74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_35001 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_35001  Ribulokinase-like protein  100 
 
 		 524 aa  1087    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01568  conserved hypothetical protein  27.85 
 
 		 603 aa  173  6.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.677654  normal  0.0579254 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86603  possible ribitol kinase or glycerol kinase  30.33 
 
 		 758 aa  161  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06985  FGGY-family carbohydrate kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04680)  24.53 
 
 		 541 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00680  conserved hypothetical protein  27.18 
 
 		 621 aa  137  4e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0456  FGGY-family pentulose kinase  26.03 
 
 		 547 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.708838  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02610  hypothetical protein  25.86 
 
 		 526 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02649  L-ribulokinase AraB-like protein  25.86 
 
 		 542 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0368  pentulose kinase  25.47 
 
 		 545 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0435  FGGY-family pentulose kinase  25.47 
 
 		 545 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3411  FGGY-family pentulose kinase  26.82 
 
 		 525 aa  119  9e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110951  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2495  FGGY-family pentulose kinase  24.57 
 
 		 543 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.578248  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1227  pentulose kinase  25.3 
 
 		 545 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.838114 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0680  pentulose kinase  24.39 
 
 		 547 aa  118  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4697  FGGY-family pentulose kinase  25.04 
 
 		 545 aa  117  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.921712  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0269  ribitol kinase  25.19 
 
 		 534 aa  114  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0244  ribitol kinase  25.48 
 
 		 534 aa  114  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2816  FGGY-family pentulose kinase  23.85 
 
 		 538 aa  113  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3440  FGGY-family pentulose kinase  24.86 
 
 		 544 aa  113  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.243574  normal  0.308227 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0847  FGGY-family pentulose kinase  25.3 
 
 		 543 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0389776  normal  0.126532 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6255  FGGY-family pentulose kinase  23.95 
 
 		 545 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0555  ribulokinase  24.86 
 
 		 544 aa  110  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3705  D-ribulokinase  24.5 
 
 		 544 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3921  FGGY-family pentulose kinase  24.09 
 
 		 528 aa  106  9e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3784  FGGY-family pentulose kinase  24.64 
 
 		 529 aa  106  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0121132  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3746  FGGY-family pentulose kinase  25.33 
 
 		 527 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1346  pentulose kinase  25.23 
 
 		 526 aa  104  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.664914  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3444  FGGY-family pentulose kinase  24.91 
 
 		 527 aa  97.4  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2351  FGGY-family pentulose kinase  24.29 
 
 		 528 aa  95.9  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.400628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7374  ribitol kinase  23.6 
 
 		 544 aa  89.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4175  carbohydrate kinase, FGGY  23.7 
 
 		 480 aa  85.5  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.929603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2156  FGGY-family pentulose kinase  31.89 
 
 		 540 aa  84.7  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0920  putative sugar kinase (ribulo-/ribitol kinase)  23.12 
 
 		 549 aa  82.4  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  23.97 
 
 		 524 aa  72.8  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3574  ribitol kinase  22.69 
 
 		 523 aa  68.6  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.197802  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2684  carbohydrate kinase, FGGY  22.73 
 
 		 501 aa  65.9  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.849942 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  24.26 
 
 		 502 aa  65.1  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12881  predicted protein  21.93 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3274  ribulokinase  22.76 
 
 		 598 aa  63.9  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187785  normal  0.0296673 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0222  ribulokinase  23 
 
 		 585 aa  60.1  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0379  ribulokinase  22.98 
 
 		 577 aa  59.3  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  23.85 
 
 		 503 aa  58.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06940  L-ribulokinase  22.6 
 
 		 579 aa  58.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0575  ribulokinase  23.25 
 
 		 546 aa  58.2  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0589  ribulokinase  23.25 
 
 		 546 aa  58.2  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1861  ribulokinase  23.53 
 
 		 554 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4715  ribulokinase  22.83 
 
 		 556 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2596  predicted protein  23.68 
 
 		 482 aa  54.7  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.283853  normal  0.0118319 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2229  ribulokinase  22.92 
 
 		 556 aa  53.9  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00201608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6219  ribulokinase  21.46 
 
 		 551 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1365  glycerol kinase  27.1 
 
 		 491 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1369  glycerol kinase  31.33 
 
 		 491 aa  51.6  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2899  ribulokinase  22.28 
 
 		 564 aa  51.2  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1927  ribulokinase  29.36 
 
 		 536 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0380  ribulokinase  21.65 
 
 		 567 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.526871  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  23.17 
 
 		 497 aa  48.9  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2057  carbohydrate kinase FGGY  23.63 
 
 		 517 aa  48.5  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.795187 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3533  glycerol kinase  21.44 
 
 		 499 aa  48.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.904687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  20.2 
 
 		 512 aa  47.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0749  L-ribulokinase  22.51 
 
 		 572 aa  47.4  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  22.56 
 
 		 500 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  33.33 
 
 		 494 aa  47  0.0009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  21.46 
 
 		 506 aa  45.8  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  22.44 
 
 		 486 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  28.75 
 
 		 498 aa  45.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  28.75 
 
 		 498 aa  45.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  21.03 
 
 		 506 aa  45.4  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1239  L-ribulokinase  21.43 
 
 		 544 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.711611  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1916  glycerol kinase  30 
 
 		 496 aa  44.3  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0267705  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  22.22 
 
 		 484 aa  43.9  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  22.22 
 
 		 484 aa  43.5  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  20.6 
 
 		 500 aa  43.5  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  22.22 
 
 		 484 aa  43.5  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3376  glycerol kinase  21.22 
 
 		 495 aa  43.5  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>