More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6143 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  59.17 
 
 		 513 aa  659    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  57.14 
 
 		 511 aa  637    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  58.38 
 
 		 513 aa  653    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  57.34 
 
 		 511 aa  636    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  58.58 
 
 		 513 aa  653    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  57.73 
 
 		 511 aa  642    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  58.78 
 
 		 513 aa  655    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  57.53 
 
 		 511 aa  639    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  58.38 
 
 		 513 aa  653    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  58.97 
 
 		 513 aa  657    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  58.78 
 
 		 512 aa  651    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  100 
 
 		 519 aa  1049    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  58.58 
 
 		 513 aa  652    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  58.78 
 
 		 513 aa  659    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  58.78 
 
 		 512 aa  655    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  55.12 
 
 		 517 aa  611  1e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  55.12 
 
 		 517 aa  611  1e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  51.77 
 
 		 513 aa  587  1e-166  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  52.28 
 
 		 512 aa  566  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  55.45 
 
 		 514 aa  567  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  51.49 
 
 		 512 aa  560  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  53.53 
 
 		 530 aa  559  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  50.89 
 
 		 511 aa  553  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  50.89 
 
 		 512 aa  553  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  50.89 
 
 		 512 aa  551  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  50.2 
 
 		 518 aa  535  1e-151  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  51.19 
 
 		 512 aa  525  1e-148  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  48.31 
 
 		 506 aa  520  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  45.56 
 
 		 499 aa  462  1e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  44.55 
 
 		 509 aa  454  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  44.16 
 
 		 509 aa  449  1e-125  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0164  gluconate kinase, C-terminus  60.18 
 
 		 333 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3301  carbohydrate kinase FGGY  48.6 
 
 		 501 aa  427  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  48.4 
 
 		 524 aa  418  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  47.25 
 
 		 526 aa  401  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  41.98 
 
 		 486 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0347  gluconate kinase  37.62 
 
 		 502 aa  382  1e-105  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00095541 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  41.28 
 
 		 489 aa  378  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0411  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  43.15 
 
 		 495 aa  362  6e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2151  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  42.66 
 
 		 530 aa  343  4e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0219  carbohydrate kinase FGGY  40.38 
 
 		 476 aa  298  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11390  pentulose/hexulose kinase  40.74 
 
 		 513 aa  291  2e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0344488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0492  carbohydrate kinase FGGY  33.93 
 
 		 476 aa  287  4e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0477  carbohydrate kinase, FGGY  33.93 
 
 		 476 aa  287  4e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  40.15 
 
 		 483 aa  273  7e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.182066  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  32.55 
 
 		 518 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  34.12 
 
 		 509 aa  261  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  31.23 
 
 		 509 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  27.83 
 
 		 505 aa  249  1e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  30.55 
 
 		 502 aa  246  8e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  29.82 
 
 		 497 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  33.13 
 
 		 515 aa  246  9.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  33.8 
 
 		 512 aa  244  3e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  31.47 
 
 		 538 aa  241  2e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  31.49 
 
 		 499 aa  241  2e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  28.74 
 
 		 500 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  27.7 
 
 		 500 aa  237  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  28.94 
 
 		 501 aa  237  4e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  31.29 
 
 		 511 aa  236  6e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  28.86 
 
 		 503 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  32.46 
 
 		 511 aa  233  6e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  27.29 
 
 		 492 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  27.29 
 
 		 492 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  28.38 
 
 		 505 aa  233  8.000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  28.96 
 
 		 512 aa  233  8.000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1616  carbohydrate kinase, FGGY  32.43 
 
 		 510 aa  233  8.000000000000001e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0809365  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  30.31 
 
 		 519 aa  231  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  34.1 
 
 		 511 aa  229  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  33.62 
 
 		 499 aa  229  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  33.94 
 
 		 517 aa  228  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  33.94 
 
 		 517 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  33.94 
 
 		 508 aa  228  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  33.2 
 
 		 506 aa  228  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  28.37 
 
 		 509 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  28.52 
 
 		 503 aa  225  1e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0196  carbohydrate kinase FGGY  29.84 
 
 		 496 aa  225  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  26.95 
 
 		 506 aa  220  5e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  33.4 
 
 		 514 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  29.88 
 
 		 496 aa  216  7e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  31.26 
 
 		 512 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3787  xylulokinase  35.57 
 
 		 520 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  33.92 
 
 		 515 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  33.92 
 
 		 515 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  33.92 
 
 		 515 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  32.32 
 
 		 504 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  27.94 
 
 		 496 aa  213  7e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  31.92 
 
 		 498 aa  211  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  31.67 
 
 		 505 aa  209  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4197  xylulokinase  33.6 
 
 		 515 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3585  carbohydrate kinase, FGGY  32.1 
 
 		 494 aa  207  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.857357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  26.95 
 
 		 511 aa  206  6e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  33.01 
 
 		 515 aa  206  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  27.13 
 
 		 506 aa  205  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  33.6 
 
 		 515 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0163  gluconate kinase, N-terminus  53.63 
 
 		 176 aa  204  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  31.74 
 
 		 514 aa  203  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  29.64 
 
 		 506 aa  202  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  27.33 
 
 		 506 aa  200  6e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1912  carbohydrate kinase  35.6 
 
 		 513 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0861  carbohydrate kinase  35.75 
 
 		 513 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>