More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_86603 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_86603  possible ribitol kinase or glycerol kinase  100 
 
 		 758 aa  1580    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01568  conserved hypothetical protein  52.73 
 
 		 603 aa  535  1e-150  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.677654  normal  0.0579254 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06985  FGGY-family carbohydrate kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04680)  56.22 
 
 		 541 aa  498  1e-139  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00680  conserved hypothetical protein  47 
 
 		 621 aa  468  9.999999999999999e-131  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4697  FGGY-family pentulose kinase  37.2 
 
 		 545 aa  359  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.921712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2495  FGGY-family pentulose kinase  38.9 
 
 		 543 aa  355  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.578248  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0435  FGGY-family pentulose kinase  36.64 
 
 		 545 aa  350  4e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0368  pentulose kinase  36.64 
 
 		 545 aa  350  4e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1227  pentulose kinase  36.45 
 
 		 545 aa  348  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.838114 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2816  FGGY-family pentulose kinase  40.39 
 
 		 538 aa  340  7e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0680  pentulose kinase  41.76 
 
 		 547 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0269  ribitol kinase  39.88 
 
 		 534 aa  338  2.9999999999999997e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0456  FGGY-family pentulose kinase  40.91 
 
 		 547 aa  337  7e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.708838  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6255  FGGY-family pentulose kinase  40.7 
 
 		 545 aa  336  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0244  ribitol kinase  39.69 
 
 		 534 aa  335  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3921  FGGY-family pentulose kinase  39.17 
 
 		 528 aa  326  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3440  FGGY-family pentulose kinase  38.7 
 
 		 544 aa  324  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.243574  normal  0.308227 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1346  pentulose kinase  39.22 
 
 		 526 aa  323  8e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.664914  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3705  D-ribulokinase  37.75 
 
 		 544 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0920  putative sugar kinase (ribulo-/ribitol kinase)  39.37 
 
 		 549 aa  317  8e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0847  FGGY-family pentulose kinase  38.09 
 
 		 543 aa  315  1.9999999999999998e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0389776  normal  0.126532 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3784  FGGY-family pentulose kinase  39.37 
 
 		 529 aa  314  3.9999999999999997e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0121132  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02610  hypothetical protein  37.52 
 
 		 526 aa  312  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02649  L-ribulokinase AraB-like protein  37.52 
 
 		 542 aa  312  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3746  FGGY-family pentulose kinase  36.54 
 
 		 527 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2351  FGGY-family pentulose kinase  37.69 
 
 		 528 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.400628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2156  FGGY-family pentulose kinase  39.92 
 
 		 540 aa  308  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0555  ribulokinase  38.11 
 
 		 544 aa  306  9.000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7374  ribitol kinase  39.73 
 
 		 544 aa  305  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3411  FGGY-family pentulose kinase  36.86 
 
 		 525 aa  300  6e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110951  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3444  FGGY-family pentulose kinase  36.35 
 
 		 527 aa  292  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3574  ribitol kinase  35.35 
 
 		 523 aa  268  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.197802  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4175  carbohydrate kinase, FGGY  31.68 
 
 		 480 aa  204  7e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.929603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35001  Ribulokinase-like protein  30.33 
 
 		 524 aa  162  3e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  29.48 
 
 		 524 aa  161  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0575  ribulokinase  25.42 
 
 		 546 aa  158  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0589  ribulokinase  25.42 
 
 		 546 aa  158  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  25.78 
 
 		 497 aa  157  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  26.33 
 
 		 502 aa  152  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1927  ribulokinase  26.15 
 
 		 536 aa  144  7e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2899  ribulokinase  28.33 
 
 		 564 aa  138  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1861  ribulokinase  27.84 
 
 		 554 aa  137  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0222  ribulokinase  27.97 
 
 		 585 aa  137  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2229  ribulokinase  26 
 
 		 556 aa  134  7.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00201608  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2735  ribulokinase  27.73 
 
 		 564 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3662  ribulokinase  26.01 
 
 		 562 aa  131  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0749  L-ribulokinase  27.78 
 
 		 572 aa  129  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0379  ribulokinase  26.76 
 
 		 577 aa  128  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3274  ribulokinase  26.89 
 
 		 598 aa  128  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187785  normal  0.0296673 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2684  carbohydrate kinase, FGGY  23.87 
 
 		 501 aa  122  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.849942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2886  L-ribulokinase  26.55 
 
 		 556 aa  121  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6219  ribulokinase  27.2 
 
 		 551 aa  120  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4715  ribulokinase  26.94 
 
 		 556 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12881  predicted protein  27.36 
 
 		 438 aa  119  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06940  L-ribulokinase  26.82 
 
 		 579 aa  115  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2596  predicted protein  26.62 
 
 		 482 aa  114  6e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.283853  normal  0.0118319 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29860  pentulose/hexulose kinase  26.22 
 
 		 495 aa  108  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0871  ribulokinase  24.62 
 
 		 564 aa  107  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  26.11 
 
 		 511 aa  103  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1119  ribulokinase  26.67 
 
 		 563 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0469  L-ribulokinase  26.37 
 
 		 562 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  25.25 
 
 		 506 aa  102  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0322  ribulokinase  24.08 
 
 		 529 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.54265 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1748  L-ribulokinase  26.11 
 
 		 570 aa  102  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2057  carbohydrate kinase FGGY  24.45 
 
 		 517 aa  101  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.795187 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  23.5 
 
 		 503 aa  101  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  21.92 
 
 		 500 aa  100  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0380  ribulokinase  27.45 
 
 		 567 aa  100  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.526871  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  26.27 
 
 		 548 aa  98.2  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  24.27 
 
 		 509 aa  97.4  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  24.8 
 
 		 506 aa  95.5  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  23.63 
 
 		 512 aa  92  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  22.09 
 
 		 538 aa  91.7  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  23.79 
 
 		 509 aa  90.5  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  23.88 
 
 		 498 aa  88.2  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  22.9 
 
 		 510 aa  88.2  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  24.03 
 
 		 512 aa  86.7  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1803  glycerol kinase  21.69 
 
 		 509 aa  85.5  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  24.9 
 
 		 518 aa  84.3  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  23.87 
 
 		 506 aa  84  0.000000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2398  ribulokinase  24.49 
 
 		 554 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  23.18 
 
 		 506 aa  82.4  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2064  ribulokinase  25.1 
 
 		 557 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000583792  hitchhiker  0.00000400193 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32990  pentulose/hexulose kinase  22.94 
 
 		 489 aa  80.1  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  25.1 
 
 		 512 aa  79.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  23.78 
 
 		 492 aa  79.7  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1977  ribulokinase  25.48 
 
 		 557 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489271  normal  0.124359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1239  L-ribulokinase  25.19 
 
 		 544 aa  79.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.711611  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  23.78 
 
 		 492 aa  79.7  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3685  carbohydrate kinase, FGGY  23.37 
 
 		 510 aa  79.7  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  22.36 
 
 		 505 aa  79.3  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  23.15 
 
 		 514 aa  79  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1997  ribulokinase  25.25 
 
 		 557 aa  79  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00226612  unclonable  0.0000285081 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  24.17 
 
 		 498 aa  78.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4197  xylulokinase  23.09 
 
 		 515 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  23.09 
 
 		 515 aa  77.4  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0476  carbohydrate kinase, FGGY  25.2 
 
 		 499 aa  77  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  22.15 
 
 		 515 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  23.77 
 
 		 501 aa  75.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  21.11 
 
 		 495 aa  75.9  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.700195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>