More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2898 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  100 
 
 		 481 aa  911    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  60.71 
 
 		 472 aa  490  1e-137  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  59.41 
 
 		 472 aa  481  1e-134  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2478  carbohydrate kinase FGGY  46.27 
 
 		 477 aa  364  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  35.92 
 
 		 501 aa  342  1e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  38.07 
 
 		 518 aa  330  3e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0482  carbohydrate kinase FGGY  45.11 
 
 		 474 aa  330  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.652792  hitchhiker  0.00292056 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0712  putative sugar kinase protein  45.34 
 
 		 481 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  38.56 
 
 		 496 aa  325  1e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3254  carbohydrate kinase FGGY  43.64 
 
 		 506 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  34.89 
 
 		 500 aa  323  3e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  34.28 
 
 		 492 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  34.28 
 
 		 492 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1575  putative sugar kinase protein  48.1 
 
 		 478 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0212935  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  42.71 
 
 		 498 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0864  carbohydrate kinase  45.15 
 
 		 474 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1022  xylulose kinase  48.43 
 
 		 474 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0859  carbohydrate kinase  48.43 
 
 		 474 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0692  carbohydrate kinase FGGY  46.28 
 
 		 478 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.93533 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2525  carbohydrate kinase FGGY  47.12 
 
 		 503 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49855  normal  0.157828 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  39.4 
 
 		 512 aa  309  6.999999999999999e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2629  carbohydrate kinase FGGY  46.31 
 
 		 483 aa  309  8e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  40.96 
 
 		 509 aa  308  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1995  carbohydrate kinase, FGGY  46.91 
 
 		 483 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2605  carbohydrate kinase, FGGY  46.91 
 
 		 483 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  41.28 
 
 		 511 aa  307  3e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0684  xylulokinase  49.02 
 
 		 524 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.956416  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  35.73 
 
 		 509 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5936  carbohydrate kinase, FGGY  48.79 
 
 		 488 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2652  carbohydrate kinase, FGGY  46.69 
 
 		 488 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857808  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  36.27 
 
 		 511 aa  297  3e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  32.41 
 
 		 509 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  43.6 
 
 		 499 aa  286  8e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  40.24 
 
 		 506 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  37.15 
 
 		 505 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  35.54 
 
 		 515 aa  283  5.000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  39.55 
 
 		 504 aa  282  8.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  37.6 
 
 		 484 aa  282  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0853  xylulokinase  39.18 
 
 		 492 aa  282  1e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985754  normal  0.66346 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  31.34 
 
 		 490 aa  281  2e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  32 
 
 		 502 aa  279  8e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  38.37 
 
 		 499 aa  277  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  37.12 
 
 		 484 aa  276  6e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  33.54 
 
 		 494 aa  275  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  38.66 
 
 		 485 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  30.16 
 
 		 489 aa  274  3e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  35.26 
 
 		 483 aa  274  3e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  36.83 
 
 		 511 aa  273  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  38.52 
 
 		 493 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  31.99 
 
 		 499 aa  272  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  36.4 
 
 		 517 aa  271  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  36.4 
 
 		 517 aa  270  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  37.78 
 
 		 496 aa  270  5e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  37.83 
 
 		 483 aa  268  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  38.11 
 
 		 493 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  38.11 
 
 		 493 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  37.63 
 
 		 483 aa  266  5.999999999999999e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  29.59 
 
 		 500 aa  264  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  37.5 
 
 		 493 aa  263  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  37.91 
 
 		 493 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  38.8 
 
 		 493 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  36.71 
 
 		 489 aa  263  4.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  36.73 
 
 		 494 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  37.63 
 
 		 491 aa  262  8.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  37.15 
 
 		 485 aa  261  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  32.44 
 
 		 488 aa  261  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  37.17 
 
 		 485 aa  261  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  34.76 
 
 		 487 aa  261  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  39.24 
 
 		 496 aa  261  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  37.7 
 
 		 493 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  37.83 
 
 		 493 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  38.41 
 
 		 493 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  29.94 
 
 		 496 aa  256  4e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  35.31 
 
 		 482 aa  256  5e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  36.75 
 
 		 486 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  38.83 
 
 		 490 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  38.83 
 
 		 490 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  38.83 
 
 		 490 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  38.83 
 
 		 490 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  38.55 
 
 		 484 aa  252  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  34.85 
 
 		 484 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  37.8 
 
 		 487 aa  251  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  35.6 
 
 		 484 aa  251  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  36.98 
 
 		 485 aa  251  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  35.38 
 
 		 484 aa  250  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0028  xylulokinase  35.34 
 
 		 483 aa  249  6e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.237536  normal  0.287388 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  35.58 
 
 		 486 aa  249  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  38.55 
 
 		 493 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  38.55 
 
 		 493 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  36.79 
 
 		 493 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  34.85 
 
 		 484 aa  248  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  32.78 
 
 		 486 aa  248  1e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  38.55 
 
 		 493 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  35.11 
 
 		 484 aa  249  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  35.48 
 
 		 483 aa  248  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  38.02 
 
 		 492 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  35.11 
 
 		 484 aa  247  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  35.11 
 
 		 484 aa  247  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  35.11 
 
 		 484 aa  247  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  33.74 
 
 		 484 aa  247  4e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>