More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2407 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2407  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 
487 aa  981    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.242819  normal  0.388769 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  30.12 
 
 
501 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  31.08 
 
 
499 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  26.88 
 
 
500 aa  193  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  30.75 
 
 
496 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  28.69 
 
 
500 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  28.4 
 
 
496 aa  187  5e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  29.98 
 
 
509 aa  180  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  30.04 
 
 
488 aa  178  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  30.51 
 
 
504 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  29.71 
 
 
506 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  28.43 
 
 
503 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  30.68 
 
 
548 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  27.65 
 
 
518 aa  172  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  27.49 
 
 
503 aa  170  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  26.61 
 
 
506 aa  169  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  27.89 
 
 
497 aa  167  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  25.56 
 
 
489 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  28.92 
 
 
515 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  26.99 
 
 
502 aa  164  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5229  xylulose kinase  30.97 
 
 
532 aa  163  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  26.97 
 
 
509 aa  163  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  30.38 
 
 
498 aa  161  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  31.05 
 
 
489 aa  160  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  30.58 
 
 
484 aa  160  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  30.94 
 
 
493 aa  160  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  31.1 
 
 
484 aa  160  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  31.17 
 
 
484 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  27.17 
 
 
506 aa  157  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  30.77 
 
 
493 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  28.72 
 
 
512 aa  157  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  31.43 
 
 
484 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  29.88 
 
 
502 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  30.45 
 
 
505 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  31.96 
 
 
492 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  31.96 
 
 
492 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  30.1 
 
 
496 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  26.57 
 
 
506 aa  152  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  29.33 
 
 
494 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  29.66 
 
 
486 aa  152  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  31.75 
 
 
492 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  29.74 
 
 
524 aa  150  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  32.09 
 
 
492 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  30.52 
 
 
484 aa  149  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  32.29 
 
 
492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  30.37 
 
 
485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  27.61 
 
 
509 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  29.13 
 
 
508 aa  148  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  29.9 
 
 
499 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  31.58 
 
 
485 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  30.66 
 
 
506 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  27.59 
 
 
511 aa  148  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  30.61 
 
 
496 aa  147  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3254  carbohydrate kinase FGGY  29.12 
 
 
506 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  28.81 
 
 
497 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  30.52 
 
 
487 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  31.14 
 
 
511 aa  147  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  26.7 
 
 
512 aa  147  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  23.72 
 
 
505 aa  147  6e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  30.72 
 
 
517 aa  146  8.000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  26.15 
 
 
512 aa  145  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  28.54 
 
 
530 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0482  carbohydrate kinase FGGY  31.83 
 
 
474 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.652792  hitchhiker  0.00292056 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  27.54 
 
 
495 aa  145  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  30.36 
 
 
506 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  26.41 
 
 
519 aa  144  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  27.8 
 
 
514 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0864  carbohydrate kinase  29.44 
 
 
474 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  29.96 
 
 
493 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  26.03 
 
 
538 aa  144  3e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  26.99 
 
 
512 aa  144  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0712  putative sugar kinase protein  29.5 
 
 
481 aa  144  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598513  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  29.82 
 
 
493 aa  143  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  30.27 
 
 
517 aa  144  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1173  xylulokinase  30.5 
 
 
486 aa  143  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000934305  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  29.01 
 
 
493 aa  143  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2162  xylulokinase  31.46 
 
 
485 aa  143  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  30.08 
 
 
484 aa  143  9e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  29.19 
 
 
484 aa  142  9e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  29.9 
 
 
484 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3325  carbohydrate kinase FGGY  29.6 
 
 
519 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00841361  normal  0.0106585 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0756  xylulokinase  31.76 
 
 
479 aa  142  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3610  carbohydrate kinase FGGY  30.83 
 
 
509 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  29.55 
 
 
483 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1745  xylulokinase  30.68 
 
 
486 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  28.27 
 
 
484 aa  142  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  29.4 
 
 
484 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0856501 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  29.19 
 
 
484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  29.19 
 
 
484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  30.92 
 
 
491 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  29.35 
 
 
483 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  29.51 
 
 
483 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2478  carbohydrate kinase FGGY  29.36 
 
 
477 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  29.96 
 
 
490 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  29.81 
 
 
487 aa  142  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  29.19 
 
 
484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  29.9 
 
 
484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  29.58 
 
 
493 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  29.19 
 
 
484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  29.96 
 
 
490 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>