  186  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  30.4 
 
 		 496 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  28.73 
 
 		 502 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  32.71 
 
 		 481 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  31 
 
 		 497 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  29.49 
 
 		 488 aa  182  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  31.86 
 
 		 505 aa  182  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  26.72 
 
 		 509 aa  180  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  31.23 
 
 		 496 aa  179  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  29.45 
 
 		 511 aa  179  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  31.6 
 
 		 506 aa  178  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  31.6 
 
 		 509 aa  178  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  28.21 
 
 		 514 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  24.25 
 
 		 505 aa  178  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  31.27 
 
 		 504 aa  176  9e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2470  carbohydrate kinase FGGY  30.64 
 
 		 515 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  32.5 
 
 		 506 aa  174  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  26.52 
 
 		 486 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  28.03 
 
 		 499 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  30.92 
 
 		 499 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  28.81 
 
 		 502 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  27.17 
 
 		 501 aa  171  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  28.21 
 
 		 505 aa  171  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  27.81 
 
 		 509 aa  170  7e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  25.86 
 
 		 499 aa  169  9e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  28.78 
 
 		 493 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  29.17 
 
 		 487 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  28.65 
 
 		 505 aa  167  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  30.15 
 
 		 491 aa  167  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  30.26 
 
 		 515 aa  167  5e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1344  carbohydrate kinase, FGGY  28.39 
 
 		 519 aa  167  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.789365  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  26.88 
 
 		 530 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  30.49 
 
 		 512 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  30.48 
 
 		 508 aa  166  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  25.71 
 
 		 506 aa  165  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  26.91 
 
 		 497 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  28.97 
 
 		 493 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  29.48 
 
 		 496 aa  164  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  28.6 
 
 		 495 aa  164  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  29.05 
 
 		 512 aa  164  5.0000000000000005e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  28.6 
 
 		 512 aa  164  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  26.58 
 
 		 489 aa  163  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  28.12 
 
 		 519 aa  163  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  26.93 
 
 		 506 aa  163  7e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  24.25 
 
 		 512 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  26.89 
 
 		 519 aa  163  8.000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  24.14 
 
 		 511 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2134  putative carbohydrate kinase  28.1 
 
 		 520 aa  163  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  29.3 
 
 		 493 aa  163  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  32.32 
 
 		 498 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  30.34 
 
 		 498 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  29.3 
 
 		 493 aa  163  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  28.65 
 
 		 511 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  29.12 
 
 		 493 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  31.24 
 
 		 514 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  32.2 
 
 		 499 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  29.3 
 
 		 493 aa  161  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  29.3 
 
 		 493 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  27.31 
 
 		 506 aa  161  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  28.94 
 
 		 493 aa  161  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1560  carbohydrate kinase, FGGY  27.72 
 
 		 519 aa  160  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  29.37 
 
 		 493 aa  160  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2615  carbohydrate kinase FGGY  29.29 
 
 		 520 aa  160  6e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  32.58 
 
 		 515 aa  160  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  24.81 
 
 		 490 aa  159  9e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  24.25 
 
 		 512 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  29.28 
 
 		 517 aa  159  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  31.05 
 
 		 524 aa  159  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  29.01 
 
 		 493 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  27.93 
 
 		 494 aa  159  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  29.1 
 
 		 517 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  24.44 
 
 		 512 aa  157  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24960  putative carbohydrate kinase  27.54 
 
 		 519 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  29.33 
 
 		 490 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  29.33 
 
 		 490 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  29.33 
 
 		 490 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  32.96 
 
 		 472 aa  157  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>