More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0575 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0575  ribulokinase  100 
 
 		 546 aa  1132    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0589  ribulokinase  100 
 
 		 546 aa  1132    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1927  ribulokinase  53.6 
 
 		 536 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2899  ribulokinase  44.14 
 
 		 564 aa  482  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2229  ribulokinase  41.3 
 
 		 556 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00201608  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2735  ribulokinase  40.37 
 
 		 564 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3662  ribulokinase  38.04 
 
 		 562 aa  419  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1861  ribulokinase  36.72 
 
 		 554 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0379  ribulokinase  36.81 
 
 		 577 aa  384  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3274  ribulokinase  36.26 
 
 		 598 aa  373  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187785  normal  0.0296673 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0222  ribulokinase  35.26 
 
 		 585 aa  369  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0871  ribulokinase  36.53 
 
 		 564 aa  368  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0380  ribulokinase  36.48 
 
 		 567 aa  360  3e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.526871  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06940  L-ribulokinase  35.2 
 
 		 579 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2886  L-ribulokinase  34.81 
 
 		 556 aa  352  8e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331814  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0749  L-ribulokinase  36.81 
 
 		 572 aa  351  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6219  ribulokinase  35.16 
 
 		 551 aa  349  8e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4715  ribulokinase  35.28 
 
 		 556 aa  343  5e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1748  L-ribulokinase  36.6 
 
 		 570 aa  340  4e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0469  L-ribulokinase  35.04 
 
 		 562 aa  332  1e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2057  carbohydrate kinase FGGY  35.52 
 
 		 517 aa  306  8.000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.795187 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1383  carbohydrate kinase FGGY  32.62 
 
 		 553 aa  266  5.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.396144  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0068  ribulokinase  30.18 
 
 		 566 aa  238  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.876967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0065  ribulokinase  30 
 
 		 566 aa  238  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703841  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00065  ribulokinase  30 
 
 		 566 aa  237  4e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00064  hypothetical protein  30 
 
 		 566 aa  237  4e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3594  ribulokinase  30 
 
 		 566 aa  237  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560965  unclonable  0.0000000207418 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0065  ribulokinase  29.36 
 
 		 566 aa  236  8e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.268824  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0067  ribulokinase  29.82 
 
 		 566 aa  236  8e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3536  L-ribulokinase  29.82 
 
 		 566 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0055  ribulokinase  29.64 
 
 		 566 aa  233  5e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0114  ribulokinase  29.3 
 
 		 569 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.728567  normal  0.199883 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0114  ribulokinase  29.3 
 
 		 569 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2064  ribulokinase  30 
 
 		 557 aa  229  7e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000583792  hitchhiker  0.00000400193 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0110  ribulokinase  29.12 
 
 		 569 aa  229  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.407492 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0109  ribulokinase  28.07 
 
 		 569 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.526121 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0610  ribulokinase  29.69 
 
 		 569 aa  228  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.59168  normal  0.0130922 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0107  ribulokinase  28.94 
 
 		 569 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1977  ribulokinase  29.82 
 
 		 557 aa  226  6e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489271  normal  0.124359 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1997  ribulokinase  29.82 
 
 		 557 aa  226  6e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00226612  unclonable  0.0000285081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1119  ribulokinase  31.73 
 
 		 563 aa  222  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2729  ribulokinase  30.13 
 
 		 557 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0860748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3994  ribulokinase  31.43 
 
 		 547 aa  219  7.999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.026407  normal  0.515054 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1239  L-ribulokinase  32.72 
 
 		 544 aa  219  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.711611  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2028  ribulokinase  28.39 
 
 		 566 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2398  ribulokinase  29.16 
 
 		 554 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2138  ribulokinase  28.83 
 
 		 557 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000886858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2150  ribulokinase  28.39 
 
 		 561 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0772  ribulokinase  29.29 
 
 		 555 aa  213  4.9999999999999996e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000289465  normal  0.0721691 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2328  ribulokinase  28.18 
 
