More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2480 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2480  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 
489 aa  964    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32110  pentulose/hexulose kinase  45.34 
 
 
484 aa  372  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140246  normal  0.345752 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8242  xylulokinase  47.99 
 
 
468 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.25977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4068  carbohydrate kinase FGGY  45.01 
 
 
482 aa  362  8e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13300  pentulose/hexulose kinase  39.92 
 
 
492 aa  291  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3325  carbohydrate kinase FGGY  33.13 
 
 
519 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00841361  normal  0.0106585 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2016  carbohydrate kinase, FGGY  36.81 
 
 
536 aa  226  6e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3230  putative carbohydrate kinase  34.36 
 
 
526 aa  213  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.366469 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2159  carbohydrate kinase FGGY  35.01 
 
 
525 aa  208  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  32.47 
 
 
530 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  32.33 
 
 
515 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  35.64 
 
 
472 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  32.27 
 
 
514 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2571  carbohydrate kinase, FGGY  33.63 
 
 
520 aa  192  8e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  30.94 
 
 
512 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2911  carbohydrate kinase FGGY  31.98 
 
 
523 aa  183  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106572  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  30.14 
 
 
512 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  30.34 
 
 
511 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  30.34 
 
 
512 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  29.94 
 
 
512 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  27.33 
 
 
490 aa  175  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3079  carbohydrate kinase FGGY  32.89 
 
 
511 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5317  carbohydrate kinase FGGY  33.11 
 
 
509 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5161  carbohydrate kinase FGGY  33.64 
 
 
509 aa  174  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0864  erythritol kinase  31.83 
 
 
517 aa  173  7.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.588929  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  30.28 
 
 
497 aa  170  5e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  27.94 
 
 
492 aa  169  8e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  27.94 
 
 
492 aa  169  8e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5323  carbohydrate kinase FGGY  31.46 
 
 
526 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193294  normal  0.377624 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2917  carbohydrate kinase FGGY  31.53 
 
 
504 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156588  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  28.91 
 
 
512 aa  165  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  36.6 
 
 
492 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3610  carbohydrate kinase FGGY  33.86 
 
 
509 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  32.53 
 
 
484 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  28.51 
 
 
489 aa  163  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3936  carbohydrate kinase FGGY  28.26 
 
 
493 aa  163  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  32.52 
 
 
512 aa  162  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0853  xylulokinase  30.58 
 
 
492 aa  161  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985754  normal  0.66346 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0770  L-xylulose kinase  27.63 
 
 
484 aa  162  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0048654  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  26.63 
 
 
503 aa  162  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  34.38 
 
 
481 aa  161  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3903  cryptic L-xylulose kinase  29.98 
 
 
498 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.783257  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1194  carbohydrate kinase, FGGY  30.84 
 
 
503 aa  160  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0028  xylulokinase  32.8 
 
 
483 aa  160  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.237536  normal  0.287388 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03432  L-xylulose kinase  29.98 
 
 
498 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0130  carbohydrate kinase FGGY  29.98 
 
 
498 aa  159  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3784  cryptic L-xylulose kinase  29.98 
 
 
498 aa  159  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03383  hypothetical protein  29.98 
 
 
498 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  31.85 
 
 
498 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0134  carbohydrate kinase FGGY  29.98 
 
 
498 aa  159  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4077  cryptic L-xylulose kinase  29.77 
 
 
498 aa  158  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  26.77 
 
 
506 aa  158  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  28.96 
 
 
518 aa  158  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  30.74 
 
 
515 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3888  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  30.13 
 
 
498 aa  156  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  32.61 
 
 
487 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  27.77 
 
 
506 aa  155  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  28.35 
 
 
518 aa  155  1e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  32.22 
 
 
509 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  28.07 
 
 
486 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  27.11 
 
 
509 aa  154  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3872  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  29.69 
 
 
498 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  27.34 
 
 
513 aa  154  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  36.36 
 
 
492 aa  154  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  31.75 
 
 
498 aa  154  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  28.66 
 
 
499 aa  154  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  35.92 
 
 
492 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  35.92 
 
 
492 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4059  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  29.46 
 
 
498 aa  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.822702  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  27.61 
 
 
501 aa  153  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3695  carbohydrate kinase FGGY  29.11 
 
 
502 aa  153  8e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  35.92 
 
 
492 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1575  putative sugar kinase protein  35.5 
 
 
478 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0212935  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  31.84 
 
 
510 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  32.07 
 
 
486 aa  152  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  32.82 
 
 
491 aa  152  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3952  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  29.46 
 
 
498 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3997  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  29.91 
 
 
498 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.970359 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  32.43 
 
 
493 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  27.34 
 
 
513 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  27.77 
 
 
506 aa  152  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  33.41 
 
 
478 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  26.95 
 
 
513 aa  151  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  26.95 
 
 
513 aa  151  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  31.03 
 
 
484 aa  151  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  26.95 
 
 
513 aa  151  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  32.86 
 
 
484 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  30.07 
 
 
538 aa  151  3e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  26.95 
 
 
513 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  31.03 
 
 
484 aa  150  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  32.63 
 
 
484 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  32.66 
 
 
493 aa  150  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  31.03 
 
 
484 aa  150  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  34.31 
 
 
472 aa  150  7e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32990  pentulose/hexulose kinase  30.61 
 
 
489 aa  150  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  32.63 
 
 
484 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  26.56 
 
 
513 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1177  xylulose kinase  32.8 
 
 
478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  24.76 
 
 
511 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  32.39 
 
 
484 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>