More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3274 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2886  L-ribulokinase  66.36 
 
 		 556 aa  701    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3274  ribulokinase  100 
 
 		 598 aa  1199    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187785  normal  0.0296673 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1861  ribulokinase  70.75 
 
 		 554 aa  758    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0222  ribulokinase  68.25 
 
 		 585 aa  758    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0380  ribulokinase  71.14 
 
 		 567 aa  714    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.526871  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0379  ribulokinase  69.75 
 
 		 577 aa  753    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06940  L-ribulokinase  72.43 
 
 		 579 aa  761    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6219  ribulokinase  66.36 
 
 		 551 aa  667    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4715  ribulokinase  62.21 
 
 		 556 aa  638    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0749  L-ribulokinase  62.32 
 
 		 572 aa  625  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0871  ribulokinase  63.21 
 
 		 564 aa  623  1e-177  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3662  ribulokinase  54.32 
 
 		 562 aa  590  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2229  ribulokinase  52.65 
 
 		 556 aa  581  1e-164  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00201608  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2735  ribulokinase  54.2 
 
 		 564 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2899  ribulokinase  51.61 
 
 		 564 aa  556  1e-157  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0575  ribulokinase  36.26 
 
 		 546 aa  391  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0589  ribulokinase  36.26 
 
 		 546 aa  391  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1748  L-ribulokinase  39.82 
 
 		 570 aa  369  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0469  L-ribulokinase  40.9 
 
 		 562 aa  346  5e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2057  carbohydrate kinase FGGY  39.92 
 
 		 517 aa  340  4e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.795187 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1927  ribulokinase  34.02 
 
 		 536 aa  317  3e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1383  carbohydrate kinase FGGY  38.1 
 
 		 553 aa  299  9e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.396144  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2398  ribulokinase  34.46 
 
 		 554 aa  264  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1239  L-ribulokinase  35.39 
 
 		 544 aa  257  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.711611  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2729  ribulokinase  31.59 
 
 		 557 aa  251  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0860748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2064  ribulokinase  33.39 
 
 		 557 aa  251  4e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000583792  hitchhiker  0.00000400193 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0772  ribulokinase  34.09 
 
 		 555 aa  248  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000289465  normal  0.0721691 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1977  ribulokinase  33.39 
 
 		 557 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489271  normal  0.124359 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1997  ribulokinase  33.39 
 
 		 557 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00226612  unclonable  0.0000285081 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2138  ribulokinase  33.51 
 
 		 557 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000886858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0610  ribulokinase  34.43 
 
 		 569 aa  243  5e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.59168  normal  0.0130922 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0110  ribulokinase  34.19 
 
 		 569 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.407492 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0068  ribulokinase  33.03 
 
 		 566 aa  237  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.876967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3994  ribulokinase  32.54 
 
 		 547 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.026407  normal  0.515054 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00065  ribulokinase  33.03 
 
 		 566 aa  236  8e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3594  ribulokinase  33.03 
 
 		 566 aa  236  8e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560965  unclonable  0.0000000207418 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0055  ribulokinase  32.84 
 
 		 566 aa  236  8e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00064  hypothetical protein  33.03 
 
 		 566 aa  236  8e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0065  ribulokinase  33.03 
 
 		 566 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.268824  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0114  ribulokinase  34 
 
 		 569 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.728567  normal  0.199883 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2068  ribulokinase  33.27 
 
 		 557 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000109649  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0114  ribulokinase  33.39 
 
 		 569 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0109  ribulokinase  33.64 
 
 		 569 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.526121 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0067  ribulokinase  32.84 
 
 		 566 aa  234  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3536  L-ribulokinase  32.84 
 
 		 566 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0065  ribulokinase  32.66 
 
 		 566 aa  233  6e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703841  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0107  ribulokinase  33.82 
 
 		 569 aa  233  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1119  ribulokinase  31.94 
 
 		 563 aa  231  4e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3201  ribulokinase  34.75 
 
 		 564 aa  229  9e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.995888 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0322  ribulokinase  35.45 
 
 		 529 aa  229  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.54265 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2028  ribulokinase  33.21 
 
 		 566 aa  227  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2150  ribulokinase  34.25 
 
 		 561 aa  227  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2328  ribulokinase  32.97 
 
 		 561 aa  224  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.717487  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2244  ribulokinase  32.1 
 
 		 561 aa  204  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000378483 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1913  ribulokinase  32.29 
 
 		 563 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  33.4 
 
 		 524 aa  200  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1886  ribulokinase  32.18 
 
 		 567 aa  196  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2260  ribulokinase  32 
 
 		 567 aa  195  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2000  ribulokinase  31.82 
 
 		 567 aa  194  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3921  FGGY-family pentulose kinase  33.12 
 
 		 528 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2596  predicted protein  31.2 
 
 		 482 aa  178  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.283853  normal  0.0118319 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2684  carbohydrate kinase, FGGY  30.71 
 
 		 501 aa  176  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.849942 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0555  ribulokinase  32.36 
 
 		 544 aa  173  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12881  predicted protein  30.51 
 
 		 438 aa  168  2.9999999999999998e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2816  FGGY-family pentulose kinase  31.74 
 
 		 538 aa  167  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2495  FGGY-family pentulose kinase  32.35 
 
 		 543 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.578248  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0244  ribitol kinase  32.6 
 
 		 534 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0269  ribitol kinase  32.6 
 
 		 534 aa  165  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0368  pentulose kinase  28.52 
 
 		 545 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0435  FGGY-family pentulose kinase  28.52 
 
 		 545 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1227  pentulose kinase  28.52 
 
 		 545 aa  162  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.838114 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0456  FGGY-family pentulose kinase  32.5 
 
 		 547 aa  160  5e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.708838  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0680  pentulose kinase  30.97 
 
 		 547 aa  160  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2156  FGGY-family pentulose kinase  32.79 
 
 		 540 aa  158  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1346  pentulose kinase  31.89 
 
 		 526 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.664914  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6255  FGGY-family pentulose kinase  31.06 
 
 		 545 aa  157  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0847  FGGY-family pentulose kinase  29.87 
 
 		 543 aa  156  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0389776  normal  0.126532 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02649  L-ribulokinase AraB-like protein  30.5 
 
 		 542 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02610  hypothetical protein  30.3 
 
 		 526 aa  154  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3440  FGGY-family pentulose kinase  31.79 
 
 		 544 aa  154  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.243574  normal  0.308227 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3574  ribitol kinase  30.4 
 
 		 523 aa  150  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.197802  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  28.14 
 
 		 497 aa  150  5e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  28.54 
 
 		 502 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3705  D-ribulokinase  31.25 
 
 		 544 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3746  FGGY-family pentulose kinase  31.93 
 
 		 527 aa  146  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4697  FGGY-family pentulose kinase  27.67 
 
 		 545 aa  143  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.921712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  25.41 
 
 		 506 aa  142  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  27.45 
 
 		 512 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3411  FGGY-family pentulose kinase  29.27 
 
 		 525 aa  141  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110951  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  30.4 
 
 		 508 aa  137  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3444  FGGY-family pentulose kinase  32.23 
 
 		 527 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3784  FGGY-family pentulose kinase  29.81 
 
 		 529 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0121132  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7374  ribitol kinase  28.83 
 
 		 544 aa  134  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  29.94 
 
 		 515 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  29.94 
 
 		 515 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  29.94 
 
 		 515 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  28.99 
 
 		 506 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  25.41 
 
 		 506 aa  130  8.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  27.06 
 
 		 512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86603  possible ribitol kinase or glycerol kinase  26.89 
 
 		 758 aa  128  4.0000000000000003e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>