More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3313 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3313  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 		 503 aa  1002    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  43.99 
 
 		 510 aa  395  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  43.12 
 
 		 495 aa  366  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  43.31 
 
 		 498 aa  369  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  43.09 
 
 		 505 aa  361  2e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  41.14 
 
 		 505 aa  360  3e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29860  pentulose/hexulose kinase  43.85 
 
 		 495 aa  353  4e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  42.38 
 
 		 506 aa  352  1e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  42.57 
 
 		 501 aa  347  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32990  pentulose/hexulose kinase  42.01 
 
 		 489 aa  330  4e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  41.39 
 
 		 498 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2566  carbohydrate kinase, FGGY  39.79 
 
 		 493 aa  310  5e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2529  carbohydrate kinase, FGGY  39.79 
 
 		 493 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2574  carbohydrate kinase, FGGY  39.79 
 
 		 493 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  30.48 
 
 		 506 aa  242  1e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  30.72 
 
 		 506 aa  236  7e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  30.88 
 
 		 506 aa  231  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  33.27 
 
 		 548 aa  216  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  30.18 
 
 		 501 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  26.25 
 
 		 511 aa  211  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  28.83 
 
 		 503 aa  209  6e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  27.94 
 
 		 512 aa  203  5e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  28.08 
 
 		 492 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  29.75 
 
 		 514 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  28.08 
 
 		 492 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  32.29 
 
 		 515 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  29.03 
 
 		 512 aa  196  9e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  32.09 
 
 		 515 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  32.09 
 
 		 515 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  32.09 
 
 		 515 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  32.29 
 
 		 515 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  26.69 
 
 		 500 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  30.56 
 
 		 514 aa  190  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4197  xylulokinase  31.9 
 
 		 515 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  31.27 
 
 		 508 aa  187  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  28.74 
 
 		 496 aa  186  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  26.98 
 
 		 490 aa  185  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  29.4 
 
 		 509 aa  183  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  29.6 
 
 		 511 aa  183  7e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  31.93 
 
 		 504 aa  183  8.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  28.37 
 
 		 530 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  27.44 
 
 		 497 aa  182  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3787  xylulokinase  31.21 
 
 		 520 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  28.79 
 
 		 499 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  29.27 
 
 		 503 aa  180  7e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  30.84 
 
 		 506 aa  179  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  30.24 
 
 		 493 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2422  carbohydrate kinase, FGGY  32.72 
 
 		 494 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1912  carbohydrate kinase  32.29 
 
 		 513 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314119  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2467  carbohydrate kinase, FGGY  32.72 
 
 		 494 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.634533  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  27.14 
 
 		 496 aa  177  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1194  carbohydrate kinase  32.09 
 
 		 513 aa  177  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2073  carbohydrate kinase  32.09 
 
 		 513 aa  177  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20388  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0300  carbohydrate kinase  32.09 
 
 		 513 aa  177  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104506  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0861  carbohydrate kinase  32.09 
 
 		 513 aa  177  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1925  carbohydrate kinase  32.09 
 
 		 513 aa  177  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0220647  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1638  carbohydrate kinase  32.09 
 
 		 513 aa  177  6e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.241852  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  25.46 
 
 		 489 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2461  carbohydrate kinase, FGGY  32.25 
 
 		 494 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  26.69 
 
 		 500 aa  174  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  25.64 
 
 		 512 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  28.27 
 
 		 511 aa  172  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  30.56 
 
 		 498 aa  172  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  28.94 
 
 		 515 aa  171  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  26.75 
 
 		 538 aa  171  3e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1267  carbohydrate kinase, FGGY  29.98 
 
 		 501 aa  170  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  27.73 
 
 		 488 aa  170  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3685  carbohydrate kinase, FGGY  29.24 
 
 		 510 aa  169  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  28.27 
 
 		 518 aa  168  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  32.53 
 
 		 501 aa  168  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  27.85 
 
 		 512 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  28.11 
 
 		 512 aa  167  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  27.85 
 
 		 511 aa  167  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  27.98 
 
 		 512 aa  167  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2431  carbohydrate kinase  31.69 
 
 		 514 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  30.75 
 
 		 505 aa  166  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  25.71 
 
 		 511 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  30.71 
 
 		 493 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  24.85 
 
 		 513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  26.96 
 
 		 502 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  24.7 
 
 		 513 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  30.26 
 
 		 524 aa  164  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2625  carbohydrate kinase, FGGY  29.08 
 
 		 505 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  33.1 
 
 		 472 aa  164  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  24.49 
 
 		 513 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  24.49 
 
 		 513 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  24.5 
 
 		 513 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  24.49 
 
 		 513 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  30.52 
 
 		 499 aa  164  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  24.49 
 
 		 513 aa  163  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  30.31 
 
 		 493 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  27.85 
 
 		 512 aa  163  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  26.33 
 
 		 509 aa  163  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0476  carbohydrate kinase, FGGY  30.96 
 
 		 499 aa  162  9e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  25.3 
 
 		 511 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  25.51 
 
 		 511 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  25.3 
 
 		 511 aa  161  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  24.7 
 
 		 512 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  28.12 
 
 		 512 aa  160  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  24.09 
 
 		 513 aa  160  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>