More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4697 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0368  pentulose kinase  84.59 
 
 
545 aa  988    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0435  FGGY-family pentulose kinase  84.59 
 
 
545 aa  988    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4697  FGGY-family pentulose kinase  100 
 
 
545 aa  1137    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.921712  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1227  pentulose kinase  84.4 
 
 
545 aa  987    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.838114 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0456  FGGY-family pentulose kinase  56.3 
 
 
547 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.708838  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0847  FGGY-family pentulose kinase  53.68 
 
 
543 aa  578  1e-164  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0389776  normal  0.126532 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2816  FGGY-family pentulose kinase  47.22 
 
 
538 aa  511  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0680  pentulose kinase  47.85 
 
 
547 aa  511  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0244  ribitol kinase  47.22 
 
 
534 aa  500  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0269  ribitol kinase  47.04 
 
 
534 aa  498  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2495  FGGY-family pentulose kinase  46.47 
 
 
543 aa  488  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.578248  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0555  ribulokinase  45.25 
 
 
544 aa  480  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0920  putative sugar kinase (ribulo-/ribitol kinase)  45.04 
 
 
549 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6255  FGGY-family pentulose kinase  45.25 
 
 
545 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7374  ribitol kinase  45.93 
 
 
544 aa  459  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3705  D-ribulokinase  45.63 
 
 
544 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3921  FGGY-family pentulose kinase  43.81 
 
 
528 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3411  FGGY-family pentulose kinase  44.13 
 
 
525 aa  449  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110951  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3440  FGGY-family pentulose kinase  45.44 
 
 
544 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.243574  normal  0.308227 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02649  L-ribulokinase AraB-like protein  43.83 
 
 
542 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02610  hypothetical protein  43.83 
 
 
526 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2156  FGGY-family pentulose kinase  46.03 
 
 
540 aa  446  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314644  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1346  pentulose kinase  44.26 
 
 
526 aa  444  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.664914  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3784  FGGY-family pentulose kinase  43.71 
 
 
529 aa  443  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0121132  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00680  conserved hypothetical protein  39.64 
 
 
621 aa  439  9.999999999999999e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2351  FGGY-family pentulose kinase  43.3 
 
 
528 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.400628  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3746  FGGY-family pentulose kinase  41.63 
 
 
527 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26976  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3444  FGGY-family pentulose kinase  42.4 
 
 
527 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01568  conserved hypothetical protein  39.9 
 
 
603 aa  393  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.677654  normal  0.0579254 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3574  ribitol kinase  40.08 
 
 
523 aa  386  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.197802  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86603  possible ribitol kinase or glycerol kinase  37.55 
 
 
758 aa  348  2e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06985  FGGY-family carbohydrate kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04680)  37.97 
 
 
541 aa  337  3.9999999999999995e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4175  carbohydrate kinase, FGGY  35.5 
 
 
480 aa  253  9.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.929603  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  31.8 
 
 
524 aa  228  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  29.46 
 
 
502 aa  213  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  27.07 
 
 
497 aa  211  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2229  ribulokinase  28.08 
 
 
556 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00201608  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  26 
 
 
503 aa  186  7e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0589  ribulokinase  25.98 
 
 
546 aa  186  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0575  ribulokinase  25.98 
 
 
546 aa  186  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2684  carbohydrate kinase, FGGY  28.02 
 
 
501 aa  181  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.849942 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2899  ribulokinase  28.6 
 
 
564 aa  178  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0379  ribulokinase  30.21 
 
 
577 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0222  ribulokinase  29.54 
 
 
585 aa  174  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3662  ribulokinase  29.1 
 
 
562 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2596  predicted protein  27.54 
 
 
482 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.283853  normal  0.0118319 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1927  ribulokinase  27.97 
 
 
536 aa  160  8e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12881  predicted protein  29.19 
 
 
438 aa  157  4e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2735  ribulokinase  27.46 
 
 
564 aa  154  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  25.47 
 
 
538 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  26.06 
 
 
510 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  26.64 
 
 
498 aa  148  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0322  ribulokinase  28.36 
 
 
529 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.54265 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2057  carbohydrate kinase FGGY  28.2 
 
 
517 aa  145  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.795187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0749  L-ribulokinase  29.55 
 
 
572 aa  145  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135875  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1748  L-ribulokinase  27.05 
 
 
570 aa  144  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  22.88 
 
 
509 aa  144  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2886  L-ribulokinase  27.11 
 
 
556 aa  144  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331814  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  24.59 
 
 
506 aa  141  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0469  L-ribulokinase  26.76 
 
 
562 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  22.92 
 
 
500 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0871  ribulokinase  28.28 
 
 
564 aa  140  7e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1861  ribulokinase  26.56 
 
 
554 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  24.02 
 
 
506 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  24.58 
 
 
497 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  25 
 
 
495 aa  134  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29860  pentulose/hexulose kinase  27 
 
 
495 aa  134  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  23.44 
 
 
509 aa  134  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  23.88 
 
 
512 aa  133  7.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  24.13 
 
 
512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  24.77 
 
 
506 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6219  ribulokinase  27.88 
 
 
551 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  23.19 
 
 
512 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3274  ribulokinase  27.32 
 
 
598 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187785  normal  0.0296673 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  23.65 
 
 
509 aa  127  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  23.35 
 
 
500 aa  127  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  25.5 
 
 
506 aa  127  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  23.13 
 
 
518 aa  127  8.000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  24.4 
 
 
511 aa  126  8.000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  23.67 
 
 
505 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0380  ribulokinase  27.98 
 
 
567 aa  126  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.526871  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06940  L-ribulokinase  27.86 
 
 
579 aa  125  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2398  ribulokinase  27.34 
 
 
554 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  25.67 
 
 
530 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  23.13 
 
 
513 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  23.94 
 
 
486 aa  120  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  23.13 
 
 
513 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  25.05 
 
 
512 aa  120  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  25.51 
 
 
514 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  25.09 
 
 
501 aa  119  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  22.87 
 
 
513 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  22.87 
 
 
513 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  22.87 
 
 
513 aa  118  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  23.05 
 
 
513 aa  118  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  24.35 
 
 
493 aa  118  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  22.87 
 
 
513 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  24.4 
 
 
506 aa  118  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  22.55 
 
 
548 aa  118  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35001  Ribulokinase-like protein  25.04 
 
 
524 aa  117  3.9999999999999997e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  22.87 
 
 
512 aa  117  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>