More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2495 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0269  ribitol kinase  62.29 
 
 		 534 aa  645    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2816  FGGY-family pentulose kinase  63.6 
 
 		 538 aa  665    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3705  D-ribulokinase  68.32 
 
 		 544 aa  729    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0244  ribitol kinase  62.48 
 
 		 534 aa  645    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0680  pentulose kinase  69.96 
 
 		 547 aa  775    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6255  FGGY-family pentulose kinase  85.98 
 
 		 545 aa  930    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2495  FGGY-family pentulose kinase  100 
 
 		 543 aa  1093    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.578248  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7374  ribitol kinase  71.51 
 
 		 544 aa  745    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2156  FGGY-family pentulose kinase  64.97 
 
 		 540 aa  647    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3440  FGGY-family pentulose kinase  68.88 
 
 		 544 aa  732    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.243574  normal  0.308227 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0555  ribulokinase  57.66 
 
 		 544 aa  599  1e-170  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0920  putative sugar kinase (ribulo-/ribitol kinase)  53 
 
 		 549 aa  537  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4697  FGGY-family pentulose kinase  46.47 
 
 		 545 aa  488  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.921712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0368  pentulose kinase  45.18 
 
 		 545 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0435  FGGY-family pentulose kinase  45.18 
 
 		 545 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1227  pentulose kinase  44.99 
 
 		 545 aa  471  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.838114 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0456  FGGY-family pentulose kinase  49.53 
 
 		 547 aa  462  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.708838  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0847  FGGY-family pentulose kinase  47.1 
 
 		 543 aa  457  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0389776  normal  0.126532 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02649  L-ribulokinase AraB-like protein  44.13 
 
 		 542 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02610  hypothetical protein  44.13 
 
 		 526 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3921  FGGY-family pentulose kinase  43.33 
 
 		 528 aa  398  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1346  pentulose kinase  45.45 
 
 		 526 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.664914  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3784  FGGY-family pentulose kinase  42.63 
 
 		 529 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0121132  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3411  FGGY-family pentulose kinase  41.35 
 
 		 525 aa  373  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110951  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3746  FGGY-family pentulose kinase  43.03 
 
 		 527 aa  372  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2351  FGGY-family pentulose kinase  42.86 
 
 		 528 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.400628  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01568  conserved hypothetical protein  38.41 
 
 		 603 aa  353  2.9999999999999997e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.677654  normal  0.0579254 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3444  FGGY-family pentulose kinase  42.63 
 
 		 527 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86603  possible ribitol kinase or glycerol kinase  40.52 
 
 		 758 aa  342  9e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3574  ribitol kinase  39.32 
 
 		 523 aa  339  5.9999999999999996e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.197802  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00680  conserved hypothetical protein  34.26 
 
 		 621 aa  332  9e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06985  FGGY-family carbohydrate kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04680)  36.55 
 
 		 541 aa  284  3.0000000000000004e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4175  carbohydrate kinase, FGGY  36.94 
 
 		 480 aa  258  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.929603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  31.27 
 
 		 502 aa  219  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  29.25 
 
 		 497 aa  197  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  31.46 
 
 		 524 aa  196  7e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  27.46 
 
 		 503 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2684  carbohydrate kinase, FGGY  29.69 
 
 		 501 aa  181  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.849942 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0379  ribulokinase  32.89 
 
 		 577 aa  177  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2886  L-ribulokinase  31.45 
 
 		 556 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1861  ribulokinase  30.59 
 
 		 554 aa  171  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2229  ribulokinase  27.5 
 
 		 556 aa  170  7e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00201608  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0222  ribulokinase  32.08 
 
 		 585 aa  169  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3662  ribulokinase  27.57 
 
 		 562 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6219  ribulokinase  32.25 
 
 		 551 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  28.38 
 
 		 509 aa  160  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12881  predicted protein  29.52 
 
 		 438 aa  159  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0749  L-ribulokinase  31.14 
 
 		 572 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3274  ribulokinase  32.15 
 
 		 598 aa  156  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187785  normal  0.0296673 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  27.92 
 
 		 530 aa  151  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  28.63 
 
 		 498 aa  151  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2596  predicted protein  28.32 
 
 		 482 aa  150  8e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.283853  normal  0.0118319 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  24.95 
 
 		 500 aa  144  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1748  L-ribulokinase  27.66 
 
 		 570 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  25.37 
 
 		 509 aa  141  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0871  ribulokinase  30.45 
 
 		 564 aa  141  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  26.68 
 
 		 538 aa  141  3e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  26.31 
 
 		 513 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0380  ribulokinase  31.39 
 
 		 567 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.526871  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  26.36 
 
 		 514 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  25.93 
 
 		 513 aa  139  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  26.12 
 
 		 513 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  26.12 
 
 		 513 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  26.12 
 
 		 513 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06940  L-ribulokinase  30 
 
 		 579 aa  137  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2735  ribulokinase  25.62 
 
 		 564 aa  137  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  27.07 
 
 		 512 aa  137  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2899  ribulokinase  26.1 
 
 		 564 aa  137  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  25.52 
 
 		 518 aa  136  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  25.93 
 
 		 513 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  25.56 
 
 		 512 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0575  ribulokinase  23.84 
 
 		 546 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0589  ribulokinase  23.84 
 
 		 546 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  25.75 
 
 		 513 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1119  ribulokinase  26.35 
 
 		 563 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  25.7 
 
 		 513 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  24.51 
 
 		 505 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  24.34 
 
 		 506 aa  130  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  25 
 
 		 509 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4715  ribulokinase  29.22 
 
 		 556 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0110  ribulokinase  27.85 
 
 		 569 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.407492 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0068  ribulokinase  27.99 
 
 		 566 aa  127  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.876967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29860  pentulose/hexulose kinase  29.25 
 
 		 495 aa  126  9e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00065  ribulokinase  28.42 
 
 		 566 aa  126  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0114  ribulokinase  27.67 
 
 		 569 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00064  hypothetical protein  28.42 
 
 		 566 aa  126  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3594  ribulokinase  28.42 
 
 		 566 aa  126  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560965  unclonable  0.0000000207418 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0114  ribulokinase  27.67 
 
 		 569 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.728567  normal  0.199883 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3536  L-ribulokinase  28.16 
 
 		 566 aa  125  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0137  carbohydrate kinase  26.02 
 
 		 519 aa  125  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0065  ribulokinase  28.47 
 
 		 566 aa  125  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703841  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0065  ribulokinase  28.16 
 
 		 566 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.268824  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0067  ribulokinase  28.47 
 
 		 566 aa  124  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0055  ribulokinase  28.47 
 
 		 566 aa  124  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3994  ribulokinase  28.24 
 
 		 547 aa  124  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.026407  normal  0.515054 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0107  ribulokinase  27.62 
 
 		 569 aa  124  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2398  ribulokinase  28.34 
 
 		 554 aa  123  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  26.79 
 
 		 505 aa  123  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0109  ribulokinase  27.49 
 
 		 569 aa  123  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.526121 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  28.09 
 
 		 505 aa  123  8e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>