More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6219 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0749  L-ribulokinase  66.91 
 
 		 572 aa  686    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0379  ribulokinase  64.16 
 
 		 577 aa  712    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06940  L-ribulokinase  66.55 
 
 		 579 aa  709    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1861  ribulokinase  69.03 
 
 		 554 aa  738    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2886  L-ribulokinase  67.51 
 
 		 556 aa  721    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6219  ribulokinase  100 
 
 		 551 aa  1107    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0222  ribulokinase  65.64 
 
 		 585 aa  728    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0871  ribulokinase  67.86 
 
 		 564 aa  658    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0380  ribulokinase  69.5 
 
 		 567 aa  682    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.526871  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4715  ribulokinase  67.03 
 
 		 556 aa  688    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3274  ribulokinase  66.36 
 
 		 598 aa  679    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187785  normal  0.0296673 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3662  ribulokinase  52.24 
 
 		 562 aa  569  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2229  ribulokinase  51.18 
 
 		 556 aa  570  1e-161  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00201608  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2899  ribulokinase  50.73 
 
 		 564 aa  531  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2735  ribulokinase  51.37 
 
 		 564 aa  526  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1748  L-ribulokinase  40.49 
 
 		 570 aa  396  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0589  ribulokinase  35.16 
 
 		 546 aa  373  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0575  ribulokinase  35.16 
 
 		 546 aa  373  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0469  L-ribulokinase  42.28 
 
 		 562 aa  374  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2057  carbohydrate kinase FGGY  40.27 
 
 		 517 aa  336  7.999999999999999e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.795187 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1383  carbohydrate kinase FGGY  40.07 
 
 		 553 aa  331  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.396144  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1927  ribulokinase  34.79 
 
 		 536 aa  322  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2398  ribulokinase  36.8 
 
 		 554 aa  301  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1239  L-ribulokinase  37.15 
 
 		 544 aa  278  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.711611  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2064  ribulokinase  35.97 
 
 		 557 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000583792  hitchhiker  0.00000400193 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1977  ribulokinase  35.97 
 
 		 557 aa  274  3e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489271  normal  0.124359 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1997  ribulokinase  35.97 
 
 		 557 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00226612  unclonable  0.0000285081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2729  ribulokinase  31.89 
 
 		 557 aa  265  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0860748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0772  ribulokinase  35.7 
 
 		 555 aa  261  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000289465  normal  0.0721691 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2138  ribulokinase  34.53 
 
 		 557 aa  259  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000886858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3994  ribulokinase  35.35 
 
 		 547 aa  256  9e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.026407  normal  0.515054 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3201  ribulokinase  36.46 
 
 		 564 aa  253  6e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.995888 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0610  ribulokinase  35.45 
 
 		 569 aa  252  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.59168  normal  0.0130922 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2068  ribulokinase  34.17 
 
 		 557 aa  249  6e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000109649  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2328  ribulokinase  35.88 
 
 		 561 aa  249  8e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.717487  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2150  ribulokinase  35.83 
 
 		 561 aa  249  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0114  ribulokinase  34.66 
 
 		 569 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.728567  normal  0.199883 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0114  ribulokinase  34.66 
 
 		 569 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0110  ribulokinase  34.66 
 
 		 569 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.407492 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2028  ribulokinase  35.4 
 
 		 566 aa  246  6.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0109  ribulokinase  34.3 
 
 		 569 aa  246  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.526121 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00065  ribulokinase  34.43 
 
 		 566 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00064  hypothetical protein  34.43 
 
 		 566 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3594  ribulokinase  34.43 
 
 		 566 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560965  unclonable  0.0000000207418 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0107  ribulokinase  34.48 
 
 		 569 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1119  ribulokinase  33.45 
 
 		 563 aa  244  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0055  ribulokinase  34.24 
 
 		 566 aa  244  3e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0065  ribulokinase  34.24 
 
