More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3035 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  69.31 
 
 		 497 aa  711    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 502 aa  1015    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2596  predicted protein  50.64 
 
 		 482 aa  465  9.999999999999999e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.283853  normal  0.0118319 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  43.4 
 
 		 524 aa  385  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12881  predicted protein  46.54 
 
 		 438 aa  381  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2684  carbohydrate kinase, FGGY  38.4 
 
 		 501 aa  315  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.849942 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3921  FGGY-family pentulose kinase  33.46 
 
 		 528 aa  261  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02610  hypothetical protein  31.72 
 
 		 526 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02649  L-ribulokinase AraB-like protein  31.72 
 
 		 542 aa  253  8.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  30.82 
 
 		 501 aa  251  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  32.39 
 
 		 538 aa  247  4e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  28.82 
 
 		 500 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  32.34 
 
 		 509 aa  236  8e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  31.03 
 
 		 518 aa  226  8e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  30.36 
 
 		 502 aa  223  7e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2495  FGGY-family pentulose kinase  31.27 
 
 		 543 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.578248  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  30.36 
 
 		 509 aa  219  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  30.28 
 
 		 499 aa  219  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  27.87 
 
 		 500 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3411  FGGY-family pentulose kinase  31.71 
 
 		 525 aa  218  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110951  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  32.19 
 
 		 506 aa  218  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0555  ribulokinase  31.91 
 
 		 544 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  32.28 
 
 		 511 aa  214  3.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  28.46 
 
 		 503 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4697  FGGY-family pentulose kinase  29.46 
 
 		 545 aa  213  9e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.921712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  32.15 
 
 		 498 aa  212  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0435  FGGY-family pentulose kinase  29.32 
 
 		 545 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0368  pentulose kinase  29.32 
 
 		 545 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1227  pentulose kinase  29.32 
 
 		 545 aa  211  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.838114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0920  putative sugar kinase (ribulo-/ribitol kinase)  32.46 
 
 		 549 aa  207  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0680  pentulose kinase  30.39 
 
 		 547 aa  207  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  29.01 
 
 		 509 aa  206  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  29.55 
 
 		 496 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  31.52 
 
 		 504 aa  205  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3440  FGGY-family pentulose kinase  32.1 
 
 		 544 aa  203  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.243574  normal  0.308227 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6255  FGGY-family pentulose kinase  30.39 
 
 		 545 aa  203  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  29.56 
 
 		 548 aa  203  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32990  pentulose/hexulose kinase  31.27 
 
 		 489 aa  202  9e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  31.99 
 
 		 499 aa  202  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0269  ribitol kinase  31.52 
 
 		 534 aa  202  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  31.45 
 
 		 510 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3705  D-ribulokinase  32.1 
 
 		 544 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0244  ribitol kinase  31.65 
 
 		 534 aa  201  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2816  FGGY-family pentulose kinase  31.41 
 
 		 538 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2566  carbohydrate kinase, FGGY  32.15 
 
 		 493 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  28.71 
 
 		 515 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3784  FGGY-family pentulose kinase  30.73 
 
 		 529 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0121132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  26.73 
 
 		 496 aa  197  3e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  25.83 
 
 		 506 aa  197  4.0000000000000005e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2529  carbohydrate kinase, FGGY  31.95 
 
 		 493 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2574  carbohydrate kinase, FGGY  31.95 
 
 		 493 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  27.71 
 
 		 512 aa  196  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2351  FGGY-family pentulose kinase  30.89 
 
 		 528 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.400628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3574  ribitol kinase  29.77 
 
 		 523 aa  196  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.197802  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  27.67 
 
 		 497 aa  196  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7374  ribitol kinase  29.72 
 
 		 544 aa  196  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3746  FGGY-family pentulose kinase  29.09 
 
 		 527 aa  195  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  30.18 
 
 		 505 aa  195  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0847  FGGY-family pentulose kinase  29.72 
 
 		 543 aa  194  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0389776  normal  0.126532 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  32.8 
 
 		 498 aa  194  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  25.1 
 
 		 505 aa  192  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2899  ribulokinase  30.98 
 
 		 564 aa  192  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  29.18 
 
 		 505 aa  191  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  28.43 
 
 		 512 aa  190  5.999999999999999e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  29.86 
 
 		 512 aa  190  5.999999999999999e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  28.45 
 
 		 503 aa  189  7e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  31.67 
 
 		 505 aa  189  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  26.21 
 
 		 505 aa  189  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  27.68 
 
 		 490 aa  188  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  26.6 
 
 		 492 aa  187  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  26.6 
 
 		 492 aa  187  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  26.43 
 
 		 511 aa  187  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1344  carbohydrate kinase, FGGY  28.98 
 
 		 519 aa  186  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.789365  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  31.82 
 
 		 501 aa  186  9e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  31.21 
 
 		 506 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  31.26 
 
 		 481 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  29.88 
 
 		 498 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2156  FGGY-family pentulose kinase  30.32 
 
 		 540 aa  185  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  27.31 
 
 		 506 aa  184  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  28.21 
 
 		 519 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29860  pentulose/hexulose kinase  30.62 
 
 		 495 aa  183  7e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3444  FGGY-family pentulose kinase  29.15 
 
 		 527 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  27 
 
 		 488 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0456  FGGY-family pentulose kinase  29.92 
 
 		 547 aa  182  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.708838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  27.51 
 
 		 530 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1346  pentulose kinase  30.21 
 
 		 526 aa  180  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.664914  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  26.52 
 
 		 506 aa  180  4e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2134  putative carbohydrate kinase  27.8 
 
 		 520 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  27.89 
 
 		 514 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2735  ribulokinase  30.41 
 
 		 564 aa  179  9e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  30.14 
 
 		 472 aa  179  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  29.39 
 
 		 514 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0137  carbohydrate kinase  26.41 
 
 		 519 aa  178  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1560  carbohydrate kinase, FGGY  27.15 
 
 		 519 aa  178  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24960  putative carbohydrate kinase  27.41 
 
 		 519 aa  177  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2615  carbohydrate kinase FGGY  28.49 
 
 		 520 aa  176  6e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0575  ribulokinase  27.58 
 
 		 546 aa  176  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0589  ribulokinase  27.58 
 
 		 546 aa  176  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  30.38 
 
 		 508 aa  176  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  27.87 
 
 		 495 aa  176  8e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.700195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>