More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3506 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3506  autoinducer-2 (AI-2) kinase  100 
 
 		 509 aa  1022    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3151  autoinducer-2 (AI-2) kinase  99.02 
 
 		 509 aa  1014    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.220016 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4318  autoinducer-2 (AI-2) kinase  52.04 
 
 		 516 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4288  autoinducer-2 (AI-2) kinase  52.04 
 
 		 516 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2147  autoinducer-2 (AI-2) kinase  52.22 
 
 		 530 aa  521  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3538  autoinducer-2 (AI-2) kinase  52.02 
 
 		 530 aa  525  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.189864 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2135  carbohydrate kinase FGGY  52.22 
 
 		 530 aa  521  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4470  autoinducer-2 (AI-2) kinase  51.84 
 
 		 516 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4403  autoinducer-2 (AI-2) kinase  51.84 
 
 		 516 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00650936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1712  autoinducer-2 (AI-2) kinase  52.22 
 
 		 530 aa  521  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4400  autoinducer-2 (AI-2) kinase  51.84 
 
 		 516 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1661  autoinducer-2 (AI-2) kinase  52.03 
 
 		 530 aa  520  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.68331 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1593  autoinducer-2 (AI-2) kinase  52.03 
 
 		 530 aa  519  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1382  autoinducer-2 (AI-2) kinase  51.26 
 
 		 521 aa  514  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3648  autoinducer-2 (AI-2) kinase  51.26 
 
 		 530 aa  502  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3017  autoinducer-2 (AI-2) kinase  50.39 
 
 		 520 aa  500  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.232483  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1477  autoinducer-2 (AI-2) kinase  47.59 
 
 		 520 aa  501  1e-140  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0166671  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3518  autoinducer-2 (AI-2) kinase  51.26 
 
 		 530 aa  500  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0855  autoinducer-2 (AI-2) kinase  51.26 
 
 		 530 aa  499  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2124  autoinducer-2 (AI-2) kinase  52.03 
 
 		 530 aa  495  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359272  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0049  autoinducer-2 (AI-2) kinase  49.9 
 
 		 517 aa  495  1e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2261  autoinducer-2 (AI-2) kinase  49.42 
 
 		 520 aa  497  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0868353 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3745  autoinducer-2 (AI-2) kinase  50.29 
 
 		 525 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2698  autoinducer-2 (AI-2) kinase  49.61 
 
 		 522 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2718  autoinducer-2 (AI-2) kinase  49.61 
 
 		 522 aa  489  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2977  autoinducer-2 (AI-2) kinase  49.61 
 
 		 520 aa  491  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000047226 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2774  autoinducer-2 (AI-2) kinase  48.46 
 
 		 520 aa  489  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.235174  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3019  autoinducer-2 (AI-2) kinase  49.23 
 
 		 520 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2981  autoinducer-2 (AI-2) kinase  49.03 
 
 		 520 aa  487  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2768  FGGY family of carbohydrate  51.32 
 
 		 388 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0823721  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  30.5 
 
 		 510 aa  177  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  30.37 
 
 		 538 aa  177  4e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  30.92 
 
 		 509 aa  169  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  26.81 
 
 		 501 aa  162  9e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  27.04 
 
 		 511 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  28.46 
 
 		 518 aa  157  6e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  27.61 
 
 		 500 aa  154  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  26.61 
 
 		 503 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  30.52 
 
 		 548 aa  148  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  31.86 
 
 		 506 aa  147  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  24.4 
 
 		 492 aa  145  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  24.4 
 
 		 492 aa  145  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  27 
 
 		 512 aa  144  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  27.47 
 
 		 519 aa  144  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  29.34 
 
 		 505 aa  144  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  31.65 
 
 		 505 aa  144  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  32.34 
 
 		 498 aa  143  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  28.79 
 
 		 515 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  25.64 
 
 		 509 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  24.1 
 
 		 506 aa  140  6e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  24.17 
 
 		 500 aa  140  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  30.06 
 
 		 505 aa  140  7e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  30.69 
 
 		 504 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  26.32 
 
 		 497 aa  139  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  25.98 
 
 		 512 aa  139  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  28.09 
 
 		 530 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  30.57 
 
 		 506 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  25.62 
 
 		 509 aa  137  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  29.71 
 
 		 512 aa  137  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  26.73 
 
 		 514 aa  136  9e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  29.69 
 
 		 511 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  26.64 
 
 		 497 aa  136  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  29.8 
 
 		 508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  28.02 
 
 		 508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3079  carbohydrate kinase FGGY  29.25 
 
 		 511 aa  135  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  29.43 
 
 		 524 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  25.43 
 
 		 502 aa  134  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  28.82 
 
 		 502 aa  133  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  31.45 
 
 		 501 aa  133  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  27.54 
 
 		 509 aa  133  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24960  putative carbohydrate kinase  27.83 
 
 		 519 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  26.54 
 
 		 514 aa  133  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  30.72 
 
 		 508 aa  130  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  26.52 
 
 		 499 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  25.59 
 
 		 511 aa  128  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  26.8 
 
 		 495 aa  127  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  24.07 
 
 		 486 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  29.7 
 
 		 493 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  29.96 
 
 		 515 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4197  xylulokinase  30.04 
 
 		 515 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  29.96 
 
 		 515 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  29.96 
 
 		 515 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5161  carbohydrate kinase FGGY  29.13 
 
 		 509 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  26.19 
 
 		 514 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3936  carbohydrate kinase FGGY  28.85 
 
 		 493 aa  124  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  29.98 
 
 		 515 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  28.43 
 
 		 498 aa  124  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  24.31 
 
 		 505 aa  124  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  24.49 
 
 		 506 aa  124  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2596  predicted protein  28.26 
 
 		 482 aa  124  4e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.283853  normal  0.0118319 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  25.15 
 
 		 513 aa  124  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  29.59 
 
 		 496 aa  124  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  24.95 
 
 		 513 aa  124  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  25.1 
 
 		 513 aa  124  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  25.15 
 
 		 513 aa  123  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3610  carbohydrate kinase FGGY  29.9 
 
 		 509 aa  123  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  25.15 
 
 		 513 aa  123  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  25.15 
 
 		 513 aa  123  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29860  pentulose/hexulose kinase  29.3 
 
 		 495 aa  123  9e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2134  putative carbohydrate kinase  27.29 
 
 		 520 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>