More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2058 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  100 
 
 
513 aa  1067    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  58.3 
 
 
511 aa  652    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  58.7 
 
 
511 aa  659    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  76.02 
 
 
517 aa  852    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  58.89 
 
 
511 aa  660    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  76.02 
 
 
517 aa  852    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  58.7 
 
 
511 aa  657    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  57.48 
 
 
513 aa  627  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  57.09 
 
 
513 aa  625  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  57.09 
 
 
513 aa  626  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  57.28 
 
 
513 aa  627  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  57.28 
 
 
513 aa  625  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  57.28 
 
 
513 aa  625  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  57.09 
 
 
513 aa  626  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  57.48 
 
 
513 aa  627  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  57.09 
 
 
512 aa  619  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  55.51 
 
 
512 aa  609  1e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  51.77 
 
 
519 aa  587  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  49.51 
 
 
530 aa  536  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  49.8 
 
 
518 aa  532  1e-150  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  49.9 
 
 
514 aa  532  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  48.92 
 
 
512 aa  519  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  48.13 
 
 
512 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  48.22 
 
 
511 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  48.13 
 
 
512 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  47.93 
 
 
512 aa  512  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  48.84 
 
 
499 aa  513  1e-144  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  47.55 
 
 
512 aa  506  9.999999999999999e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0164  gluconate kinase, C-terminus  65.24 
 
 
333 aa  481  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  44.77 
 
 
506 aa  474  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  41.57 
 
 
509 aa  463  1e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  41.68 
 
 
509 aa  461  9.999999999999999e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  40 
 
 
524 aa  405  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0347  gluconate kinase  40.2 
 
 
502 aa  401  9.999999999999999e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00095541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3301  carbohydrate kinase FGGY  39.6 
 
 
501 aa  392  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  38.83 
 
 
486 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  38.11 
 
 
526 aa  365  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  38.32 
 
 
489 aa  354  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0411  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  35.32 
 
 
495 aa  332  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0477  carbohydrate kinase, FGGY  34.34 
 
 
476 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0492  carbohydrate kinase FGGY  34.34 
 
 
476 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2151  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  36.93 
 
 
530 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11390  pentulose/hexulose kinase  35.01 
 
 
513 aa  286  4e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0344488  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0219  carbohydrate kinase FGGY  33.47 
 
 
476 aa  267  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  30.82 
 
 
500 aa  264  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  31.38 
 
 
505 aa  263  6e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  29.55 
 
 
509 aa  263  8e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  30.6 
 
 
515 aa  262  8e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  29.64 
 
 
502 aa  258  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  30.46 
 
 
518 aa  257  3e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  29.02 
 
 
501 aa  257  4e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  30.96 
 
 
512 aa  250  4e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  28.88 
 
 
509 aa  249  7e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  32.09 
 
 
506 aa  248  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  32.9 
 
 
483 aa  247  4e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.182066  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  30.43 
 
 
506 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  30.1 
 
 
511 aa  243  6e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  27.42 
 
 
497 aa  243  7e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  30.11 
 
 
509 aa  239  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  31.09 
 
 
504 aa  238  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  27.24 
 
 
512 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  28.49 
 
 
511 aa  233  6e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  29.38 
 
 
500 aa  233  9e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  28.66 
 
 
506 aa  231  3e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  30.66 
 
 
508 aa  230  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  27.59 
 
 
503 aa  230  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  30.61 
 
 
505 aa  229  8e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  29.63 
 
 
499 aa  228  2e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  28.41 
 
 
519 aa  226  7e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  29.28 
 
 
514 aa  226  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  32.24 
 
 
499 aa  226  9e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  30.43 
 
 
506 aa  224  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  31.58 
 
 
514 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  28.96 
 
 
503 aa  223  4.9999999999999996e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  28.21 
 
 
492 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1616  carbohydrate kinase, FGGY  28.71 
 
 
510 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0809365  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  28.21 
 
 
492 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0861  carbohydrate kinase  30.8 
 
 
513 aa  221  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1194  carbohydrate kinase  30.8 
 
 
513 aa  221  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2073  carbohydrate kinase  30.8 
 
 
513 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20388  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  28.52 
 
 
496 aa  221  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1925  carbohydrate kinase  30.8 
 
 
513 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0220647  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1638  carbohydrate kinase  30.8 
 
 
513 aa  221  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.241852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0300  carbohydrate kinase  30.8 
 
 
513 aa  221  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104506  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3787  xylulokinase  30.73 
 
 
520 aa  220  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4197  xylulokinase  31.35 
 
 
515 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  31.12 
 
 
515 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1912  carbohydrate kinase  30.57 
 
 
513 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314119  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  28.4 
 
 
511 aa  217  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  30.73 
 
 
515 aa  216  9e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  29.27 
 
 
512 aa  216  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  30.96 
 
 
515 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  30.96 
 
 
515 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  30.96 
 
 
515 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  27.93 
 
 
490 aa  213  4.9999999999999996e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  29.89 
 
 
499 aa  212  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  26.72 
 
 
499 aa  210  6e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  27.38 
 
 
498 aa  210  6e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0196  carbohydrate kinase FGGY  28.6 
 
 
496 aa  209  9e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  24.85 
 
 
538 aa  209  9e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>