More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2086 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 
506 aa  1001    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  55.94 
 
 
498 aa  521  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  53.83 
 
 
501 aa  491  1e-137  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  53.28 
 
 
498 aa  471  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29860  pentulose/hexulose kinase  50.81 
 
 
495 aa  456  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32990  pentulose/hexulose kinase  51.72 
 
 
489 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  48.73 
 
 
510 aa  436  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2566  carbohydrate kinase, FGGY  49.6 
 
 
493 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2529  carbohydrate kinase, FGGY  49.6 
 
 
493 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2574  carbohydrate kinase, FGGY  49.6 
 
 
493 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281212  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  46.52 
 
 
505 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  45.76 
 
 
505 aa  398  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  41.37 
 
 
495 aa  357  1.9999999999999998e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3313  carbohydrate kinase, FGGY  42.38 
 
 
503 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  31.53 
 
 
512 aa  244  3e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  34.7 
 
 
509 aa  239  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1267  carbohydrate kinase, FGGY  36.2 
 
 
501 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  29.9 
 
 
492 aa  233  9e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  29.9 
 
 
492 aa  233  9e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  30.86 
 
 
506 aa  232  1e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  30.47 
 
 
506 aa  231  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  29.04 
 
 
506 aa  229  1e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  35.35 
 
 
548 aa  223  9e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  26.89 
 
 
511 aa  222  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  32.75 
 
 
508 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  29.02 
 
 
503 aa  219  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  31.35 
 
 
538 aa  218  2e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  35.79 
 
 
498 aa  216  8e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  34.31 
 
 
511 aa  216  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  30.04 
 
 
500 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  30.64 
 
 
518 aa  210  5e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  29.98 
 
 
501 aa  209  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  32.6 
 
 
493 aa  208  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2625  carbohydrate kinase, FGGY  32.82 
 
 
505 aa  205  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  30.82 
 
 
515 aa  204  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  32.62 
 
 
515 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  32.62 
 
 
515 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  32.62 
 
 
515 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  31.56 
 
 
499 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  32.82 
 
 
515 aa  204  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  29.09 
 
 
512 aa  202  8e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0476  carbohydrate kinase, FGGY  30.51 
 
 
499 aa  202  9e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  32.28 
 
 
512 aa  200  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2422  carbohydrate kinase, FGGY  33.67 
 
 
494 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2467  carbohydrate kinase, FGGY  33.67 
 
 
494 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.634533  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  32.95 
 
 
512 aa  197  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  32.69 
 
 
515 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  29.65 
 
 
514 aa  196  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  32.34 
 
 
497 aa  196  9e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2461  carbohydrate kinase, FGGY  33.47 
 
 
494 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4197  xylulokinase  32.5 
 
 
515 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  32.25 
 
 
524 aa  194  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  32.41 
 
 
506 aa  193  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  29.13 
 
 
514 aa  193  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  28.54 
 
 
496 aa  193  6e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3685  carbohydrate kinase, FGGY  33.33 
 
 
510 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2684  carbohydrate kinase, FGGY  32.41 
 
 
501 aa  191  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.849942 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  28.23 
 
 
497 aa  190  5.999999999999999e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0861  carbohydrate kinase  33.46 
 
 
513 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1194  carbohydrate kinase  33.46 
 
 
513 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2073  carbohydrate kinase  33.46 
 
 
513 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20388  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1912  carbohydrate kinase  32.62 
 
 
513 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314119  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1638  carbohydrate kinase  33.46 
 
 
513 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.241852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0300  carbohydrate kinase  33.46 
 
 
513 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104506  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1925  carbohydrate kinase  33.46 
 
 
513 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0220647  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3787  xylulokinase  33.41 
 
 
520 aa  187  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  31.21 
 
 
502 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  31.69 
 
 
504 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  31.34 
 
 
515 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  28.68 
 
 
509 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  31 
 
 
484 aa  182  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  32.47 
 
 
524 aa  182  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  27.94 
 
 
511 aa  181  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  25.89 
 
 
500 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12881  predicted protein  31.46 
 
 
438 aa  178  2e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3301  carbohydrate kinase FGGY  31.23 
 
 
501 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  27.17 
 
 
509 aa  178  3e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  27.85 
 
 
530 aa  178  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  31.76 
 
 
499 aa  178  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  27.08 
 
 
502 aa  177  6e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  25.63 
 
 
513 aa  176  9e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  31.06 
 
 
496 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  27.85 
 
 
503 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  25.63 
 
 
513 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  36.36 
 
 
472 aa  174  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  25.68 
 
 
513 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  32.56 
 
 
511 aa  173  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  26.43 
 
 
496 aa  172  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  35.51 
 
 
508 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2431  carbohydrate kinase  31.1 
 
 
514 aa  171  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  35.25 
 
 
481 aa  171  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  32.18 
 
 
517 aa  171  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  25.44 
 
 
513 aa  170  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  32.18 
 
 
517 aa  170  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  26.18 
 
 
512 aa  170  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  25.44 
 
 
513 aa  169  9e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  25.44 
 
 
513 aa  169  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  25.44 
 
 
513 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  25.44 
 
 
513 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  26.02 
 
 
512 aa  169  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>