More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12881 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_12881  predicted protein  100 
 
 
438 aa  896    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2596  predicted protein  50.23 
 
 
482 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.283853  normal  0.0118319 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  46.54 
 
 
502 aa  381  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  46.59 
 
 
497 aa  376  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  42.79 
 
 
524 aa  318  7.999999999999999e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2684  carbohydrate kinase, FGGY  39.22 
 
 
501 aa  289  7e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.849942 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  30.87 
 
 
506 aa  208  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  30.26 
 
 
538 aa  206  8e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  29.48 
 
 
506 aa  204  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  31.29 
 
 
530 aa  203  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  31.25 
 
 
518 aa  203  5e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  34.24 
 
 
509 aa  202  7e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  30.54 
 
 
512 aa  202  8e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  31.54 
 
 
498 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  30.72 
 
 
505 aa  197  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  32.31 
 
 
508 aa  197  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  31.56 
 
 
505 aa  196  7e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  30.43 
 
 
506 aa  194  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3921  FGGY-family pentulose kinase  31.53 
 
 
528 aa  194  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  29.87 
 
 
511 aa  193  5e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  29.19 
 
 
514 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  28.67 
 
 
512 aa  190  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  29.3 
 
 
500 aa  189  7e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  31.33 
 
 
548 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  30.7 
 
 
501 aa  189  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  30.49 
 
 
492 aa  187  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  30.49 
 
 
492 aa  187  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1912  carbohydrate kinase  31.74 
 
 
513 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314119  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1194  carbohydrate kinase  31.74 
 
 
513 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2073  carbohydrate kinase  31.74 
 
 
513 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1925  carbohydrate kinase  31.74 
 
 
513 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0220647  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  29.87 
 
 
497 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0861  carbohydrate kinase  31.74 
 
 
513 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0469  L-ribulokinase  31.43 
 
 
562 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1638  carbohydrate kinase  31.74 
 
 
513 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.241852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0300  carbohydrate kinase  31.74 
 
 
513 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104506  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  30.41 
 
 
511 aa  181  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  34.87 
 
 
498 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  27.11 
 
 
496 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  32.13 
 
 
481 aa  180  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  31.87 
 
 
510 aa  179  7e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  30.26 
 
 
515 aa  179  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  30.04 
 
 
514 aa  179  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  29.4 
 
 
486 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2735  ribulokinase  29.47 
 
 
564 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  31.46 
 
 
506 aa  178  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1267  carbohydrate kinase, FGGY  31.38 
 
 
501 aa  178  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  27.79 
 
 
512 aa  178  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  30.95 
 
 
496 aa  176  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  31.88 
 
 
504 aa  176  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  32.13 
 
 
472 aa  176  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  32.6 
 
 
506 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2899  ribulokinase  30.32 
 
 
564 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3787  xylulokinase  30.57 
 
 
520 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  28.73 
 
 
514 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  29.82 
 
 
515 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  30.04 
 
 
515 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  30.13 
 
 
509 aa  173  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  30.04 
 
 
515 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  30.04 
 
 
515 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  26.39 
 
 
503 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3411  FGGY-family pentulose kinase  30.84 
 
 
525 aa  172  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110951  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29860  pentulose/hexulose kinase  29.52 
 
 
495 aa  172  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4197  xylulokinase  30.8 
 
 
515 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  29.35 
 
 
502 aa  171  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2229  ribulokinase  28.45 
 
 
556 aa  171  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00201608  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  30.39 
 
 
498 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  32.81 
 
 
499 aa  170  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2431  carbohydrate kinase  30.26 
 
 
514 aa  169  8e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02649  L-ribulokinase AraB-like protein  29.16 
 
 
542 aa  169  9e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02610  hypothetical protein  29.16 
 
 
526 aa  169  9e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  32.13 
 
 
501 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  27.29 
 
 
512 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3274  ribulokinase  30.51 
 
 
598 aa  168  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187785  normal  0.0296673 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  27.07 
 
 
512 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  26.5 
 
 
509 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  27.07 
 
 
511 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32990  pentulose/hexulose kinase  28.03 
 
 
489 aa  166  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  30.7 
 
 
505 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  27.11 
 
 
500 aa  166  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  28.6 
 
 
499 aa  166  9e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  28.41 
 
 
495 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  30.54 
 
 
472 aa  164  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  26.7 
 
 
512 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0847  FGGY-family pentulose kinase  30.27 
 
 
543 aa  162  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0389776  normal  0.126532 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  27.17 
 
 
506 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  28.89 
 
 
515 aa  160  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  29.71 
 
 
512 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1346  pentulose kinase  30.56 
 
 
526 aa  160  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.664914  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  26.32 
 
 
513 aa  160  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1227  pentulose kinase  28.99 
 
 
545 aa  160  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.838114 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0435  FGGY-family pentulose kinase  28.99 
 
 
545 aa  160  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0368  pentulose kinase  28.99 
 
 
545 aa  160  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2495  FGGY-family pentulose kinase  29.52 
 
 
543 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.578248  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0456  FGGY-family pentulose kinase  29.42 
 
 
547 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.708838  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  27.41 
 
 
512 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4697  FGGY-family pentulose kinase  29.19 
 
 
545 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.921712  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  26.32 
 
 
513 aa  157  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  26.97 
 
 
513 aa  157  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  30.56 
 
 
511 aa  156  9e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>