More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0456 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0368  pentulose kinase  56.96 
 
 
545 aa  640    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0847  FGGY-family pentulose kinase  62.62 
 
 
543 aa  647    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0389776  normal  0.126532 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0435  FGGY-family pentulose kinase  56.96 
 
 
545 aa  640    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1227  pentulose kinase  56.67 
 
 
545 aa  639    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.838114 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0456  FGGY-family pentulose kinase  100 
 
 
547 aa  1093    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.708838  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4697  FGGY-family pentulose kinase  56.3 
 
 
545 aa  630  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.921712  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2816  FGGY-family pentulose kinase  49.53 
 
 
538 aa  488  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3705  D-ribulokinase  51.11 
 
 
544 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3440  FGGY-family pentulose kinase  51.3 
 
 
544 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.243574  normal  0.308227 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0680  pentulose kinase  50.09 
 
 
547 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2495  FGGY-family pentulose kinase  49.53 
 
 
543 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.578248  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0244  ribitol kinase  48.9 
 
 
534 aa  472  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0269  ribitol kinase  48.71 
 
 
534 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6255  FGGY-family pentulose kinase  48.97 
 
 
545 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0920  putative sugar kinase (ribulo-/ribitol kinase)  49.81 
 
 
549 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0555  ribulokinase  48.24 
 
 
544 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3921  FGGY-family pentulose kinase  46.13 
 
 
528 aa  449  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7374  ribitol kinase  48.04 
 
 
544 aa  447  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2156  FGGY-family pentulose kinase  49.17 
 
 
540 aa  444  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314644  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02649  L-ribulokinase AraB-like protein  44.83 
 
 
542 aa  435  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3411  FGGY-family pentulose kinase  46.77 
 
 
525 aa  437  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110951  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02610  hypothetical protein  44.83 
 
 
526 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1346  pentulose kinase  46.78 
 
 
526 aa  433  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.664914  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3784  FGGY-family pentulose kinase  45.47 
 
 
529 aa  417  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0121132  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2351  FGGY-family pentulose kinase  46.09 
 
 
528 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.400628  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00680  conserved hypothetical protein  38.12 
 
 
621 aa  379  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3746  FGGY-family pentulose kinase  42.72 
 
 
527 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26976  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3574  ribitol kinase  41.95 
 
 
523 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.197802  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3444  FGGY-family pentulose kinase  42.53 
 
 
527 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01568  conserved hypothetical protein  40.28 
 
 
603 aa  353  5.9999999999999994e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.677654  normal  0.0579254 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86603  possible ribitol kinase or glycerol kinase  40.57 
 
 
758 aa  350  5e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06985  FGGY-family carbohydrate kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04680)  38.42 
 
 
541 aa  316  7e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4175  carbohydrate kinase, FGGY  38.29 
 
 
480 aa  252  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.929603  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  34.28 
 
 
524 aa  215  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  30.06 
 
 
497 aa  203  7e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2684  carbohydrate kinase, FGGY  30.87 
 
 
501 aa  199  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.849942 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2229  ribulokinase  29.52 
 
 
556 aa  190  5e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00201608  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  30.51 
 
 
502 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3662  ribulokinase  29.96 
 
 
562 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0379  ribulokinase  33.27 
 
 
577 aa  178  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1861  ribulokinase  32.38 
 
 
554 aa  176  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2596  predicted protein  31.54 
 
 
482 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.283853  normal  0.0118319 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0222  ribulokinase  31.58 
 
 
585 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2899  ribulokinase  31.51 
 
 
564 aa  172  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12881  predicted protein  30.04 
 
 
438 aa  167  4e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3274  ribulokinase  33.15 
 
 
598 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187785  normal  0.0296673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6219  ribulokinase  33.75 
 
 
551 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2735  ribulokinase  28.85 
 
 
564 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0871  ribulokinase  33.03 
 
 
564 aa  161  4e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0380  ribulokinase  33.39 
 
 
567 aa  159  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.526871  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  30.36 
 
 
506 aa  159  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2886  L-ribulokinase  31.03 
 
 
556 aa  158  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331814  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2057  carbohydrate kinase FGGY  30.28 
 
 
517 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.795187 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0575  ribulokinase  25.59 
 
 
546 aa  153  8.999999999999999e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0589  ribulokinase  25.59 
 
 
546 aa  153  8.999999999999999e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0749  L-ribulokinase  31.42 
 
 
572 aa  152  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135875  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  29.31 
 
 
498 aa  152  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2398  ribulokinase  28.6 
 
 
554 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1748  L-ribulokinase  27.95 
 
 
570 aa  151  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  29.44 
 
 
510 aa  150  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  23.41 
 
 
503 aa  150  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06940  L-ribulokinase  30.88 
 
 
579 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1927  ribulokinase  26.09 
 
 
536 aa  145  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35001  Ribulokinase-like protein  26.38 
 
 
524 aa  140  4.999999999999999e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  26.22 
 
 
538 aa  140  6e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  26.39 
 
 
512 aa  140  7e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  26.27 
 
 
509 aa  139  8.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  25.23 
 
 
497 aa  139  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2729  ribulokinase  25.48 
 
 
557 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0860748  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1239  L-ribulokinase  29.37 
 
 
544 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.711611  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3994  ribulokinase  28.62 
 
 
547 aa  135  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.026407  normal  0.515054 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0469  L-ribulokinase  28.42 
 
 
562 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  24.3 
 
 
500 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  27.87 
 
 
505 aa  130  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2064  ribulokinase  27.95 
 
 
557 aa  130  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000583792  hitchhiker  0.00000400193 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1977  ribulokinase  27.72 
 
 
557 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489271  normal  0.124359 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29860  pentulose/hexulose kinase  27.17 
 
 
495 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1997  ribulokinase  27.72 
 
 
557 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00226612  unclonable  0.0000285081 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  28.23 
 
 
498 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  29.21 
 
 
508 aa  128  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  26.01 
 
 
512 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2138  ribulokinase  28.98 
 
 
557 aa  127  7e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000886858  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  27.72 
 
 
505 aa  125  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4715  ribulokinase  31.16 
 
 
556 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  24.91 
 
 
518 aa  125  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0322  ribulokinase  26.49 
 
 
529 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.54265 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1383  carbohydrate kinase FGGY  26.58 
 
 
553 aa  123  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.396144  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2068  ribulokinase  26.71 
 
 
557 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000109649  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  23.73 
 
 
505 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  25.79 
 
 
548 aa  120  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  20.93 
 
 
506 aa  119  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0065  ribulokinase  26.42 
 
 
566 aa  117  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.268824  normal  0.306332 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00065  ribulokinase  26.75 
 
 
566 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3594  ribulokinase  26.75 
 
 
566 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560965  unclonable  0.0000000207418 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00064  hypothetical protein  26.75 
 
 
566 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0068  ribulokinase  26.25 
 
 
566 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.876967  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1119  ribulokinase  25.77 
 
 
563 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  25.88 
 
 
499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  22.72 
 
 
496 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0065  ribulokinase  26.58 
 
 
566 aa  114  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>