More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3072 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3072  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  100 
 
 
556 aa  1118    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.317516  normal  0.334528 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2596  carbohydrate kinase, FGGY  54.13 
 
 
520 aa  547  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.184923 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1866  carbohydrate kinase FGGY  54.13 
 
 
520 aa  543  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2975  carbohydrate kinase FGGY  46.1 
 
 
523 aa  478  1e-134  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1655  carbohydrate kinase, FGGY  49.52 
 
 
549 aa  457  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0424957  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5229  xylulose kinase  42.15 
 
 
532 aa  431  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2561  carbohydrate kinase FGGY  40.53 
 
 
524 aa  383  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154442  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0307  carbohydrate kinase  38.51 
 
 
641 aa  325  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1144  xylulose kinase  37.36 
 
 
537 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2920  carbohydrate kinase  37.36 
 
 
537 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375466  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2764  carbohydrate kinase  37.43 
 
 
537 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  32.57 
 
 
518 aa  212  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  31.25 
 
 
499 aa  211  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  28.49 
 
 
509 aa  201  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  32.68 
 
 
515 aa  200  5e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  31.51 
 
 
530 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  29.6 
 
 
500 aa  193  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  33.59 
 
 
511 aa  193  6e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  29.51 
 
 
502 aa  193  7e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  27.79 
 
 
501 aa  192  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  25.62 
 
 
500 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  31.13 
 
 
509 aa  187  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  28.49 
 
 
503 aa  186  7e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  27.12 
 
 
496 aa  186  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  30.41 
 
 
514 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  26.51 
 
 
513 aa  184  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  32.16 
 
 
512 aa  184  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  30.4 
 
 
548 aa  183  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  28.63 
 
 
509 aa  181  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  27.41 
 
 
492 aa  182  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  27.41 
 
 
492 aa  182  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  32.04 
 
 
506 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  32.38 
 
 
504 aa  179  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  25.52 
 
 
517 aa  177  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  25.52 
 
 
517 aa  177  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  30.04 
 
 
496 aa  177  6e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  30.6 
 
 
511 aa  175  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  30.21 
 
 
519 aa  174  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  26.89 
 
 
503 aa  174  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2470  carbohydrate kinase FGGY  30.63 
 
 
515 aa  169  8e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  29.85 
 
 
486 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  28.43 
 
 
512 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  31.06 
 
 
496 aa  168  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  30.38 
 
 
493 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  29.3 
 
 
497 aa  167  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  25.73 
 
 
497 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  28.92 
 
 
496 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  25.38 
 
 
506 aa  166  9e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  28.24 
 
 
512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  28.24 
 
 
511 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  26.86 
 
 
512 aa  165  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  27.85 
 
 
512 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  30.77 
 
 
493 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  31.89 
 
 
498 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  25.82 
 
 
490 aa  163  9e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  28.05 
 
 
512 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  29.87 
 
 
502 aa  160  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  25.57 
 
 
506 aa  160  7e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  31.31 
 
 
491 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  26.19 
 
 
499 aa  158  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  30.27 
 
 
499 aa  159  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  26.25 
 
 
489 aa  157  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2839  xylulokinase  32.05 
 
 
478 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  29.03 
 
 
487 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  30.89 
 
 
493 aa  156  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  23.11 
 
 
506 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0028  xylulokinase  28.93 
 
 
483 aa  155  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.237536  normal  0.287388 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  30.31 
 
 
494 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  29.06 
 
 
538 aa  155  1e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  25.86 
 
 
511 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  26.05 
 
 
511 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  25.67 
 
 
511 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  27.96 
 
 
482 aa  155  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  31.4 
 
 
493 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  27.79 
 
 
499 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  25.86 
 
 
511 aa  154  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  23.9 
 
 
505 aa  154  5e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1177  xylulose kinase  32.21 
 
 
478 aa  153  8e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  25.62 
 
 
513 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  25.52 
 
 
513 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  25.95 
 
 
513 aa  153  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  29.89 
 
 
505 aa  153  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  25.62 
 
 
513 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  25.71 
 
 
513 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  25.71 
 
 
513 aa  152  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  25.71 
 
 
513 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  28.96 
 
 
483 aa  152  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  25.87 
 
 
494 aa  152  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  28.27 
 
 
495 aa  151  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  25.71 
 
 
513 aa  151  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  30.44 
 
 
481 aa  151  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  28.32 
 
 
512 aa  150  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  30.89 
 
 
493 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  28.01 
 
 
508 aa  150  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  30 
 
 
493 aa  150  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  30.89 
 
 
493 aa  150  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  29.71 
 
 
485 aa  150  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  30 
 
 
493 aa  150  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  28.9 
 
 
509 aa  150  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  29.59 
 
 
484 aa  150  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0856501 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>