More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0411 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0411  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  100 
 
 
495 aa  1021    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  43.44 
 
 
486 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  42.01 
 
 
506 aa  409  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  40.46 
 
 
513 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  40.46 
 
 
513 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  40.46 
 
 
513 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  40.04 
 
 
513 aa  364  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  40.04 
 
 
513 aa  364  2e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  40.25 
 
 
513 aa  364  2e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  40.25 
 
 
513 aa  362  6e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  43.15 
 
 
519 aa  362  6e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  40.46 
 
 
512 aa  360  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  40.66 
 
 
512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  39.63 
 
 
513 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  39.26 
 
 
512 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  40.5 
 
 
514 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  39.84 
 
 
512 aa  353  4e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  39.51 
 
 
512 aa  352  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  39.63 
 
 
511 aa  352  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  39.63 
 
 
512 aa  352  1e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  38.6 
 
 
530 aa  349  8e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  38.65 
 
 
512 aa  347  3e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  39.39 
 
 
518 aa  345  8e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  39.3 
 
 
489 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  37.95 
 
 
509 aa  342  1e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  37.53 
 
 
511 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  37.73 
 
 
511 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  37.75 
 
 
509 aa  340  4e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  37.53 
 
 
511 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  37.53 
 
 
511 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  37.08 
 
 
499 aa  337  2.9999999999999997e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3301  carbohydrate kinase FGGY  43.58 
 
 
501 aa  335  9e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  36.84 
 
 
517 aa  333  3e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  36.84 
 
 
517 aa  333  3e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  35.32 
 
 
513 aa  332  1e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  40.42 
 
 
526 aa  317  2e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  40.79 
 
 
524 aa  305  1.0000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2151  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  39.96 
 
 
530 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0347  gluconate kinase  33.12 
 
 
502 aa  290  6e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00095541 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  39.86 
 
 
483 aa  290  6e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.182066  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0477  carbohydrate kinase, FGGY  30.63 
 
 
476 aa  247  4e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0492  carbohydrate kinase FGGY  30.63 
 
 
476 aa  247  4e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11390  pentulose/hexulose kinase  36.16 
 
 
513 aa  245  9.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0344488  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0164  gluconate kinase, C-terminus  40.13 
 
 
333 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0219  carbohydrate kinase FGGY  33.91 
 
 
476 aa  224  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  32.05 
 
 
498 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  29.5 
 
 
492 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  29.5 
 
 
492 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  27.47 
 
 
505 aa  214  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  29.4 
 
 
501 aa  213  9e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  28.78 
 
 
496 aa  212  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  29.1 
 
 
500 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  29.7 
 
 
499 aa  206  1e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  29.7 
 
 
496 aa  203  6e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  32.75 
 
 
499 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  28.68 
 
 
518 aa  202  9.999999999999999e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  28.86 
 
 
497 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  28.46 
 
 
490 aa  200  3.9999999999999996e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  32.2 
 
 
512 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  27.93 
 
 
509 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  29.34 
 
 
511 aa  196  8.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  28.37 
 
 
509 aa  196  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  26.16 
 
 
506 aa  195  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  29.65 
 
 
506 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  28.46 
 
 
503 aa  193  7e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  29.39 
 
 
502 aa  192  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  31.73 
 
 
514 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  26.49 
 
 
500 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  29.87 
 
 
509 aa  189  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  30.38 
 
 
515 aa  189  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  32.89 
 
 
514 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  31.25 
 
 
481 aa  182  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  31.05 
 
 
505 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  28.35 
 
 
499 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  29.33 
 
 
487 aa  181  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  26.69 
 
 
511 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  28.11 
 
 
515 aa  180  5.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1616  carbohydrate kinase, FGGY  30.91 
 
 
510 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0809365  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  30.42 
 
 
501 aa  179  9e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  29.25 
 
 
511 aa  177  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1675  carbohydrate kinase, FGGY  34.06 
 
 
492 aa  177  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432172  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0853  xylulokinase  28.37 
 
 
492 aa  176  6e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985754  normal  0.66346 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  28.25 
 
 
496 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  29.01 
 
 
538 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0196  carbohydrate kinase FGGY  29.13 
 
 
496 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  31.08 
 
 
472 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  27.22 
 
 
489 aa  172  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  31.33 
 
 
508 aa  171  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0416  carbohydrate kinase FGGY  27.8 
 
 
464 aa  171  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  30 
 
 
506 aa  171  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  27.84 
 
 
503 aa  170  7e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3903  cryptic L-xylulose kinase  28.04 
 
 
498 aa  169  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.783257  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  29.88 
 
 
472 aa  169  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  26.27 
 
 
519 aa  169  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3784  cryptic L-xylulose kinase  28.26 
 
 
498 aa  168  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03432  L-xylulose kinase  28.26 
 
 
498 aa  168  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0130  carbohydrate kinase FGGY  28.26 
 
 
498 aa  168  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0134  carbohydrate kinase FGGY  28.26 
 
 
498 aa  168  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  30.84 
 
 
501 aa  168  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  30.53 
 
 
498 aa  168  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>