More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1227 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4697  FGGY-family pentulose kinase  84.4 
 
 
545 aa  987    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.921712  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0368  pentulose kinase  99.82 
 
 
545 aa  1137    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0435  FGGY-family pentulose kinase  99.82 
 
 
545 aa  1137    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1227  pentulose kinase  100 
 
 
545 aa  1139    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.838114 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0456  FGGY-family pentulose kinase  56.67 
 
 
547 aa  610  1e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.708838  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0847  FGGY-family pentulose kinase  54.96 
 
 
543 aa  598  1e-170  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0389776  normal  0.126532 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0680  pentulose kinase  48.01 
 
 
547 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2816  FGGY-family pentulose kinase  47.44 
 
 
538 aa  505  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0244  ribitol kinase  46.57 
 
 
534 aa  498  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0269  ribitol kinase  46.38 
 
 
534 aa  497  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0555  ribulokinase  45.29 
 
 
544 aa  485  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0920  putative sugar kinase (ribulo-/ribitol kinase)  45.91 
 
 
549 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2495  FGGY-family pentulose kinase  44.99 
 
 
543 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.578248  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3705  D-ribulokinase  45.32 
 
 
544 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3921  FGGY-family pentulose kinase  43.75 
 
 
528 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6255  FGGY-family pentulose kinase  44.99 
 
 
545 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2156  FGGY-family pentulose kinase  45.29 
 
 
540 aa  455  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314644  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3784  FGGY-family pentulose kinase  44.17 
 
 
529 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0121132  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3440  FGGY-family pentulose kinase  44.93 
 
 
544 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.243574  normal  0.308227 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7374  ribitol kinase  44.34 
 
 
544 aa  448  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3411  FGGY-family pentulose kinase  44.51 
 
 
525 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110951  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1346  pentulose kinase  44.16 
 
 
526 aa  443  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.664914  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02649  L-ribulokinase AraB-like protein  42.07 
 
 
542 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02610  hypothetical protein  42.07 
 
 
526 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2351  FGGY-family pentulose kinase  42.83 
 
 
528 aa  428  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.400628  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3746  FGGY-family pentulose kinase  41.07 
 
 
527 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26976  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3444  FGGY-family pentulose kinase  41.62 
 
 
527 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00680  conserved hypothetical protein  37.91 
 
 
621 aa  414  1e-114  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3574  ribitol kinase  39.38 
 
 
523 aa  402  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.197802  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01568  conserved hypothetical protein  39.2 
 
 
603 aa  381  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.677654  normal  0.0579254 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86603  possible ribitol kinase or glycerol kinase  36.95 
 
 
758 aa  339  9e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06985  FGGY-family carbohydrate kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04680)  37.57 
 
 
541 aa  320  3.9999999999999996e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4175  carbohydrate kinase, FGGY  34.83 
 
 
480 aa  258  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.929603  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  32.57 
 
 
524 aa  238  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  28.84 
 
 
497 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  29.32 
 
 
502 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2229  ribulokinase  29.11 
 
 
556 aa  207  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00201608  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0575  ribulokinase  27.6 
 
 
546 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0589  ribulokinase  27.6 
 
 
546 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2684  carbohydrate kinase, FGGY  28.02 
 
 
501 aa  186  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.849942 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2899  ribulokinase  27.91 
 
 
564 aa  183  7e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2596  predicted protein  27.93 
 
 
482 aa  180  7e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.283853  normal  0.0118319 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  24.91 
 
 
503 aa  177  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0222  ribulokinase  30.05 
 
 
585 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0379  ribulokinase  29.73 
 
 
577 aa  169  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3662  ribulokinase  28.7 
 
 
562 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2735  ribulokinase  27.96 
 
 
564 aa  163  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12881  predicted protein  28.99 
 
 
438 aa  160  7e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2057  carbohydrate kinase FGGY  29.21 
 
 
517 aa  154  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.795187 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1748  L-ribulokinase  27.21 
 
 
570 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  25.82 
 
 
510 aa  153  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6219  ribulokinase  28.7 
 
 
551 aa  153  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1927  ribulokinase  28.65 
 
 
536 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0322  ribulokinase  27.51 
 
 
529 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.54265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2886  L-ribulokinase  28.16 
 
 
556 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331814  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3274  ribulokinase  28.74 
 
 
598 aa  147  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187785  normal  0.0296673 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1861  ribulokinase  27.64 
 
 
554 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  26.86 
 
 
498 aa  147  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  25.33 
 
 
538 aa  147  6e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06940  L-ribulokinase  29.74 
 
 
579 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0749  L-ribulokinase  28.86 
 
 
572 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135875  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0871  ribulokinase  29.07 
 
 
564 aa  143  7e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  24.44 
 
 
506 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  24.21 
 
 
506 aa  137  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  24.21 
 
 
497 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  24.48 
 
 
505 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  22.59 
 
 
500 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0380  ribulokinase  28.39 
 
 
567 aa  133  9e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.526871  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0469  L-ribulokinase  25.66 
 
 
562 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  24.49 
 
 
512 aa  131  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  24.49 
 
 
500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  25.85 
 
 
519 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  23.4 
 
 
509 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  23.7 
 
 
512 aa  126  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  24.86 
 
 
505 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  26.73 
 
 
526 aa  123  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2398  ribulokinase  27.32 
 
 
554 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  23.1 
 
 
518 aa  122  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  22.45 
 
 
509 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  24.49 
 
 
495 aa  122  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  25.42 
 
 
514 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29860  pentulose/hexulose kinase  24.91 
 
 
495 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  23.14 
 
 
512 aa  121  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  23.35 
 
 
506 aa  121  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  24.79 
 
 
530 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1655  carbohydrate kinase, FGGY  23.86 
 
 
549 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0424957  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35001  Ribulokinase-like protein  25.3 
 
 
524 aa  118  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  25.31 
 
 
519 aa  118  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  23.01 
 
 
548 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  23.54 
 
 
502 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  23.26 
 
 
512 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  22.75 
 
 
513 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4715  ribulokinase  27.55 
 
 
556 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  22.91 
 
 
505 aa  115  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  23.57 
 
 
493 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  24.49 
 
 
486 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  23.15 
 
 
513 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  21.79 
 
 
501 aa  115  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1119  ribulokinase  24.73 
 
 
563 aa  115  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  23.62 
 
 
499 aa  115  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>