More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0680 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2495  FGGY-family pentulose kinase  69.96 
 
 		 543 aa  775    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.578248  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2816  FGGY-family pentulose kinase  62.78 
 
 		 538 aa  654    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0269  ribitol kinase  62.29 
 
 		 534 aa  636    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0244  ribitol kinase  62.48 
 
 		 534 aa  637    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3705  D-ribulokinase  71.78 
 
 		 544 aa  751    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0680  pentulose kinase  100 
 
 		 547 aa  1100    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2156  FGGY-family pentulose kinase  66.48 
 
 		 540 aa  649    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6255  FGGY-family pentulose kinase  70.68 
 
 		 545 aa  759    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7374  ribitol kinase  67.61 
 
 		 544 aa  711    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3440  FGGY-family pentulose kinase  71.78 
 
 		 544 aa  749    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.243574  normal  0.308227 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0555  ribulokinase  57.28 
 
 		 544 aa  585  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0920  putative sugar kinase (ribulo-/ribitol kinase)  53.1 
 
 		 549 aa  514  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4697  FGGY-family pentulose kinase  47.85 
 
 		 545 aa  511  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.921712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1227  pentulose kinase  48.01 
 
 		 545 aa  505  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.838114 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0435  FGGY-family pentulose kinase  48.2 
 
 		 545 aa  507  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0368  pentulose kinase  48.2 
 
 		 545 aa  507  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0456  FGGY-family pentulose kinase  50.09 
 
 		 547 aa  462  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.708838  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0847  FGGY-family pentulose kinase  46.18 
 
 		 543 aa  440  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0389776  normal  0.126532 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3921  FGGY-family pentulose kinase  44.13 
 
 		 528 aa  405  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02610  hypothetical protein  42.67 
 
 		 526 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02649  L-ribulokinase AraB-like protein  42.67 
 
 		 542 aa  392  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1346  pentulose kinase  44.38 
 
 		 526 aa  385  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.664914  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3411  FGGY-family pentulose kinase  43.53 
 
 		 525 aa  382  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110951  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3784  FGGY-family pentulose kinase  42.21 
 
 		 529 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0121132  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2351  FGGY-family pentulose kinase  42.47 
 
 		 528 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.400628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3746  FGGY-family pentulose kinase  39.55 
 
 		 527 aa  356  6.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26976  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01568  conserved hypothetical protein  39.73 
 
 		 603 aa  351  2e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.677654  normal  0.0579254 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3444  FGGY-family pentulose kinase  39.77 
 
 		 527 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00680  conserved hypothetical protein  37.71 
 
 		 621 aa  333  7.000000000000001e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86603  possible ribitol kinase or glycerol kinase  41.84 
 
 		 758 aa  330  5.0000000000000004e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3574  ribitol kinase  37.83 
 
 		 523 aa  328  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.197802  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4175  carbohydrate kinase, FGGY  37.98 
 
 		 480 aa  281  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.929603  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06985  FGGY-family carbohydrate kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04680)  36.63 
 
 		 541 aa  276  5e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  30.39 
 
 		 502 aa  207  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  33.2 
 
 		 524 aa  207  5e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  30.93 
 
 		 497 aa  195  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2684  carbohydrate kinase, FGGY  30.11 
 
 		 501 aa  181  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.849942 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  26 
 
 		 503 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2229  ribulokinase  26.78 
 
 		 556 aa  160  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00201608  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0379  ribulokinase  29.6 
 
 		 577 aa  156  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2886  L-ribulokinase  29.06 
 
 		 556 aa  155  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331814  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  25.39 
 
 		 513 aa  154  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0222  ribulokinase  29.4 
 
 		 585 aa  154  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  27.78 
 
 		 530 aa  153  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3662  ribulokinase  29.04 
 
 		 562 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  25.2 
 
 		 513 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1861  ribulokinase  30.31 
 
 		 554 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  25.59 
 
 		 512 aa  150  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  28.51 
 
 		 514 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3274  ribulokinase  30.97 
 
 		 598 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187785  normal  0.0296673 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  25.2 
 
 		 513 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  25.75 
 
 		 509 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  25 
 
 		 513 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2899  ribulokinase  26.81 
 
 		 564 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  25 
 
 		 513 aa  147  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  25 
 
 		 513 aa  147  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  25 
 
 		 513 aa  147  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  25 
 
 		 513 aa  147  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  28.46 
 
 		 509 aa  146  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2596  predicted protein  28.43 
 
 		 482 aa  145  1e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.283853  normal  0.0118319 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2735  ribulokinase  27.78 
 
 		 564 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0749  L-ribulokinase  30.28 
 
 		 572 aa  144  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  25.41 
 
 		 512 aa  144  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  25.58 
 
 		 506 aa  143  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  25.96 
 
 		 505 aa  143  8e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12881  predicted protein  28.51 
 
 		 438 aa  140  4.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  28.36 
 
 		 498 aa  140  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  23.6 
 
 		 506 aa  138  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  28 
 
 		 519 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  29.8 
 
 		 505 aa  134  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6219  ribulokinase  29.53 
 
 		 551 aa  133  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  27.8 
 
 		 508 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  25.59 
 
 		 512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0589  ribulokinase  22.95 
 
 		 546 aa  128  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0575  ribulokinase  22.95 
 
 		 546 aa  128  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0871  ribulokinase  29.12 
 
 		 564 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  24.44 
 
 		 518 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2398  ribulokinase  28.6 
 
 		 554 aa  127  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  24.09 
 
 		 512 aa  127  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  24.09 
 
 		 511 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  24.73 
 
 		 512 aa  126  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  23.08 
 
 		 500 aa  126  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  24.73 
 
 		 512 aa  126  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29860  pentulose/hexulose kinase  28.73 
 
 		 495 aa  126  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1564  glycerol kinase  27.98 
 
 		 494 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  21.2 
 
 		 505 aa  125  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  24.55 
 
 		 511 aa  124  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  22.79 
 
 		 509 aa  123  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  27.1 
 
 		 510 aa  123  9e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  26.07 
 
 		 518 aa  122  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0380  ribulokinase  29.68 
 
 		 567 aa  123  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.526871  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  28.15 
 
 		 506 aa  121  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  25.33 
 
 		 538 aa  121  3e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2729  ribulokinase  26.29 
 
 		 557 aa  121  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0860748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18010  putative glycerol kinase  27.01 
 
 		 494 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00302845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  25.57 
 
 		 509 aa  121  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32990  pentulose/hexulose kinase  28.08 
 
 		 489 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06940  L-ribulokinase  28.13 
 
 		 579 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  23.91 
 
 		 497 aa  120  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2319  glycerol kinase  25.96 
 
 		 493 aa  120  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>