More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2684 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2684  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 
501 aa  1018    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.849942 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  38.4 
 
 
502 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  37.4 
 
 
497 aa  307  3e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12881  predicted protein  39.22 
 
 
438 aa  289  8e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  36.91 
 
 
524 aa  286  5.999999999999999e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2596  predicted protein  35.81 
 
 
482 aa  272  9e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.283853  normal  0.0118319 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02649  L-ribulokinase AraB-like protein  31.3 
 
 
542 aa  236  9e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02610  hypothetical protein  31.3 
 
 
526 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3921  FGGY-family pentulose kinase  32.37 
 
 
528 aa  230  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  26.34 
 
 
500 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  30.29 
 
 
510 aa  195  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3411  FGGY-family pentulose kinase  29.77 
 
 
525 aa  195  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110951  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  28.32 
 
 
538 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0456  FGGY-family pentulose kinase  30.17 
 
 
547 aa  190  4e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.708838  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  32.41 
 
 
506 aa  191  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3440  FGGY-family pentulose kinase  29.27 
 
 
544 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.243574  normal  0.308227 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  30.46 
 
 
498 aa  190  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3444  FGGY-family pentulose kinase  31 
 
 
527 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3746  FGGY-family pentulose kinase  31.32 
 
 
527 aa  189  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26976  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0435  FGGY-family pentulose kinase  28.02 
 
 
545 aa  186  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1227  pentulose kinase  28.02 
 
 
545 aa  186  6e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.838114 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0368  pentulose kinase  28.02 
 
 
545 aa  186  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0847  FGGY-family pentulose kinase  29.36 
 
 
543 aa  186  7e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0389776  normal  0.126532 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29860  pentulose/hexulose kinase  29.37 
 
 
495 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3705  D-ribulokinase  28.71 
 
 
544 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0269  ribitol kinase  29.66 
 
 
534 aa  183  7e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6255  FGGY-family pentulose kinase  29.8 
 
 
545 aa  183  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7374  ribitol kinase  29.18 
 
 
544 aa  182  8.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0244  ribitol kinase  29.66 
 
 
534 aa  183  8.000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4715  ribulokinase  32.26 
 
 
556 aa  182  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2229  ribulokinase  28.87 
 
 
556 aa  182  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00201608  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1346  pentulose kinase  31.76 
 
 
526 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.664914  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2495  FGGY-family pentulose kinase  29.69 
 
 
543 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.578248  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4697  FGGY-family pentulose kinase  28.02 
 
 
545 aa  181  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.921712  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0680  pentulose kinase  30.11 
 
 
547 aa  181  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  30.66 
 
 
512 aa  179  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32990  pentulose/hexulose kinase  30.24 
 
 
489 aa  179  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  30.4 
 
 
496 aa  177  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3574  ribitol kinase  30.38 
 
 
523 aa  174  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.197802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2886  L-ribulokinase  29.98 
 
 
556 aa  174  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331814  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  29.33 
 
 
509 aa  172  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  31.8 
 
 
501 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2816  FGGY-family pentulose kinase  29.18 
 
 
538 aa  171  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2351  FGGY-family pentulose kinase  29.78 
 
 
528 aa  171  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.400628  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2156  FGGY-family pentulose kinase  29.56 
 
 
540 aa  171  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314644  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2899  ribulokinase  29.6 
 
 
564 aa  170  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0871  ribulokinase  31.91 
 
 
564 aa  170  6e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  25.74 
 
 
492 aa  168  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  25.74 
 
 
492 aa  168  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  25.35 
 
 
497 aa  168  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3274  ribulokinase  30.71 
 
 
598 aa  168  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187785  normal  0.0296673 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  25.77 
 
 
503 aa  167  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  28.82 
 
 
495 aa  166  8e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0469  L-ribulokinase  30.58 
 
 
562 aa  166  8e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0379  ribulokinase  29.72 
 
 
577 aa  166  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3784  FGGY-family pentulose kinase  29.31 
 
 
529 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0121132  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  30.8 
 
 
498 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0555  ribulokinase  27.95 
 
 
544 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  26.62 
 
 
512 aa  165  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  28.63 
 
 
505 aa  164  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3662  ribulokinase  28.98 
 
 
562 aa  164  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  31.67 
 
 
498 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  25.68 
 
 
511 aa  162  9e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1861  ribulokinase  29.55 
 
 
554 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  29.63 
 
 
509 aa  162  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0575  ribulokinase  26.23 
 
 
546 aa  161  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  29.84 
 
 
515 aa  161  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0589  ribulokinase  26.23 
 
 
546 aa  161  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2625  carbohydrate kinase, FGGY  27.29 
 
 
505 aa  161  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2422  carbohydrate kinase, FGGY  30.83 
 
 
494 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  26.57 
 
 
501 aa  160  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0222  ribulokinase  29.77 
 
 
585 aa  160  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2467  carbohydrate kinase, FGGY  30.83 
 
 
494 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.634533  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2461  carbohydrate kinase, FGGY  31.03 
 
 
494 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0749  L-ribulokinase  33.19 
 
 
572 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135875  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  25.85 
 
 
518 aa  159  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2735  ribulokinase  30.02 
 
 
564 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  25.81 
 
 
503 aa  159  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  30 
 
 
472 aa  158  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1748  L-ribulokinase  28.97 
 
 
570 aa  158  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  28.4 
 
 
511 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  29.33 
 
 
548 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0380  ribulokinase  28.9 
 
 
567 aa  157  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.526871  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  28.88 
 
 
493 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  27.38 
 
 
484 aa  156  9e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  25.1 
 
 
506 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  26.1 
 
 
502 aa  155  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  28.29 
 
 
487 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  29.66 
 
 
505 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2529  carbohydrate kinase, FGGY  30.58 
 
 
493 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  31.01 
 
 
481 aa  155  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2574  carbohydrate kinase, FGGY  30.58 
 
 
493 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281212  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  29 
 
 
487 aa  155  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  27.49 
 
 
508 aa  155  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  27.89 
 
 
530 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  30.97 
 
 
472 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2566  carbohydrate kinase, FGGY  30.4 
 
 
493 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0028  xylulokinase  28.83 
 
 
483 aa  153  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.237536  normal  0.287388 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  27.47 
 
 
505 aa  153  5.9999999999999996e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  25.25 
 
 
486 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>