 		 561 aa  212  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.717487  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1913  ribulokinase  27.82 
 
 		 563 aa  209  8e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0322  ribulokinase  28.38 
 
 		 529 aa  209  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.54265 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2244  ribulokinase  28.33 
 
 		 561 aa  205  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000378483 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2068  ribulokinase  28.39 
 
 		 557 aa  205  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000109649  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3201  ribulokinase  28.26 
 
 		 564 aa  204  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.995888 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1227  pentulose kinase  27.6 
 
 		 545 aa  191  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.838114 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0368  pentulose kinase  27.6 
 
 		 545 aa  192  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0435  FGGY-family pentulose kinase  27.6 
 
 		 545 aa  192  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2000  ribulokinase  28.36 
 
 		 567 aa  189  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1886  ribulokinase  28.36 
 
 		 567 aa  189  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2260  ribulokinase  27.99 
 
 		 567 aa  187  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4697  FGGY-family pentulose kinase  25.98 
 
 		 545 aa  186  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.921712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  27.58 
 
 		 502 aa  176  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3921  FGGY-family pentulose kinase  27.42 
 
 		 528 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0847  FGGY-family pentulose kinase  26.98 
 
 		 543 aa  173  9e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0389776  normal  0.126532 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  27.07 
 
 		 497 aa  171  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02649  L-ribulokinase AraB-like protein  26.78 
 
 		 542 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02610  hypothetical protein  26.78 
 
 		 526 aa  167  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  25.88 
 
 		 524 aa  167  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2684  carbohydrate kinase, FGGY  26.23 
 
 		 501 aa  161  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.849942 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3574  ribitol kinase  27.04 
 
 		 523 aa  158  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.197802  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1346  pentulose kinase  25.27 
 
 		 526 aa  154  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.664914  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3746  FGGY-family pentulose kinase  24.86 
 
 		 527 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3784  FGGY-family pentulose kinase  27.12 
 
 		 529 aa  150  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0121132  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86603  possible ribitol kinase or glycerol kinase  24.85 
 
 		 758 aa  148  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2351  FGGY-family pentulose kinase  24.02 
 
 		 528 aa  147  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.400628  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01568  conserved hypothetical protein  26.43 
 
 		 603 aa  146  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.677654  normal  0.0579254 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0456  FGGY-family pentulose kinase  25.27 
 
 		 547 aa  143  9e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.708838  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2816  FGGY-family pentulose kinase  25.27 
 
 		 538 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3444  FGGY-family pentulose kinase  25.32 
 
 		 527 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0269  ribitol kinase  24.91 
 
 		 534 aa  140  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0244  ribitol kinase  24.91 
 
 		 534 aa  140  7e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00680  conserved hypothetical protein  25.91 
 
 		 621 aa  139  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3411  FGGY-family pentulose kinase  22.83 
 
 		 525 aa  138  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110951  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12881  predicted protein  23.53 
 
 		 438 aa  137  5e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2596  predicted protein  24.4 
 
 		 482 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.283853  normal  0.0118319 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2495  FGGY-family pentulose kinase  23.84 
 
 		 543 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.578248  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6255  FGGY-family pentulose kinase  24.32 
 
 		 545 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  24.12 
 
 		 506 aa  130  6e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0555  ribulokinase  23.1 
 
 		 544 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0680  pentulose kinase  22.95 
 
 		 547 aa  128  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  25 
 
 		 500 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06985  FGGY-family carbohydrate kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04680)  26.9 
 
 		 541 aa  125  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3705  D-ribulokinase  23.2 
 
 		 544 aa  124  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3440  FGGY-family pentulose kinase  23.02 
 
 		 544 aa  120  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.243574  normal  0.308227 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  23.88 
 
 		 500 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7374  ribitol kinase  23.12 
 
 		 544 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0920  putative sugar kinase (ribulo-/ribitol kinase)  24.24 
 
 		 549 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  23.28 
 
 		 506 aa  111  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  21.59 
 
 		 509 aa  109  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>