More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3936 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03432  L-xylulose kinase  63.45 
 
 		 498 aa  649    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0130  carbohydrate kinase FGGY  63.45 
 
 		 498 aa  649    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3903  cryptic L-xylulose kinase  63.04 
 
 		 498 aa  645    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.783257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3936  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 493 aa  1016    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3952  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  63.71 
 
 		 498 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3997  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  63.51 
 
 		 498 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.970359 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4077  cryptic L-xylulose kinase  63.45 
 
 		 498 aa  649    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3784  cryptic L-xylulose kinase  63.45 
 
 		 498 aa  649    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03383  hypothetical protein  63.45 
 
 		 498 aa  649    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0134  carbohydrate kinase FGGY  63.45 
 
 		 498 aa  649    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3892  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  76.21 
 
 		 505 aa  769    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3872  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  63.51 
 
 		 498 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4059  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  63.71 
 
 		 498 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.822702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3888  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  63.09 
 
 		 498 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3695  carbohydrate kinase FGGY  76.47 
 
 		 502 aa  784    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0770  L-xylulose kinase  59.92 
 
 		 484 aa  605  9.999999999999999e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0048654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3270  cryptic L-xylulose kinase  43.23 
 
 		 498 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0932  cryptic L-xylulose kinase  43.23 
 
 		 498 aa  426  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.613284  normal  0.355082 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3403  carbohydrate kinase FGGY  43.23 
 
 		 498 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3079  carbohydrate kinase FGGY  38.15 
 
 		 511 aa  306  6e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3610  carbohydrate kinase FGGY  37.65 
 
 		 509 aa  291  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5161  carbohydrate kinase FGGY  37.32 
 
 		 509 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1194  carbohydrate kinase, FGGY  33.88 
 
 		 503 aa  271  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1803  carbohydrate kinase  31.71 
 
 		 505 aa  270  5e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5317  carbohydrate kinase FGGY  34.15 
 
 		 509 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2917  carbohydrate kinase FGGY  32.61 
 
 		 504 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156588  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  31.31 
 
 		 509 aa  218  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  29.96 
 
 		 515 aa  209  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  29.03 
 
 		 500 aa  209  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  27.42 
 
 		 501 aa  205  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  26.82 
 
 		 492 aa  203  7e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  26.82 
 
 		 492 aa  203  7e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  30.95 
 
 		 512 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  27.02 
 
 		 509 aa  196  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  27.63 
 
 		 496 aa  192  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  27.79 
 
 		 509 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  30.82 
 
 		 509 aa  188  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3325  carbohydrate kinase FGGY  28.35 
 
 		 519 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00841361  normal  0.0106585 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  24.5 
 
 		 500 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  29.08 
 
 		 511 aa  179  7e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  30.3 
 
 		 504 aa  179  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  26.44 
 
 		 502 aa  178  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13300  pentulose/hexulose kinase  29.92 
 
 		 492 aa  176  7e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  27.89 
 
 		 548 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  26.75 
 
 		 515 aa  172  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  26.28 
 
 		 518 aa  172  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  29.78 
 
 		 506 aa  172  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  31.54 
 
 		 499 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1199  carbohydrate kinase FGGY  29.77 
 
 		 503 aa  171  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.535076 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  25.79 
 
 		 538 aa  170  4e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2411  carbohydrate kinase FGGY  29.09 
 
 		 511 aa  170  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  23.71 
 
 		 503 aa  170  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  31.49 
 
 		 487 aa  169  8e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  29.21 
 
 		 498 aa  169  8e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  31.01 
 
 		 505 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  27.2 
 
 		 506 aa  167  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  26.1 
 
 		 499 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  24.85 
 
 		 489 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  25.86 
 
 		 511 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  24.24 
 
 		 496 aa  160  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  28.35 
 
 		 511 aa  160  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  29.64 
 
 		 506 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  28.25 
 
 		 481 aa  160  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  27.71 
 
 		 493 aa  160  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  29.11 
 
 		 512 aa  159  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  24.61 
 
 		 506 aa  159  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  29.23 
 
 		 501 aa  159  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  26.53 
 
 		 530 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  26.53 
 
 		 506 aa  157  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  26.2 
 
 		 486 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  25.5 
 
 		 512 aa  156  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3538  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.03 
 
 		 530 aa  155  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  27.01 
 
 		 503 aa  154  4e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1267  carbohydrate kinase, FGGY  28.23 
 
 		 501 aa  154  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  22.51 
 
 		 506 aa  154  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  28.27 
 
 		 508 aa  153  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  25.15 
 
 		 509 aa  151  3e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  25.05 
 
 		 497 aa  151  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  27.59 
 
 		 495 aa  150  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  28.31 
 
 		 508 aa  150  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2480  carbohydrate kinase FGGY  28.8 
 
 		 489 aa  150  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2147  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.65 
 
 		 530 aa  150  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  24.48 
 
 		 513 aa  149  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  25.11 
 
 		 514 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1661  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.65 
 
 		 530 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.68331 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2135  carbohydrate kinase FGGY  27.45 
 
 		 530 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1712  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.45 
 
 		 530 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  24.89 
 
 		 499 aa  148  3e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  27.63 
 
 		 514 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  29.2 
 
 		 483 aa  146  8.000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  23.54 
 
 		 513 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  23.58 
 
 		 490 aa  146  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1593  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.25 
 
 		 530 aa  145  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  27.82 
 
 		 514 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  25.51 
 
 		 486 aa  144  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  24.27 
 
 		 512 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  24.38 
 
 		 513 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  28.97 
 
 		 484 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  24.17 
 
 		 513 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  24.9 
 
 		 513 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>