 		 566 aa  244  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703841  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3536  L-ribulokinase  33.99 
 
 		 566 aa  243  5e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0067  ribulokinase  34.24 
 
 		 566 aa  243  5e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0065  ribulokinase  34.18 
 
 		 566 aa  243  7e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.268824  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0068  ribulokinase  34.06 
 
 		 566 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.876967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1913  ribulokinase  34.38 
 
 		 563 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0322  ribulokinase  34.64 
 
 		 529 aa  227  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.54265 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2244  ribulokinase  34.57 
 
 		 561 aa  222  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000378483 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1886  ribulokinase  34.21 
 
 		 567 aa  220  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2000  ribulokinase  34.21 
 
 		 567 aa  219  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2260  ribulokinase  33.65 
 
 		 567 aa  218  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  34.47 
 
 		 524 aa  199  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2495  FGGY-family pentulose kinase  32.25 
 
 		 543 aa  179  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.578248  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0435  FGGY-family pentulose kinase  29.66 
 
 		 545 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0368  pentulose kinase  29.66 
 
 		 545 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1227  pentulose kinase  29.66 
 
 		 545 aa  177  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.838114 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0456  FGGY-family pentulose kinase  33.1 
 
 		 547 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.708838  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3921  FGGY-family pentulose kinase  29.89 
 
 		 528 aa  172  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2684  carbohydrate kinase, FGGY  30.46 
 
 		 501 aa  171  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.849942 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02649  L-ribulokinase AraB-like protein  29.21 
 
 		 542 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02610  hypothetical protein  29.21 
 
 		 526 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6255  FGGY-family pentulose kinase  28.98 
 
 		 545 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  29.09 
 
 		 497 aa  162  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12881  predicted protein  29.87 
 
 		 438 aa  161  3e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2596  predicted protein  30.44 
 
 		 482 aa  160  6e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.283853  normal  0.0118319 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4697  FGGY-family pentulose kinase  28.29 
 
 		 545 aa  157  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.921712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  27.65 
 
 		 502 aa  156  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2816  FGGY-family pentulose kinase  30.46 
 
 		 538 aa  155  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0680  pentulose kinase  29.91 
 
 		 547 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3440  FGGY-family pentulose kinase  30.92 
 
 		 544 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.243574  normal  0.308227 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3411  FGGY-family pentulose kinase  30.39 
 
 		 525 aa  154  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110951  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0847  FGGY-family pentulose kinase  31.17 
 
 		 543 aa  154  5e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0389776  normal  0.126532 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3705  D-ribulokinase  30.74 
 
 		 544 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1346  pentulose kinase  30.76 
 
 		 526 aa  152  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.664914  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3746  FGGY-family pentulose kinase  30.57 
 
 		 527 aa  150  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2156  FGGY-family pentulose kinase  30.47 
 
 		 540 aa  145  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7374  ribitol kinase  29.89 
 
 		 544 aa  144  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  29.35 
 
 		 509 aa  141  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01568  conserved hypothetical protein  29.81 
 
 		 603 aa  140  7e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.677654  normal  0.0579254 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  27 
 
 		 512 aa  139  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0555  ribulokinase  30.43 
 
 		 544 aa  137  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3444  FGGY-family pentulose kinase  30.97 
 
 		 527 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00680  conserved hypothetical protein  27.5 
 
 		 621 aa  135  3e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  26.36 
 
 		 503 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  25.09 
 
 		 500 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0244  ribitol kinase  28.75 
 
 		 534 aa  134  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0269  ribitol kinase  28.75 
 
 		 534 aa  134  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3574  ribitol kinase  28.62 
 
 		 523 aa  133  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.197802  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  30.45 
 
 		 498 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  29.36 
 
 		 506 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86603  possible ribitol kinase or glycerol kinase  27.76 
 
 		 758 aa  128  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  28.02 
 
 		 548 aa  126  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2625  carbohydrate kinase, FGGY  26.09 
 
 		 505 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>