More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ00680 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006679  CNJ00680  conserved hypothetical protein  100 
 
 
621 aa  1288    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01568  conserved hypothetical protein  45.84 
 
 
603 aa  497  1e-139  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.677654  normal  0.0579254 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86603  possible ribitol kinase or glycerol kinase  46.67 
 
 
758 aa  459  9.999999999999999e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06985  FGGY-family carbohydrate kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04680)  47.22 
 
 
541 aa  455  1.0000000000000001e-126  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4697  FGGY-family pentulose kinase  39.97 
 
 
545 aa  441  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.921712  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0368  pentulose kinase  38.4 
 
 
545 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0435  FGGY-family pentulose kinase  38.4 
 
 
545 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1227  pentulose kinase  38.24 
 
 
545 aa  413  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.838114 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0456  FGGY-family pentulose kinase  37.83 
 
 
547 aa  355  1e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.708838  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0847  FGGY-family pentulose kinase  35.99 
 
 
543 aa  340  2.9999999999999998e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0389776  normal  0.126532 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1346  pentulose kinase  39.36 
 
 
526 aa  337  5e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.664914  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0680  pentulose kinase  37.71 
 
 
547 aa  333  6e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2495  FGGY-family pentulose kinase  34.26 
 
 
543 aa  332  9e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.578248  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3705  D-ribulokinase  37.03 
 
 
544 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0269  ribitol kinase  36.09 
 
 
534 aa  328  2.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0244  ribitol kinase  36.09 
 
 
534 aa  328  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3921  FGGY-family pentulose kinase  34.58 
 
 
528 aa  325  2e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3440  FGGY-family pentulose kinase  36.65 
 
 
544 aa  323  7e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.243574  normal  0.308227 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0920  putative sugar kinase (ribulo-/ribitol kinase)  37.85 
 
 
549 aa  322  9.000000000000001e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2816  FGGY-family pentulose kinase  35.16 
 
 
538 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6255  FGGY-family pentulose kinase  35.83 
 
 
545 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3411  FGGY-family pentulose kinase  35.8 
 
 
525 aa  317  3e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110951  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7374  ribitol kinase  36.71 
 
 
544 aa  315  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2351  FGGY-family pentulose kinase  37.14 
 
 
528 aa  312  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.400628  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0555  ribulokinase  35.22 
 
 
544 aa  306  6e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3784  FGGY-family pentulose kinase  36.96 
 
 
529 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0121132  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2156  FGGY-family pentulose kinase  36.59 
 
 
540 aa  298  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314644  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02649  L-ribulokinase AraB-like protein  35.92 
 
 
542 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02610  hypothetical protein  35.92 
 
 
526 aa  291  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3746  FGGY-family pentulose kinase  35.05 
 
 
527 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26976  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3444  FGGY-family pentulose kinase  35.81 
 
 
527 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3574  ribitol kinase  35.05 
 
 
523 aa  280  6e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.197802  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4175  carbohydrate kinase, FGGY  28.8 
 
 
480 aa  184  6e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.929603  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  26.79 
 
 
502 aa  171  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  26.51 
 
 
497 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  26.8 
 
 
524 aa  153  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2899  ribulokinase  26.82 
 
 
564 aa  150  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2735  ribulokinase  28.68 
 
 
564 aa  146  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0575  ribulokinase  25.91 
 
 
546 aa  139  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0589  ribulokinase  25.91 
 
 
546 aa  139  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35001  Ribulokinase-like protein  27.07 
 
 
524 aa  138  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1927  ribulokinase  24.86 
 
 
536 aa  131  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2229  ribulokinase  25.04 
 
 
556 aa  130  8.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00201608  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2684  carbohydrate kinase, FGGY  26.86 
 
 
501 aa  128  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.849942 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1861  ribulokinase  26.13 
 
 
554 aa  125  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6219  ribulokinase  27.12 
 
 
551 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2057  carbohydrate kinase FGGY  25.68 
 
 
517 aa  121  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.795187 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0871  ribulokinase  26.44 
 
 
564 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1119  ribulokinase  27.37 
 
 
563 aa  114  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0749  L-ribulokinase  26.84 
 
 
572 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135875  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06940  L-ribulokinase  25.37 
 
 
579 aa  110  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3274  ribulokinase  27.2 
 
 
598 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187785  normal  0.0296673 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3662  ribulokinase  26.65 
 
 
562 aa  108  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12881  predicted protein  23.87 
 
 
438 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0222  ribulokinase  24.77 
 
 
585 aa  105  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0380  ribulokinase  25.9 
 
 
567 aa  105  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.526871  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2596  predicted protein  24.31 
 
 
482 aa  104  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.283853  normal  0.0118319 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0379  ribulokinase  25.41 
 
 
577 aa  103  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0322  ribulokinase  23.49 
 
 
529 aa  100  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.54265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4715  ribulokinase  25.57 
 
 
556 aa  99.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2886  L-ribulokinase  25 
 
 
556 aa  98.2  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331814  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1748  L-ribulokinase  23.88 
 
 
570 aa  96.7  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0610  ribulokinase  26.85 
 
 
569 aa  96.3  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.59168  normal  0.0130922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2398  ribulokinase  26.03 
 
 
554 aa  94.4  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  24.29 
 
 
503 aa  92.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1913  ribulokinase  23.99 
 
 
563 aa  87.8  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0110  ribulokinase  26.59 
 
 
569 aa  87.4  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.407492 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2028  ribulokinase  25 
 
 
566 aa  87.4  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  23.57 
 
 
511 aa  87.8  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0068  ribulokinase  26.78 
 
 
566 aa  87.4  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.876967  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0055  ribulokinase  26.78 
 
 
566 aa  87.4  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2729  ribulokinase  25.99 
 
 
557 aa  87  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0860748  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0114  ribulokinase  26.59 
 
 
569 aa  87  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.728567  normal  0.199883 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  23.77 
 
 
506 aa  87  9e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  23.26 
 
 
514 aa  87  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00065  ribulokinase  26.78 
 
 
566 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00064  hypothetical protein  26.78 
 
 
566 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3594  ribulokinase  26.78 
 
 
566 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560965  unclonable  0.0000000207418 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0065  ribulokinase  26.96 
 
 
566 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.268824  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0114  ribulokinase  26.59 
 
 
569 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0065  ribulokinase  26.59 
 
 
566 aa  85.5  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703841  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  22.63 
 
 
510 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0469  L-ribulokinase  24.02 
 
 
562 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3536  L-ribulokinase  26.59 
 
 
566 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  22.08 
 
 
509 aa  84.7  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0107  ribulokinase  26.23 
 
 
569 aa  84.3  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  22.5 
 
 
499 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0067  ribulokinase  26.41 
 
 
566 aa  84  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0109  ribulokinase  26.41 
 
 
569 aa  84  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.526121 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  23.6 
 
 
495 aa  82.8  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2328  ribulokinase  24.42 
 
 
561 aa  82  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.717487  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  24.09 
 
 
512 aa  81.6  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3787  xylulokinase  23.21 
 
 
520 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  21.8 
 
 
530 aa  80.9  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2150  ribulokinase  25.36 
 
 
561 aa  80.5  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  22.74 
 
 
508 aa  80.1  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1239  L-ribulokinase  24.75 
 
 
544 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.711611  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2260  ribulokinase  25.18 
 
 
567 aa  78.6  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  22.56 
 
 
518 aa  78.6  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  22.67 
 
 
514 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>