More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1383 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0469  L-ribulokinase  56.88 
 
 		 562 aa  661    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1383  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 553 aa  1133    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.396144  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1748  L-ribulokinase  52.84 
 
 		 570 aa  630  1e-179  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2398  ribulokinase  43.02 
 
 		 554 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2150  ribulokinase  43.93 
 
 		 561 aa  404  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1239  L-ribulokinase  41.11 
 
 		 544 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.711611  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2028  ribulokinase  43.17 
 
 		 566 aa  397  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0065  ribulokinase  43.04 
 
 		 566 aa  398  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703841  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0114  ribulokinase  42.86 
 
 		 569 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.728567  normal  0.199883 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0065  ribulokinase  42.7 
 
 		 566 aa  395  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.268824  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0114  ribulokinase  42.86 
 
 		 569 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1977  ribulokinase  41.54 
 
 		 557 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489271  normal  0.124359 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1997  ribulokinase  41.54 
 
 		 557 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00226612  unclonable  0.0000285081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2729  ribulokinase  39.64 
 
 		 557 aa  395  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0860748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0067  ribulokinase  42.86 
 
 		 566 aa  396  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0610  ribulokinase  43.01 
 
 		 569 aa  396  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.59168  normal  0.0130922 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00065  ribulokinase  42.49 
 
 		 566 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3536  L-ribulokinase  42.49 
 
 		 566 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0110  ribulokinase  42.67 
 
 		 569 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.407492 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1913  ribulokinase  42.78 
 
 		 563 aa  393  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2328  ribulokinase  42.65 
 
 		 561 aa  393  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.717487  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0068  ribulokinase  42.49 
 
 		 566 aa  393  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.876967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3594  ribulokinase  42.49 
 
 		 566 aa  394  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560965  unclonable  0.0000000207418 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0109  ribulokinase  42.49 
 
 		 569 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.526121 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0772  ribulokinase  43.12 
 
 		 555 aa  395  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000289465  normal  0.0721691 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2064  ribulokinase  41.07 
 
 		 557 aa  392  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000583792  hitchhiker  0.00000400193 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00064  hypothetical protein  42.49 
 
 		 566 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0055  ribulokinase  42.49 
 
 		 566 aa  392  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0107  ribulokinase  42.12 
 
 		 569 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2000  ribulokinase  43.18 
 
 		 567 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1886  ribulokinase  43.18 
 
 		 567 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2068  ribulokinase  41.25 
 
 		 557 aa  388  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000109649  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2260  ribulokinase  42.88 
 
 		 567 aa  385  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2138  ribulokinase  40.33 
 
 		 557 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000886858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2229  ribulokinase  40.21 
 
 		 556 aa  383  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00201608  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2899  ribulokinase  39.37 
 
 		 564 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3994  ribulokinase  41.37 
 
 		 547 aa  383  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.026407  normal  0.515054 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2244  ribulokinase  42.67 
 
 		 561 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000378483 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3201  ribulokinase  41.86 
 
 		 564 aa  376  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.995888 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3662  ribulokinase  39.62 
 
 		 562 aa  366  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1119  ribulokinase  38.28 
 
 		 563 aa  357  2.9999999999999997e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0379  ribulokinase  39.67 
 
 		 577 aa  352  7e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2735  ribulokinase  39.48 
 
 		 564 aa  352  1e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0222  ribulokinase  38.73 
 
 		 585 aa  350  3e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0322  ribulokinase  40.33 
 
 		 529 aa  350  5e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.54265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4715  ribulokinase  42.16 
 
 		 556 aa  343  4e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1861  ribulokinase  40.29 
 
 		 554 aa  342  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2886  L-ribulokinase  40.3 
 
 		 556 aa  332  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0380  ribulokinase  39.93 
 
 		 567 aa  330  6e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.526871  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0749  L-ribulokinase  38.93 
 
 		 572 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06940  L-ribulokinase  37.91 
 
 		 579 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0871  ribulokinase  39.93 
 
 		 564 aa  325  1e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6219  ribulokinase  39.89 
 
 		 551 aa  325  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3274  ribulokinase  38.1 
 
 		 598 aa  300  6e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187785  normal  0.0296673 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2057  carbohydrate kinase FGGY  36.73 
 
 		 517 aa  292  9e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.795187 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0589  ribulokinase  32.62 
 
 		 546 aa  284  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0575  ribulokinase  32.62 
 
 		 546 aa  284  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1927  ribulokinase  31.02 
 
 		 536 aa  224  2e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12881  predicted protein  31.28 
 
 		 438 aa  166  9e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2684  carbohydrate kinase, FGGY  28.09 
 
 		 501 aa  158  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.849942 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  28.35 
 
 		 524 aa  150  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  27.72 
 
 		 497 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02649  L-ribulokinase AraB-like protein  27.11 
 
 		 542 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02610  hypothetical protein  27.11 
 
 		 526 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  34.49 
 
 		 506 aa  134  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  27.66 
 
 		 498 aa  133  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2596  predicted protein  28.35 
 
 		 482 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.283853  normal  0.0118319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  25.62 
 
 		 548 aa  131  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3921  FGGY-family pentulose kinase  26.42 
 
 		 528 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1227  pentulose kinase  27.3 
 
 		 545 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.838114 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0368  pentulose kinase  27.3 
 
 		 545 aa  130  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  25.33 
 
 		 500 aa  130  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0435  FGGY-family pentulose kinase  27.3 
 
 		 545 aa  130  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0847  FGGY-family pentulose kinase  27.96 
 
 		 543 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0389776  normal  0.126532 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3705  D-ribulokinase  26.51 
 
 		 544 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3440  FGGY-family pentulose kinase  26.69 
 
 		 544 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.243574  normal  0.308227 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  26.64 
 
 		 502 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  24.4 
 
 		 506 aa  127  6e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0456  FGGY-family pentulose kinase  26.58 
 
 		 547 aa  127  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.708838  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  28.68 
 
 		 498 aa  126  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  26.47 
 
 		 506 aa  125  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0680  pentulose kinase  28.01 
 
 		 547 aa  125  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  24.08 
 
 		 512 aa  123  8e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  26.47 
 
 		 506 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0269  ribitol kinase  26.36 
 
 		 534 aa  121  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0244  ribitol kinase  26.36 
 
 		 534 aa  121  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3746  FGGY-family pentulose kinase  26.74 
 
 		 527 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3444  FGGY-family pentulose kinase  26.61 
 
 		 527 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  23.44 
 
 		 497 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  27.03 
 
 		 506 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  29.72 
 
 		 510 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  24.63 
 
 		 518 aa  116  7.999999999999999e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4697  FGGY-family pentulose kinase  26.19 
 
 		 545 aa  116  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.921712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3784  FGGY-family pentulose kinase  27.91 
 
 		 529 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0121132  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29860  pentulose/hexulose kinase  32.97 
 
 		 495 aa  115  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  30.6 
 
 		 505 aa  115  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1346  pentulose kinase  27.19 
 
 		 526 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.664914  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  29.53 
 
 		 493 aa  113  9e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0555  ribulokinase  26.12 
 
 		 544 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2625  carbohydrate kinase, FGGY  23.42 
 
 		 505 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>